RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462970.5

PSMD4-208, Transcript of proteasome 26S subunit, non-ATPase 4, human

TSL 5

Gene PSMD4, Length 900 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PSMD4-208	ENST00000462970	SERPINB11	Q96P15	392 aa		10.02	□□□□□ -0.81
PSMD4-208	ENST00000462970	PNKP	Q96T60	521 aa		10.02	□□□□□ -0.81
PSMD4-208	ENST00000462970	AGPAT1	Q99943	283 aa		10.02	□□□□□ -0.81
PSMD4-208	ENST00000462970	C11orf70	Q9BRQ4	267 aa		10.02	□□□□□ -0.81
PSMD4-208	ENST00000462970	POPDC2	Q9HBU9	364 aa		10.02	□□□□□ -0.81
PSMD4-208	ENST00000462970	ARHGEF4	Q9NR80	690 aa		10.02	□□□□□ -0.81
PSMD4-208	ENST00000462970	DNAJC17	Q9NVM6	304 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.81
PSMD4-208	ENST00000462970	DLGAP2	Q9P1A6	1054 aa		10.02	□□□□□ -0.81
PSMD4-208	ENST00000462970	WDR35	Q9P2L0	1181 aa		10.02	□□□□□ -0.81
PSMD4-208	ENST00000462970	AGO1	Q9UL18	857 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.81
PSMD4-208	ENST00000462970	TMCO5B	A8MYB1	307 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PSMD4-208	ENST00000462970	PALM2-AKAP2	B1ALY0	433 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
PSMD4-208	ENST00000462970	GREM1	O60565	184 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PSMD4-208	ENST00000462970	HSF2BP	O75031	334 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PSMD4-208	ENST00000462970	RNF40	O75150	1001 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PSMD4-208	ENST00000462970	TRUB2	O95900	331 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
PSMD4-208	ENST00000462970	APOE	P02649	317 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PSMD4-208	ENST00000462970	FYN	P06241	537 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PSMD4-208	ENST00000462970	CHKA	P35790	457 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PSMD4-208	ENST00000462970	NSF	P46459	744 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
PSMD4-208	ENST00000462970	RPS9	P46781	194 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
PSMD4-208	ENST00000462970	SLC11A2	P49281	568 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PSMD4-208	ENST00000462970	NOMO3	P69849	1222 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PSMD4-208	ENST00000462970	FMO1	Q01740	532 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PSMD4-208	ENST00000462970	SLC6A3	Q01959	620 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PSMD4-208	ENST00000462970	NME3	Q13232	169 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PSMD4-208	ENST00000462970	FZD5	Q13467	585 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PSMD4-208	ENST00000462970	GAB4	Q2WGN9	574 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PSMD4-208	ENST00000462970	C2orf27A	Q580R0	203 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PSMD4-208	ENST00000462970	SMYD5	Q6GMV2	418 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PSMD4-208	ENST00000462970	TSSK4	Q6SA08	328 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PSMD4-208	ENST00000462970	OLFML1	Q6UWY5	402 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PSMD4-208	ENST00000462970	TRIM72	Q6ZMU5	477 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PSMD4-208	ENST00000462970	UNC45B	Q8IWX7	931 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PSMD4-208	ENST00000462970	KIAA1958	Q8N8K9	716 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PSMD4-208	ENST00000462970	DDI1	Q8WTU0	396 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PSMD4-208	ENST00000462970	XPO6	Q96QU8	1125 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
PSMD4-208	ENST00000462970	XPO4	Q9C0E2	1151 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
PSMD4-208	ENST00000462970	CHRD	Q9H2X0	955 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PSMD4-208	ENST00000462970	DDIT4	Q9NX09	232 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PSMD4-208	ENST00000462970	DEC1	Q9P2X7	70 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PSMD4-208	ENST00000462970	GOLGA6L7	A0A1B0GV03	622 aa		10	□□□□□ -0.81
PSMD4-208	ENST00000462970	TBC1D3B	A6NDS4	549 aa		10	□□□□□ -0.81
PSMD4-208	ENST00000462970	TRIM24	O15164	1050 aa		10	□□□□□ -0.81
PSMD4-208	ENST00000462970	HOXC11	O43248	304 aa	Predicted RBP	10	□□□□□ -0.81
PSMD4-208	ENST00000462970	CBFA2T2	O43439	604 aa		10	□□□□□ -0.81
PSMD4-208	ENST00000462970	TULP3	O75386	442 aa		10	□□□□□ -0.81
PSMD4-208	ENST00000462970	DAB1	O75553	588 aa		10	□□□□□ -0.81
PSMD4-208	ENST00000462970	KAT7	O95251	611 aa		10	□□□□□ -0.81
PSMD4-208	ENST00000462970	SKIL	P12757	684 aa		10	□□□□□ -0.81
PSMD4-208	ENST00000462970	GBP1	P32455	592 aa		10	□□□□□ -0.81
PSMD4-208	ENST00000462970	CDH5	P33151	784 aa	Predicted RBP	10	□□□□□ -0.81
PSMD4-208	ENST00000462970	CXCL12	P48061	93 aa		10	□□□□□ -0.81
PSMD4-208	ENST00000462970	SULT1E1	P49888	294 aa		10	□□□□□ -0.81
PSMD4-208	ENST00000462970	NUBP1	P53384	320 aa		10	□□□□□ -0.81
PSMD4-208	ENST00000462970	PITX1	P78337	314 aa	Predicted RBP	10	□□□□□ -0.81
PSMD4-208	ENST00000462970	KLHL30	Q0D2K2	578 aa		10	□□□□□ -0.81
PSMD4-208	ENST00000462970	CCIN	Q13939	588 aa		10	□□□□□ -0.81
PSMD4-208	ENST00000462970	CLEC16A	Q2KHT3	1053 aa		10	□□□□□ -0.81
PSMD4-208	ENST00000462970	ZC3H12A	Q5D1E8	599 aa	Known RBP	10	□□□□□ -0.81
PSMD4-208	ENST00000462970	C10orf76	Q5T2E6	689 aa		10	□□□□□ -0.81
PSMD4-208	ENST00000462970	NUGGC	Q68CJ6	796 aa		10	□□□□□ -0.81
PSMD4-208	ENST00000462970	HEATR6	Q6AI08	1181 aa	Known RBP	10	□□□□□ -0.81
PSMD4-208	ENST00000462970	RFWD3	Q6PCD5	774 aa		10	□□□□□ -0.81
PSMD4-208	ENST00000462970	XYLT1	Q86Y38	959 aa		10	□□□□□ -0.81
PSMD4-208	ENST00000462970	SFTPA1	Q8IWL2	248 aa		10	□□□□□ -0.81
PSMD4-208	ENST00000462970	ZNF687	Q8N1G0	1237 aa		10	□□□□□ -0.81
PSMD4-208	ENST00000462970	CCDC33	Q8N5R6	958 aa		10	□□□□□ -0.81
PSMD4-208	ENST00000462970	ZNF397	Q8NF99	534 aa	Predicted RBP	10	□□□□□ -0.81
PSMD4-208	ENST00000462970	RPLP0P6	Q8NHW5	317 aa		10	□□□□□ -0.81
PSMD4-208	ENST00000462970	BAP1	Q92560	729 aa		10	□□□□□ -0.81
PSMD4-208	ENST00000462970	FCRL2	Q96LA5	508 aa	Predicted RBP	10	□□□□□ -0.81
PSMD4-208	ENST00000462970	PCDHB18P	Q96TA0	734 aa		10	□□□□□ -0.81
PSMD4-208	ENST00000462970	KCNH6	Q9H252	994 aa		10	□□□□□ -0.81
PSMD4-208	ENST00000462970	ZDHHC4	Q9NPG8	344 aa		10	□□□□□ -0.81
PSMD4-208	ENST00000462970	METTL5	Q9NRN9	209 aa	Known RBP	10	□□□□□ -0.81
PSMD4-208	ENST00000462970	ASNSD1	Q9NWL6	643 aa		10	□□□□□ -0.81
PSMD4-208	ENST00000462970	FASTKD2	Q9NYY8	710 aa	Known RBP eCLIP	10	□□□□□ -0.81
PSMD4-208	ENST00000462970	ADAM22	Q9P0K1	906 aa		10	□□□□□ -0.81
PSMD4-208	ENST00000462970	STIM2	Q9P246	746 aa		10	□□□□□ -0.81
PSMD4-208	ENST00000462970	TLR6	Q9Y2C9	796 aa		10	□□□□□ -0.81
PSMD4-208	ENST00000462970		M0QYT0	321 aa		9.99	□□□□□ -0.81
PSMD4-208	ENST00000462970	IRAK2	O43187	625 aa		9.99	□□□□□ -0.81
PSMD4-208	ENST00000462970	ACSL4	O60488	711 aa		9.99	□□□□□ -0.81
PSMD4-208	ENST00000462970	GJB6	O95452	261 aa		9.99	□□□□□ -0.81
PSMD4-208	ENST00000462970	CYP1A1	P04798	512 aa	Predicted RBP	9.99	□□□□□ -0.81
PSMD4-208	ENST00000462970	GLI1	P08151	1106 aa		9.99	□□□□□ -0.81
PSMD4-208	ENST00000462970	TIE1	P35590	1138 aa		9.99	□□□□□ -0.81
PSMD4-208	ENST00000462970	GRIA2	P42262	883 aa		9.99	□□□□□ -0.81
PSMD4-208	ENST00000462970	DGKG	P49619	791 aa		9.99	□□□□□ -0.81
PSMD4-208	ENST00000462970	CCR3	P51677	355 aa		9.99	□□□□□ -0.81
PSMD4-208	ENST00000462970	SATB1	Q01826	763 aa		9.99	□□□□□ -0.81
PSMD4-208	ENST00000462970	RING1	Q06587	406 aa		9.99	□□□□□ -0.81
PSMD4-208	ENST00000462970	MESP2	Q0VG99	397 aa		9.99	□□□□□ -0.81
PSMD4-208	ENST00000462970	PPP2R5D	Q14738	602 aa		9.99	□□□□□ -0.81
PSMD4-208	ENST00000462970	PREPL	Q4J6C6	727 aa	Predicted RBP	9.99	□□□□□ -0.81
PSMD4-208	ENST00000462970	MPPE1	Q53F39	396 aa		9.99	□□□□□ -0.81
PSMD4-208	ENST00000462970	TDRD12	Q587J7	1177 aa	Known RBP	9.99	□□□□□ -0.81
PSMD4-208	ENST00000462970	ADGRF1	Q5T601	910 aa		9.99	□□□□□ -0.81
PSMD4-208	ENST00000462970	EMC10	Q5UCC4	262 aa		9.99	□□□□□ -0.81

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