RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462357.1

IMP4-209, Transcript of IMP4, U3 small nucleolar ribonucleoprotein, humanhuman

TSL 5

Gene IMP4, Length 533 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP4-209ENST00000462357 VPS36Q86VN1 386 aa21.43■■□□□ 1.02
IMP4-209ENST00000462357 KCNV2Q8TDN2 545 aa21.43■■□□□ 1.02
IMP4-209ENST00000462357 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
IMP4-209ENST00000462357 DDI1Q8WTU0 396 aa21.43■■□□□ 1.02
IMP4-209ENST00000462357 CPA5Q8WXQ8 436 aa21.43■■□□□ 1.02
IMP4-209ENST00000462357 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
IMP4-209ENST00000462357 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
IMP4-209ENST00000462357 FAM204AQ9H8W3 233 aa21.43■■□□□ 1.02
IMP4-209ENST00000462357 ARHGEF4Q9NR80 690 aa21.43■■□□□ 1.02
IMP4-209ENST00000462357 IFNKQ9P0W0 207 aa21.43■■□□□ 1.02
IMP4-209ENST00000462357 A0A1W2PQJ5 194 aa21.42■■□□□ 1.02
IMP4-209ENST00000462357 TBC1D3BA6NDS4 549 aa21.42■■□□□ 1.02
IMP4-209ENST00000462357 SHISA7A6NL88 538 aa21.42■■□□□ 1.02
IMP4-209ENST00000462357 GREM1O60565 184 aa21.42■■□□□ 1.02
IMP4-209ENST00000462357 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
IMP4-209ENST00000462357 ERBB2P04626 1255 aa21.42■■□□□ 1.02
IMP4-209ENST00000462357 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
IMP4-209ENST00000462357 CALB1P05937 261 aa21.42■■□□□ 1.02
IMP4-209ENST00000462357 TYRP14679 529 aa21.42■■□□□ 1.02
IMP4-209ENST00000462357 ABCB4P21439 1286 aa21.42■■□□□ 1.02
IMP4-209ENST00000462357 TNFRSF4P43489 277 aa21.42■■□□□ 1.02
IMP4-209ENST00000462357 NOMO3P69849 1222 aa21.42■■□□□ 1.02
IMP4-209ENST00000462357 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
IMP4-209ENST00000462357 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
IMP4-209ENST00000462357 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
IMP4-209ENST00000462357 OLFML1Q6UWY5 402 aa21.42■■□□□ 1.02
IMP4-209ENST00000462357 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa21.42■■□□□ 1.02
IMP4-209ENST00000462357 DEFB106AQ8N104 65 aa21.42■■□□□ 1.02
IMP4-209ENST00000462357 ZNF687Q8N1G0 1237 aa21.42■■□□□ 1.02
IMP4-209ENST00000462357 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa21.42■■□□□ 1.02
IMP4-209ENST00000462357 ACDQ96AP0 544 aa21.42■■□□□ 1.02
IMP4-209ENST00000462357 CHFRQ96EP1 664 aa21.42■■□□□ 1.02
IMP4-209ENST00000462357 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
IMP4-209ENST00000462357 SLC2A13Q96QE2 648 aa21.42■■□□□ 1.02
IMP4-209ENST00000462357 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP21.42■■□□□ 1.02
IMP4-209ENST00000462357 AIPL1Q9NZN9 384 aa21.42■■□□□ 1.02
IMP4-209ENST00000462357 ANKRD62A6NC57 917 aa21.41■■□□□ 1.02
IMP4-209ENST00000462357 KAT7O95251 611 aa21.41■■□□□ 1.02
IMP4-209ENST00000462357 KLKB1P03952 638 aa21.41■■□□□ 1.02
IMP4-209ENST00000462357 CCR1P32246 355 aa21.41■■□□□ 1.02
IMP4-209ENST00000462357 MATKP42679 507 aa21.41■■□□□ 1.02
IMP4-209ENST00000462357 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
IMP4-209ENST00000462357 FMO1Q01740 532 aa21.41■■□□□ 1.02
IMP4-209ENST00000462357 MTAPQ13126 283 aa21.41■■□□□ 1.02
IMP4-209ENST00000462357 FZD5Q13467 585 aa21.41■■□□□ 1.02
IMP4-209ENST00000462357 ZNF528Q3MIS6 628 aa21.41■■□□□ 1.02
IMP4-209ENST00000462357 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
IMP4-209ENST00000462357 GRAMD4Q6IC98 578 aa21.41■■□□□ 1.02
IMP4-209ENST00000462357 FSTL4Q6MZW2 842 aa21.41■■□□□ 1.02
IMP4-209ENST00000462357 ARCQ7LC44 396 aa21.41■■□□□ 1.02
IMP4-209ENST00000462357 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
IMP4-209ENST00000462357 SLC20A1Q8WUM9 679 aa21.41■■□□□ 1.02
IMP4-209ENST00000462357 SLC2A11Q9BYW1 496 aa21.41■■□□□ 1.02
IMP4-209ENST00000462357 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
IMP4-209ENST00000462357 ADAM22Q9P0K1 906 aa21.41■■□□□ 1.02
IMP4-209ENST00000462357 STOML2Q9UJZ1 356 aa21.41■■□□□ 1.02
IMP4-209ENST00000462357 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
IMP4-209ENST00000462357 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa21.4■■□□□ 1.02
IMP4-209ENST00000462357 A0A0A0MRY4 1105 aa21.4■■□□□ 1.02
IMP4-209ENST00000462357 LRRC53A6NM62 1247 aa21.4■■□□□ 1.02
IMP4-209ENST00000462357 MSI1O43347 362 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
IMP4-209ENST00000462357 DAB1O75553 588 aa21.4■■□□□ 1.02
IMP4-209ENST00000462357 FYNP06241 537 aa21.4■■□□□ 1.02
IMP4-209ENST00000462357 MMP8P22894 467 aa21.4■■□□□ 1.02
IMP4-209ENST00000462357 OPRD1P41143 372 aa21.4■■□□□ 1.02
IMP4-209ENST00000462357 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
IMP4-209ENST00000462357 KLHL30Q0D2K2 578 aa21.4■■□□□ 1.02
IMP4-209ENST00000462357 TRIM14Q14142 442 aa21.4■■□□□ 1.02
IMP4-209ENST00000462357 SYPL2Q5VXT5 272 aa21.4■■□□□ 1.02
IMP4-209ENST00000462357 NAT16Q8N8M0 369 aa21.4■■□□□ 1.02
IMP4-209ENST00000462357 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
IMP4-209ENST00000462357 WBP2Q969T9 261 aa21.4■■□□□ 1.02
IMP4-209ENST00000462357 BTN2A3PQ96KV6 586 aa21.4■■□□□ 1.02
IMP4-209ENST00000462357 DDIT4Q9NX09 232 aa21.4■■□□□ 1.02
IMP4-209ENST00000462357 TJP2Q9UDY2 1190 aa21.4■■□□□ 1.02
IMP4-209ENST00000462357 SLC8A2Q9UPR5 921 aa21.4■■□□□ 1.02
IMP4-209ENST00000462357 MYO16Q9Y6X6 1858 aa21.39■■□□□ 1.02
IMP4-209ENST00000462357 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa21.39■■□□□ 1.01
IMP4-209ENST00000462357 H0Y858 1186 aa21.39■■□□□ 1.01
IMP4-209ENST00000462357 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
IMP4-209ENST00000462357 CACNG3O60359 315 aa21.39■■□□□ 1.01
IMP4-209ENST00000462357 ACSL4O60488 711 aa21.39■■□□□ 1.01
IMP4-209ENST00000462357 TULP3O75386 442 aa21.39■■□□□ 1.01
IMP4-209ENST00000462357 EGFP01133 1207 aa21.39■■□□□ 1.01
IMP4-209ENST00000462357 IGLV3-27P01718 113 aa21.39■■□□□ 1.01
IMP4-209ENST00000462357 DGKGP49619 791 aa21.39■■□□□ 1.01
IMP4-209ENST00000462357 ZBED6P86452 979 aa21.39■■□□□ 1.01
IMP4-209ENST00000462357 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa21.39■■□□□ 1.01
IMP4-209ENST00000462357 MPP7Q5T2T1 576 aa21.39■■□□□ 1.01
IMP4-209ENST00000462357 SDE2Q6IQ49 451 aa21.39■■□□□ 1.01
IMP4-209ENST00000462357 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa21.39■■□□□ 1.01
IMP4-209ENST00000462357 XYLT1Q86Y38 959 aa21.39■■□□□ 1.01
IMP4-209ENST00000462357 RNF214Q8ND24 703 aa21.39■■□□□ 1.01
IMP4-209ENST00000462357 BAP1Q92560 729 aa21.39■■□□□ 1.01
IMP4-209ENST00000462357 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
IMP4-209ENST00000462357 ITIH6Q6UXX5 1313 aa21.38■■□□□ 1.01
IMP4-209ENST00000462357 RNF40O75150 1001 aa21.38■■□□□ 1.01
IMP4-209ENST00000462357 GRAP2O75791 330 aa21.38■■□□□ 1.01
IMP4-209ENST00000462357 UNGP13051 313 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
IMP4-209ENST00000462357 CHRNB2P17787 502 aa21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.4 ms