RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461648.2

TSC2-208, Transcript of TSC complex subunit 2, humanhuman

TSL 2

Gene TSC2, Length 1,071 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSC2-208ENST00000461648 PTPN9P43378 593 aa26.54■■□□□ 1.84
TSC2-208ENST00000461648 HARS2P49590 506 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
TSC2-208ENST00000461648 NME3Q13232 169 aa26.54■■□□□ 1.84
TSC2-208ENST00000461648 PDGFRLQ15198 375 aa26.54■■□□□ 1.84
TSC2-208ENST00000461648 C10orf76Q5T2E6 689 aa26.54■■□□□ 1.84
TSC2-208ENST00000461648 NUGGCQ68CJ6 796 aa26.54■■□□□ 1.84
TSC2-208ENST00000461648 RAD9BQ6WBX8 426 aa26.54■■□□□ 1.84
TSC2-208ENST00000461648 Q6ZNB5 142 aa26.54■■□□□ 1.84
TSC2-208ENST00000461648 BBS7Q8IWZ6 715 aa26.54■■□□□ 1.84
TSC2-208ENST00000461648 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
TSC2-208ENST00000461648 IRF7Q92985 503 aa26.54■■□□□ 1.84
TSC2-208ENST00000461648 ARHGEF26Q96DR7 871 aa26.54■■□□□ 1.84
TSC2-208ENST00000461648 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
TSC2-208ENST00000461648 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
TSC2-208ENST00000461648 ADAM33Q9BZ11 813 aa26.54■■□□□ 1.84
TSC2-208ENST00000461648 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa26.54■■□□□ 1.84
TSC2-208ENST00000461648 COX16Q9P0S2 106 aa26.54■■□□□ 1.84
TSC2-208ENST00000461648 ZNF510Q9Y2H8 683 aa26.54■■□□□ 1.84
TSC2-208ENST00000461648 NDUFA10O95299 355 aa26.53■■□□□ 1.84
TSC2-208ENST00000461648 TMEM253P0C7T8 217 aa26.53■■□□□ 1.84
TSC2-208ENST00000461648 SPA17Q15506 151 aa26.53■■□□□ 1.84
TSC2-208ENST00000461648 CCDC14Q49A88 953 aa26.53■■□□□ 1.84
TSC2-208ENST00000461648 UNC45BQ8IWX7 931 aa26.53■■□□□ 1.84
TSC2-208ENST00000461648 LINC00597Q9H2U6 94 aa26.53■■□□□ 1.84
TSC2-208ENST00000461648 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa26.53■■□□□ 1.84
TSC2-208ENST00000461648 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa26.53■■□□□ 1.84
TSC2-208ENST00000461648 TMEM191CA6NGB0 347 aa26.52■■□□□ 1.84
TSC2-208ENST00000461648 ARNTLO00327 626 aa26.52■■□□□ 1.84
TSC2-208ENST00000461648 F9P00740 461 aa26.52■■□□□ 1.84
TSC2-208ENST00000461648 MAGEA1P43355 309 aa26.52■■□□□ 1.84
TSC2-208ENST00000461648 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP26.52■■□□□ 1.84
TSC2-208ENST00000461648 ATP11AP98196 1134 aa26.52■■□□□ 1.84
TSC2-208ENST00000461648 DEUP1Q05D60 604 aa26.52■■□□□ 1.84
TSC2-208ENST00000461648 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP26.52■■□□□ 1.84
TSC2-208ENST00000461648 EML3Q32P44 896 aa26.52■■□□□ 1.84
TSC2-208ENST00000461648 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
TSC2-208ENST00000461648 TRIM68Q6AZZ1 485 aa26.52■■□□□ 1.84
TSC2-208ENST00000461648 BNIPLQ7Z465 357 aa26.52■■□□□ 1.84
TSC2-208ENST00000461648 DENND1CQ8IV53 801 aa26.52■■□□□ 1.84
TSC2-208ENST00000461648 UBALD2Q8IYN6 164 aa26.52■■□□□ 1.84
TSC2-208ENST00000461648 OTUB2Q96DC9 234 aa26.52■■□□□ 1.84
TSC2-208ENST00000461648 TMEM51Q9NW97 253 aa26.52■■□□□ 1.84
TSC2-208ENST00000461648 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP26.52■■□□□ 1.84
TSC2-208ENST00000461648 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
TSC2-208ENST00000461648 INTUQ9ULD6 942 aa26.52■■□□□ 1.84
TSC2-208ENST00000461648 APOEP02649 317 aa26.51■■□□□ 1.83
TSC2-208ENST00000461648 ARSAP15289 507 aa26.51■■□□□ 1.83
TSC2-208ENST00000461648 RDXP35241 583 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
TSC2-208ENST00000461648 PFKPQ01813 784 aa26.51■■□□□ 1.83
TSC2-208ENST00000461648 OGDHQ02218 1023 aa26.51■■□□□ 1.83
TSC2-208ENST00000461648 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP26.51■■□□□ 1.83
TSC2-208ENST00000461648 DNASE1L2Q92874 299 aa26.51■■□□□ 1.83
TSC2-208ENST00000461648 ATP2A3Q93084 1043 aa26.51■■□□□ 1.83
TSC2-208ENST00000461648 RNF34Q969K3 372 aa26.51■■□□□ 1.83
TSC2-208ENST00000461648 NUP85Q9BW27 656 aa26.51■■□□□ 1.83
TSC2-208ENST00000461648 EBF3Q9H4W6 596 aa26.51■■□□□ 1.83
TSC2-208ENST00000461648 TRPV5Q9NQA5 729 aa26.51■■□□□ 1.83
TSC2-208ENST00000461648 HPS4Q9NQG7 708 aa26.51■■□□□ 1.83
TSC2-208ENST00000461648 PIGVQ9NUD9 493 aa26.51■■□□□ 1.83
TSC2-208ENST00000461648 COL4A2P08572 1712 aa26.51■■□□□ 1.83
TSC2-208ENST00000461648 CCP110O43303 1012 aa26.5■■□□□ 1.83
TSC2-208ENST00000461648 ENDOD1O94919 500 aa26.5■■□□□ 1.83
TSC2-208ENST00000461648 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
TSC2-208ENST00000461648 LATS1O95835 1130 aa26.5■■□□□ 1.83
TSC2-208ENST00000461648 SLC2A3P11169 496 aa26.5■■□□□ 1.83
TSC2-208ENST00000461648 CCR1P32246 355 aa26.5■■□□□ 1.83
TSC2-208ENST00000461648 CXCR3P49682 368 aa26.5■■□□□ 1.83
TSC2-208ENST00000461648 TNK2Q07912 1038 aa26.5■■□□□ 1.83
TSC2-208ENST00000461648 PPP2R5DQ14738 602 aa26.5■■□□□ 1.83
TSC2-208ENST00000461648 CDO1Q16878 200 aa26.5■■□□□ 1.83
TSC2-208ENST00000461648 STRADAQ7RTN6 431 aa26.5■■□□□ 1.83
TSC2-208ENST00000461648 LRRC8AQ8IWT6 810 aa26.5■■□□□ 1.83
TSC2-208ENST00000461648 CCDC112Q8NEF3 446 aa26.5■■□□□ 1.83
TSC2-208ENST00000461648 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa26.5■■□□□ 1.83
TSC2-208ENST00000461648 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP26.5■■□□□ 1.83
TSC2-208ENST00000461648 PDLIM2Q96JY6 352 aa26.5■■□□□ 1.83
TSC2-208ENST00000461648 CNPY3Q9BT09 278 aa26.5■■□□□ 1.83
TSC2-208ENST00000461648 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
TSC2-208ENST00000461648 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa26.5■■□□□ 1.83
TSC2-208ENST00000461648 NFATC1O95644 943 aa26.49■■□□□ 1.83
TSC2-208ENST00000461648 DESP17661 470 aa26.49■■□□□ 1.83
TSC2-208ENST00000461648 RUNX3Q13761 415 aa26.49■■□□□ 1.83
TSC2-208ENST00000461648 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa26.49■■□□□ 1.83
TSC2-208ENST00000461648 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa26.49■■□□□ 1.83
TSC2-208ENST00000461648 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa26.49■■□□□ 1.83
TSC2-208ENST00000461648 FNIP1Q8TF40 1166 aa26.49■■□□□ 1.83
TSC2-208ENST00000461648 FAM172AQ8WUF8 416 aa26.49■■□□□ 1.83
TSC2-208ENST00000461648 AZIN2Q96A70 460 aa26.49■■□□□ 1.83
TSC2-208ENST00000461648 TRIM7Q9C029 511 aa26.49■■□□□ 1.83
TSC2-208ENST00000461648 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa26.49■■□□□ 1.83
TSC2-208ENST00000461648 UVRAGQ9P2Y5 699 aa26.49■■□□□ 1.83
TSC2-208ENST00000461648 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa26.49■■□□□ 1.83
TSC2-208ENST00000461648 KCNU1A8MYU2 1149 aa26.48■■□□□ 1.83
TSC2-208ENST00000461648 ACSL4O60488 711 aa26.48■■□□□ 1.83
TSC2-208ENST00000461648 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP26.48■■□□□ 1.83
TSC2-208ENST00000461648 PSMA2P25787 234 aa26.48■■□□□ 1.83
TSC2-208ENST00000461648 SLC11A2P49281 568 aa26.48■■□□□ 1.83
TSC2-208ENST00000461648 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP26.48■■□□□ 1.83
TSC2-208ENST00000461648 ZXDAP98168 799 aa26.48■■□□□ 1.83
TSC2-208ENST00000461648 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.3 ms