RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449186.2

RPRD1B-202, Transcript of regulation of nuclear pre-mRNA domain containing 1B, humanhuman

TSL 4

Gene RPRD1B, Length 591 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD1B-202ENST00000449186 NME3Q13232 169 aa11.47□□□□□ -0.57
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RPRD1B-202ENST00000449186 DHCR24Q15392 516 aa11.47□□□□□ -0.57
RPRD1B-202ENST00000449186 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP11.47□□□□□ -0.57
RPRD1B-202ENST00000449186 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP11.47□□□□□ -0.57
RPRD1B-202ENST00000449186 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa11.47□□□□□ -0.57
RPRD1B-202ENST00000449186 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa11.47□□□□□ -0.57
RPRD1B-202ENST00000449186 NAT16Q8N8M0 369 aa11.47□□□□□ -0.57
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RPRD1B-202ENST00000449186 PON2Q15165 354 aa11.46□□□□□ -0.57
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RPRD1B-202ENST00000449186 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP11.46□□□□□ -0.57
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RPRD1B-202ENST00000449186 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.57
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RPRD1B-202ENST00000449186 NT5C3BQ969T7 300 aa11.45□□□□□ -0.58
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RPRD1B-202ENST00000449186 ANP32EQ9BTT0 268 aa11.45□□□□□ -0.58
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RPRD1B-202ENST00000449186 THAP2Q9H0W7 228 aa11.45□□□□□ -0.58
RPRD1B-202ENST00000449186 ISCUQ9H1K1 167 aa11.45□□□□□ -0.58
RPRD1B-202ENST00000449186 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP11.45□□□□□ -0.58
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