RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000430766.1

PTPRD-AS1-201, PTPRD antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRD-AS1, Length 1,959 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 USP20Q9Y2K6 914 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 LOXL2Q9Y4K0 774 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TLN2Q9Y4G6 2542 aa9.09□□□□□ -0.96
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 LRRIQ4A6NIV6 560 aa9.08□□□□□ -0.96
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 K7ESM1 405 aa9.08□□□□□ -0.96
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP9.08□□□□□ -0.96
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PIAS2O75928 621 aa9.08□□□□□ -0.96
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PRKAR1AP10644 381 aa9.08□□□□□ -0.96
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ODC1P11926 461 aa9.08□□□□□ -0.96
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ITIH1P19827 911 aa9.08□□□□□ -0.96
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PRKCHP24723 683 aa9.08□□□□□ -0.96
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 DGKGP49619 791 aa9.08□□□□□ -0.96
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CCR5P51681 352 aa9.08□□□□□ -0.96
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP9.08□□□□□ -0.96
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP9.08□□□□□ -0.96
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 KCNJ12Q14500 433 aa9.08□□□□□ -0.96
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 E2F5Q15329 346 aa9.08□□□□□ -0.96
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 DDR2Q16832 855 aa9.08□□□□□ -0.96
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 NADK2Q4G0N4 442 aa9.08□□□□□ -0.96
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 Q71RC1 249 aaPredicted RBP9.08□□□□□ -0.96
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 AHI1Q8N157 1196 aa9.08□□□□□ -0.96
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa9.08□□□□□ -0.96
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ZNF281Q9Y2X9 895 aa9.08□□□□□ -0.96
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 KCTD3Q9Y597 815 aa9.08□□□□□ -0.96
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 KCNMB2Q9Y691 235 aa9.08□□□□□ -0.96
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CASC3O15234 703 aaKnown RBP9.08□□□□□ -0.96
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CYP11A1P05108 521 aa9.08□□□□□ -0.96
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CCKBRP32239 447 aa9.08□□□□□ -0.96
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 GALCP54803 685 aa9.08□□□□□ -0.96
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP9.08□□□□□ -0.96
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PERM1Q5SV97 790 aa9.08□□□□□ -0.96
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa9.08□□□□□ -0.96
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP9.08□□□□□ -0.96
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TICAM2Q86XR7 235 aa9.08□□□□□ -0.96
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ZNF654Q8IZM8 581 aa9.08□□□□□ -0.96
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 IL22RA1Q8N6P7 574 aa9.08□□□□□ -0.96
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CCDC113Q9H0I3 377 aa9.08□□□□□ -0.96
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CHST11Q9NPF2 352 aa9.08□□□□□ -0.96
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 COPG2Q9UBF2 871 aa9.08□□□□□ -0.96
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP9.08□□□□□ -0.96
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SNX14Q9Y5W7 946 aa9.08□□□□□ -0.96
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ANKUB1A6NFN9 424 aa9.07□□□□□ -0.96
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 NEMP2A6NFY4 417 aa9.07□□□□□ -0.96
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 FAM47DPA6NHR8 397 aa9.07□□□□□ -0.96
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ADAMTS3O15072 1205 aa9.07□□□□□ -0.96
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SCAMP1O15126 338 aa9.07□□□□□ -0.96
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 KCNAB3O43448 404 aa9.07□□□□□ -0.96
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ZG16O60844 167 aa9.07□□□□□ -0.96
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 DNTTP04053 509 aa9.07□□□□□ -0.96
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 EPHX1P07099 455 aa9.07□□□□□ -0.96
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TYRP14679 529 aa9.07□□□□□ -0.96
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ETV5P41161 510 aa9.07□□□□□ -0.96
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP9.07□□□□□ -0.96
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 RPS14P62263 151 aaKnown RBP9.07□□□□□ -0.96
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ZNF234Q14588 700 aa9.07□□□□□ -0.96
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 NCEH1Q6PIU2 408 aa9.07□□□□□ -0.96
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 EXOC6Q8TAG9 804 aa9.07□□□□□ -0.96
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 UCMAQ8WVF2 138 aa9.07□□□□□ -0.96
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TMEM159Q96B96 161 aa9.07□□□□□ -0.96
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 C14orf79Q96F83 325 aa9.07□□□□□ -0.96
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 NACC1Q96RE7 527 aa9.07□□□□□ -0.96
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP9.07□□□□□ -0.96
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 C2orf40Q9H1Z8 148 aa9.07□□□□□ -0.96
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MARK1Q9P0L2 795 aa9.07□□□□□ -0.96
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa9.07□□□□□ -0.96
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa9.06□□□□□ -0.96
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 hCG_1984214I3L0E3 225 aa9.06□□□□□ -0.96
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 HIP1O00291 1037 aa9.06□□□□□ -0.96
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 EDIL3O43854 480 aa9.06□□□□□ -0.96
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PPP6R2O75170 966 aa9.06□□□□□ -0.96
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 DGAT1O75907 488 aa9.06□□□□□ -0.96
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP9.06□□□□□ -0.96
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP9.06□□□□□ -0.96
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 USP30Q70CQ3 517 aa9.06□□□□□ -0.96
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 BBS7Q8IWZ6 715 aa9.06□□□□□ -0.96
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP9.06□□□□□ -0.96
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 EVI5LQ96CN4 794 aa9.06□□□□□ -0.96
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 HVCN1Q96D96 273 aa9.06□□□□□ -0.96
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 FBRSQ9HAH7 460 aa9.06□□□□□ -0.96
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 KLHL11Q9NVR0 708 aa9.06□□□□□ -0.96
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa9.06□□□□□ -0.96
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 WDR35Q9P2L0 1181 aa9.06□□□□□ -0.96
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PTPRJQ12913 1337 aa9.06□□□□□ -0.96
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 EML1O00423 815 aa9.06□□□□□ -0.96
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 OAS1P00973 400 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 YBX1P67809 324 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PPP4R3AQ6IN85 833 aa9.06□□□□□ -0.96
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CCDC136Q96JN2 1154 aa9.06□□□□□ -0.96
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SENP8Q96LD8 212 aa9.06□□□□□ -0.96
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 BBS2Q9BXC9 721 aa9.06□□□□□ -0.96
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 FBXO10Q9UK96 956 aa9.06□□□□□ -0.96
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa9.06□□□□□ -0.96
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 VPS13CQ709C8 3753 aa9.06□□□□□ -0.96
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 LRRC72A6NJI9 287 aa9.05□□□□□ -0.96
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 RNF212BA8MTL3 300 aa9.05□□□□□ -0.96
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ITGB3P05106 788 aa9.05□□□□□ -0.96
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 COPB1P53618 953 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 OSTNP61366 133 aa9.05□□□□□ -0.96
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa9.05□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.3 ms