RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000430287.1

USP9YP16-201, Transcript of USP9Y pseudogene 16, humanhuman

BASIC

Gene USP9YP16, Length 407 nt, Biotype unprocessed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9YP16-201ENST00000430287 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP2.77□□□□□ -1.97
USP9YP16-201ENST00000430287 PNPLA1Q8N8W4 532 aa2.77□□□□□ -1.97
USP9YP16-201ENST00000430287 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP2.77□□□□□ -1.97
USP9YP16-201ENST00000430287 IGFBPL1Q8WX77 278 aa2.77□□□□□ -1.97
USP9YP16-201ENST00000430287 MAP4K1Q92918 833 aa2.77□□□□□ -1.97
USP9YP16-201ENST00000430287 FAM227BQ96M60 508 aa2.77□□□□□ -1.97
USP9YP16-201ENST00000430287 HPSEQ9Y251 543 aa2.77□□□□□ -1.97
USP9YP16-201ENST00000430287 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa2.77□□□□□ -1.97
USP9YP16-201ENST00000430287 A0A087WYN8 130 aa2.76□□□□□ -1.97
USP9YP16-201ENST00000430287 RNF8O76064 485 aa2.76□□□□□ -1.97
USP9YP16-201ENST00000430287 SLC5A1P13866 664 aa2.76□□□□□ -1.97
USP9YP16-201ENST00000430287 TSHRP16473 764 aa2.76□□□□□ -1.97
USP9YP16-201ENST00000430287 PIK3CBP42338 1070 aa2.76□□□□□ -1.97
USP9YP16-201ENST00000430287 CASP5P51878 434 aa2.76□□□□□ -1.97
USP9YP16-201ENST00000430287 COPB1P53618 953 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
USP9YP16-201ENST00000430287 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
USP9YP16-201ENST00000430287 GPC5P78333 572 aa2.76□□□□□ -1.97
USP9YP16-201ENST00000430287 DEUP1Q05D60 604 aa2.76□□□□□ -1.97
USP9YP16-201ENST00000430287 ZNF543Q08ER8 600 aa2.76□□□□□ -1.97
USP9YP16-201ENST00000430287 MTAPQ13126 283 aa2.76□□□□□ -1.97
USP9YP16-201ENST00000430287 KCNB1Q14721 858 aa2.76□□□□□ -1.97
USP9YP16-201ENST00000430287 SEC23BQ15437 767 aa2.76□□□□□ -1.97
USP9YP16-201ENST00000430287 AWAT1Q58HT5 328 aa2.76□□□□□ -1.97
USP9YP16-201ENST00000430287 ANO7Q6IWH7 933 aa2.76□□□□□ -1.97
USP9YP16-201ENST00000430287 TMEM65Q6PI78 240 aa2.76□□□□□ -1.97
USP9YP16-201ENST00000430287 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP2.76□□□□□ -1.97
USP9YP16-201ENST00000430287 RNF152Q8N8N0 203 aa2.76□□□□□ -1.97
USP9YP16-201ENST00000430287 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP2.76□□□□□ -1.97
USP9YP16-201ENST00000430287 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa2.76□□□□□ -1.97
USP9YP16-201ENST00000430287 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP2.76□□□□□ -1.97
USP9YP16-201ENST00000430287 IQCDQ96DY2 449 aa2.76□□□□□ -1.97
USP9YP16-201ENST00000430287 HIC2Q96JB3 615 aa2.76□□□□□ -1.97
USP9YP16-201ENST00000430287 LMLNQ96KR4 655 aa2.76□□□□□ -1.97
USP9YP16-201ENST00000430287 CCDC17Q96LX7 622 aa2.76□□□□□ -1.97
USP9YP16-201ENST00000430287 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa2.76□□□□□ -1.97
USP9YP16-201ENST00000430287 APOL5Q9BWW9 433 aa2.76□□□□□ -1.97
USP9YP16-201ENST00000430287 MLXIPQ9HAP2 919 aa2.76□□□□□ -1.97
USP9YP16-201ENST00000430287 AS3MTQ9HBK9 375 aa2.76□□□□□ -1.97
USP9YP16-201ENST00000430287 PNPLA8Q9NP80 782 aa2.76□□□□□ -1.97
USP9YP16-201ENST00000430287 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP2.76□□□□□ -1.97
USP9YP16-201ENST00000430287 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa2.76□□□□□ -1.97
USP9YP16-201ENST00000430287 TMEM184CQ9NVA4 438 aa2.76□□□□□ -1.97
USP9YP16-201ENST00000430287 MGAT4CQ9UBM8 478 aa2.76□□□□□ -1.97
USP9YP16-201ENST00000430287 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP2.76□□□□□ -1.97
USP9YP16-201ENST00000430287 ASAP1Q9ULH1 1129 aa2.76□□□□□ -1.97
USP9YP16-201ENST00000430287 CORO2BQ9UQ03 480 aa2.76□□□□□ -1.97
USP9YP16-201ENST00000430287 EVPLQ92817 2033 aa2.76□□□□□ -1.97
USP9YP16-201ENST00000430287 A0A1W2PPC4 97 aa2.75□□□□□ -1.97
USP9YP16-201ENST00000430287 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
USP9YP16-201ENST00000430287 RHPN2P1A8MT19 583 aa2.75□□□□□ -1.97
USP9YP16-201ENST00000430287 THAP12O43422 761 aa2.75□□□□□ -1.97
USP9YP16-201ENST00000430287 KCNQ3O43525 872 aa2.75□□□□□ -1.97
USP9YP16-201ENST00000430287 SNX2O60749 519 aa2.75□□□□□ -1.97
USP9YP16-201ENST00000430287 PRAMEF2O60811 474 aa2.75□□□□□ -1.97
USP9YP16-201ENST00000430287 CBFA2T3O75081 653 aa2.75□□□□□ -1.97
USP9YP16-201ENST00000430287 WDR47O94967 919 aa2.75□□□□□ -1.97
USP9YP16-201ENST00000430287 ARP10275 920 aa2.75□□□□□ -1.97
USP9YP16-201ENST00000430287 SLC5A2P31639 672 aa2.75□□□□□ -1.97
USP9YP16-201ENST00000430287 RPS13P62277 151 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
USP9YP16-201ENST00000430287 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
USP9YP16-201ENST00000430287 ZNF91Q05481 1191 aa2.75□□□□□ -1.97
USP9YP16-201ENST00000430287 ACOX1Q15067 660 aa2.75□□□□□ -1.97
USP9YP16-201ENST00000430287 TMTC4Q5T4D3 741 aa2.75□□□□□ -1.97
USP9YP16-201ENST00000430287 BSPRYQ5W0U4 402 aa2.75□□□□□ -1.97
USP9YP16-201ENST00000430287 GRHL2Q6ISB3 625 aa2.75□□□□□ -1.97
USP9YP16-201ENST00000430287 VSTM1Q6UX27 236 aa2.75□□□□□ -1.97
USP9YP16-201ENST00000430287 CLEC9AQ6UXN8 241 aa2.75□□□□□ -1.97
USP9YP16-201ENST00000430287 RNF44Q7L0R7 432 aa2.75□□□□□ -1.97
USP9YP16-201ENST00000430287 NR2C2APQ86WQ0 139 aa2.75□□□□□ -1.97
USP9YP16-201ENST00000430287 MMP21Q8N119 569 aa2.75□□□□□ -1.97
USP9YP16-201ENST00000430287 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
USP9YP16-201ENST00000430287 C11orf44Q8N8P7 122 aa2.75□□□□□ -1.97
USP9YP16-201ENST00000430287 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
USP9YP16-201ENST00000430287 WBP2Q969T9 261 aa2.75□□□□□ -1.97
USP9YP16-201ENST00000430287 HS6ST2Q96MM7 605 aa2.75□□□□□ -1.97
USP9YP16-201ENST00000430287 WDR24Q96S15 920 aa2.75□□□□□ -1.97
USP9YP16-201ENST00000430287 TMEM204Q9BSN7 226 aa2.75□□□□□ -1.97
USP9YP16-201ENST00000430287 COLEC11Q9BWP8 271 aa2.75□□□□□ -1.97
USP9YP16-201ENST00000430287 SLC25A32Q9H2D1 315 aa2.75□□□□□ -1.97
USP9YP16-201ENST00000430287 SEMA5BQ9P283 1151 aa2.75□□□□□ -1.97
USP9YP16-201ENST00000430287 FZD4Q9ULV1 537 aa2.75□□□□□ -1.97
USP9YP16-201ENST00000430287 SNX13Q9Y5W8 968 aa2.75□□□□□ -1.97
USP9YP16-201ENST00000430287 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa2.74□□□□□ -1.97
USP9YP16-201ENST00000430287 ACOT8O14734 319 aa2.74□□□□□ -1.97
USP9YP16-201ENST00000430287 AREL1O15033 823 aa2.74□□□□□ -1.97
USP9YP16-201ENST00000430287 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
USP9YP16-201ENST00000430287 PARNO95453 639 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
USP9YP16-201ENST00000430287 MBPP02686 304 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
USP9YP16-201ENST00000430287 TMEM225BP0DP42 221 aa2.74□□□□□ -1.97
USP9YP16-201ENST00000430287 FGFR2P21802 821 aa2.74□□□□□ -1.97
USP9YP16-201ENST00000430287 MST1P26927 711 aa2.74□□□□□ -1.97
USP9YP16-201ENST00000430287 KRTAP10-8P60410 259 aa2.74□□□□□ -1.97
USP9YP16-201ENST00000430287 SLC14A1Q13336 389 aa2.74□□□□□ -1.97
USP9YP16-201ENST00000430287 MFSD13AQ14CX5 517 aa2.74□□□□□ -1.97
USP9YP16-201ENST00000430287 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa2.74□□□□□ -1.97
USP9YP16-201ENST00000430287 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
USP9YP16-201ENST00000430287 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa2.74□□□□□ -1.97
USP9YP16-201ENST00000430287 USP17L6PQ6QN14 398 aa2.74□□□□□ -1.97
USP9YP16-201ENST00000430287 RANBP10Q6VN20 620 aa2.74□□□□□ -1.97
USP9YP16-201ENST00000430287 COLCA1Q6ZS62 124 aa2.74□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 79 ms