RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429798.1

LIMD1-AS1-202, LIMD1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene LIMD1-AS1, Length 955 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TBX4P57082 545 aa10.67□□□□□ -0.7
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 NTHL1P78549 312 aa10.67□□□□□ -0.7
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 OGDHQ02218 1023 aa10.67□□□□□ -0.7
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 RPS6KA1Q15418 735 aa10.67□□□□□ -0.7
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP10.67□□□□□ -0.7
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP10.67□□□□□ -0.7
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 EFHC2Q5JST6 749 aa10.67□□□□□ -0.7
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 BRMS1LQ5PSV4 323 aa10.67□□□□□ -0.7
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP10.67□□□□□ -0.7
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TXNDC8Q6A555 127 aa10.67□□□□□ -0.7
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP10.67□□□□□ -0.7
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SYCE2Q6PIF2 218 aa10.67□□□□□ -0.7
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 POLNQ7Z5Q5 900 aa10.67□□□□□ -0.7
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP10.67□□□□□ -0.7
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa10.67□□□□□ -0.7
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 LRRC57Q8N9N7 239 aa10.67□□□□□ -0.7
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PPM1EQ8WY54 764 aa10.67□□□□□ -0.7
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ING5Q8WYH8 240 aa10.67□□□□□ -0.7
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 NT5C3BQ969T7 300 aa10.67□□□□□ -0.7
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 LRRC3Q9BY71 257 aa10.67□□□□□ -0.7
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 WDCPQ9H6R7 721 aa10.67□□□□□ -0.7
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP10.67□□□□□ -0.7
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP10.67□□□□□ -0.7
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CLEC1BQ9P126 229 aa10.67□□□□□ -0.7
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa10.67□□□□□ -0.7
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 NUDT5Q9UKK9 219 aa10.67□□□□□ -0.7
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 USP18Q9UMW8 372 aa10.67□□□□□ -0.7
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 FAM50BQ9Y247 325 aa10.67□□□□□ -0.7
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 JRKLQ9Y4A0 524 aa10.67□□□□□ -0.7
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ALG6Q9Y672 507 aa10.67□□□□□ -0.7
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 MDM4O15151 490 aa10.66□□□□□ -0.7
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 MSI1O43347 362 aaKnown RBP10.66□□□□□ -0.7
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 LRCH4O75427 683 aa10.66□□□□□ -0.7
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP10.66□□□□□ -0.7
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 HMBSP08397 361 aa10.66□□□□□ -0.7
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 IRF1P10914 325 aa10.66□□□□□ -0.7
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 GJA1P17302 382 aa10.66□□□□□ -0.7
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CEBPBP17676 345 aa10.66□□□□□ -0.7
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 KCNA5P22460 613 aa10.66□□□□□ -0.7
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 MIPP30301 263 aa10.66□□□□□ -0.7
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CASQ1P31415 396 aa10.66□□□□□ -0.7
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SLC11A2P49281 568 aa10.66□□□□□ -0.7
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PGFP49763 221 aa10.66□□□□□ -0.7
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ETF1P62495 437 aaKnown RBP10.66□□□□□ -0.7
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SLC7A9P82251 487 aa10.66□□□□□ -0.7
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 RING1Q06587 406 aa10.66□□□□□ -0.7
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa10.66□□□□□ -0.7
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 KRT81Q14533 505 aa10.66□□□□□ -0.7
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PPP2R5DQ14738 602 aa10.66□□□□□ -0.7
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 COL19A1Q14993 1142 aa10.66□□□□□ -0.7
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CLUL1Q15846 466 aa10.66□□□□□ -0.7
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SLC5A9Q2M3M2 681 aa10.66□□□□□ -0.7
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 BOLA3Q53S33 107 aa10.66□□□□□ -0.7
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PRSS36Q5K4E3 855 aa10.66□□□□□ -0.7
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 LRRC38Q5VT99 294 aa10.66□□□□□ -0.7
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TRNP1Q6NT89 227 aa10.66□□□□□ -0.7
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SLFN11Q7Z7L1 901 aa10.66□□□□□ -0.7
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TMEM150AQ86TG1 271 aa10.66□□□□□ -0.7
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 FAM131BQ86XD5 332 aa10.66□□□□□ -0.7
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 MAP7D3Q8IWC1 876 aa10.66□□□□□ -0.7
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CMTM8Q8IZV2 173 aa10.66□□□□□ -0.7
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SLC35F6Q8N357 371 aa10.66□□□□□ -0.7
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SMRP1Q8NCR6 262 aa10.66□□□□□ -0.7
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TTC16Q8NEE8 873 aa10.66□□□□□ -0.7
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP10.66□□□□□ -0.7
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 HLA-CQ95604 372 aa10.66□□□□□ -0.7
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TCEAL4Q96EI5 215 aa10.66□□□□□ -0.7
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 GUCD1Q96NT3 240 aa10.66□□□□□ -0.7
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP10.66□□□□□ -0.7
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP10.66□□□□□ -0.7
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 DCLK3Q9C098 648 aa10.66□□□□□ -0.7
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP10.66□□□□□ -0.7
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ZWILCHQ9H900 591 aa10.66□□□□□ -0.7
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 KIF9Q9HAQ2 790 aa10.66□□□□□ -0.7
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PIGVQ9NUD9 493 aa10.66□□□□□ -0.7
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP10.66□□□□□ -0.7
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 MTMR10Q9NXD2 777 aa10.66□□□□□ -0.7
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SMPD4Q9NXE4 827 aa10.66□□□□□ -0.7
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 GDE1Q9NZC3 331 aa10.66□□□□□ -0.7
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PCSK1NQ9UHG2 260 aa10.66□□□□□ -0.7
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa10.66□□□□□ -0.7
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CPQQ9Y646 472 aa10.66□□□□□ -0.7
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP10.66□□□□□ -0.7
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ENDOD1O94919 500 aa10.65□□□□□ -0.7
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 OLFM2O95897 454 aa10.65□□□□□ -0.7
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TBX18O95935 607 aa10.65□□□□□ -0.7
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 IGLV3-25P01717 112 aa10.65□□□□□ -0.7
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 KRT1P04264 644 aa10.65□□□□□ -0.7
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CTNNA2P26232 953 aa10.65□□□□□ -0.7
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CCR2P41597 374 aa10.65□□□□□ -0.7
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CXCR3P49682 368 aa10.65□□□□□ -0.7
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 DNA2P51530 1060 aa10.65□□□□□ -0.7
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 HDAC4P56524 1084 aa10.65□□□□□ -0.7
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 RWDD2BP57060 319 aa10.65□□□□□ -0.7
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.2 ms