RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428026.6

PTPRU-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRU, Length 5,550 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-204ENST00000428026 RIT2Q99578 217 aa14.87□□□□□ -0.03
PTPRU-204ENST00000428026 DIABLOQ9NR28 239 aa14.87□□□□□ -0.03
PTPRU-204ENST00000428026 STK39Q9UEW8 545 aa14.87□□□□□ -0.03
PTPRU-204ENST00000428026 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa14.87□□□□□ -0.03
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PTPRU-204ENST00000428026 GLRA4Q5JXX5 417 aa14.87□□□□□ -0.03
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PTPRU-204ENST00000428026 FAM25CB3EWG5 89 aa14.86□□□□□ -0.03
PTPRU-204ENST00000428026 FAM25GB3EWG6 89 aa14.86□□□□□ -0.03
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PTPRU-204ENST00000428026 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
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PTPRU-204ENST00000428026 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
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PTPRU-204ENST00000428026 NFIL3Q16649 462 aa14.85□□□□□ -0.03
PTPRU-204ENST00000428026 MRNIPQ6NTE8 343 aa14.85□□□□□ -0.03
PTPRU-204ENST00000428026 CCNJLQ8IV13 435 aa14.85□□□□□ -0.03
PTPRU-204ENST00000428026 APOPT1Q96IL0 206 aa14.85□□□□□ -0.03
PTPRU-204ENST00000428026 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa14.85□□□□□ -0.03
PTPRU-204ENST00000428026 DGCR6LQ9BY27 220 aa14.85□□□□□ -0.03
PTPRU-204ENST00000428026 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
PTPRU-204ENST00000428026 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
PTPRU-204ENST00000428026 CD4P01730 458 aa14.85□□□□□ -0.03
PTPRU-204ENST00000428026 DSG3P32926 999 aa14.85□□□□□ -0.03
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