RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421004.3

SCAMP1-AS1-201, SCAMP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SCAMP1-AS1, Length 1,479 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PIP4P2Q8N4L2 257 aa13.83□□□□□ -0.2
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP13.83□□□□□ -0.2
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TAS1R2Q8TE23 839 aa13.83□□□□□ -0.2
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 UCMAQ8WVF2 138 aa13.83□□□□□ -0.2
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PAGE5Q96GU1 130 aa13.83□□□□□ -0.2
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GPR174Q9BXC1 333 aa13.83□□□□□ -0.2
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DUSP16Q9BY84 665 aa13.83□□□□□ -0.2
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NIF3L1Q9GZT8 377 aa13.83□□□□□ -0.2
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ITM2CQ9NQX7 267 aa13.83□□□□□ -0.2
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP13.83□□□□□ -0.2
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 USP3Q9Y6I4 520 aa13.83□□□□□ -0.2
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP13.82□□□□□ -0.2
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KCNJ18B7U540 433 aa13.82□□□□□ -0.2
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TAF4O00268 1085 aa13.82□□□□□ -0.2
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MAPK13O15264 365 aa13.82□□□□□ -0.2
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KIF20AO95235 890 aa13.82□□□□□ -0.2
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TRIM49P0CI25 452 aa13.82□□□□□ -0.2
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TRIM49CP0CI26 452 aa13.82□□□□□ -0.2
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP13.82□□□□□ -0.2
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 COG7P83436 770 aa13.82□□□□□ -0.2
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EFEMP1Q12805 493 aa13.82□□□□□ -0.2
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP13.82□□□□□ -0.2
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DCAF12L1Q5VU92 463 aa13.82□□□□□ -0.2
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa13.82□□□□□ -0.2
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CADM4Q8NFZ8 388 aa13.82□□□□□ -0.2
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DCLK3Q9C098 648 aa13.82□□□□□ -0.2
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DNAI2Q9GZS0 605 aa13.82□□□□□ -0.2
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa13.82□□□□□ -0.2
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa13.82□□□□□ -0.2
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP13.81□□□□□ -0.2
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HMBSP08397 361 aa13.81□□□□□ -0.2
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP13.81□□□□□ -0.2
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NR2F2P24468 414 aa13.81□□□□□ -0.2
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OXTRP30559 389 aa13.81□□□□□ -0.2
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GCLMP48507 274 aa13.81□□□□□ -0.2
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TPMTP51580 245 aa13.81□□□□□ -0.2
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PPP3CAQ08209 521 aa13.81□□□□□ -0.2
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SCAPQ12770 1279 aa13.81□□□□□ -0.2
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF234Q14588 700 aa13.81□□□□□ -0.2
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ITPR1Q14643 2758 aa13.81□□□□□ -0.2
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP13.81□□□□□ -0.2
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ATL3Q6DD88 541 aa13.81□□□□□ -0.2
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP13.81□□□□□ -0.2
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TMPRSS6Q8IU80 811 aa13.81□□□□□ -0.2
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PNPLA1Q8N8W4 532 aa13.81□□□□□ -0.2
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP13.81□□□□□ -0.2
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SIPA1Q96FS4 1042 aa13.81□□□□□ -0.2
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP13.81□□□□□ -0.2
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa13.81□□□□□ -0.2
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP13.81□□□□□ -0.2
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP13.81□□□□□ -0.2
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NBEAQ8NFP9 2946 aa13.81□□□□□ -0.2
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CBFA2T3O75081 653 aa13.8□□□□□ -0.2
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CER1O95813 267 aa13.8□□□□□ -0.2
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IGLV3-19P01714 112 aa13.8□□□□□ -0.2
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CYBBP04839 570 aa13.8□□□□□ -0.2
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MYL1P05976 194 aa13.8□□□□□ -0.2
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PRKCHP24723 683 aa13.8□□□□□ -0.2
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 COPAP53621 1224 aa13.8□□□□□ -0.2
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 E2F5Q15329 346 aa13.8□□□□□ -0.2
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NFIL3Q16649 462 aa13.8□□□□□ -0.2
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF394Q53GI3 561 aa13.8□□□□□ -0.2
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GLRX5Q86SX6 157 aa13.8□□□□□ -0.2
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CACUL1Q86Y37 369 aa13.8□□□□□ -0.2
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CPXM2Q8N436 756 aa13.8□□□□□ -0.2
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP13.8□□□□□ -0.2
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CCDC150Q8NCX0 1101 aa13.8□□□□□ -0.2
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MMRN2Q9H8L6 949 aa13.8□□□□□ -0.2
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ELOVL2Q9NXB9 296 aa13.8□□□□□ -0.2
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CFAP45Q9UL16 551 aa13.8□□□□□ -0.2
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CLEC4EQ9ULY5 219 aa13.8□□□□□ -0.2
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP13.8□□□□□ -0.2
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ADAMTS20P59510 1910 aa13.8□□□□□ -0.2
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa13.8□□□□□ -0.2
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP13.8□□□□□ -0.2
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 METTL12A8MUP2 240 aa13.8□□□□□ -0.2
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP13.8□□□□□ -0.2
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF883P0CG24 379 aa13.8□□□□□ -0.2
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ACADMP11310 421 aa13.8□□□□□ -0.2
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KRT13P13646 458 aa13.8□□□□□ -0.2
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PFKFB1P16118 471 aa13.8□□□□□ -0.2
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ENPEPQ07075 957 aa13.8□□□□□ -0.2
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ACAP1Q15027 740 aa13.8□□□□□ -0.2
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IL27RAQ6UWB1 636 aa13.8□□□□□ -0.2
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP13.8□□□□□ -0.2
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DENND1CQ8IV53 801 aa13.8□□□□□ -0.2
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAM217AQ8IXS0 508 aa13.8□□□□□ -0.2
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAM186BQ8IYM0 893 aa13.8□□□□□ -0.2
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ARHGAP18Q8N392 663 aa13.8□□□□□ -0.2
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CIPCQ9C0C6 399 aa13.8□□□□□ -0.2
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GAREM1Q9H706 876 aa13.8□□□□□ -0.2
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IL21RQ9HBE5 538 aa13.8□□□□□ -0.2
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TMEM8AQ9HCN3 771 aa13.8□□□□□ -0.2
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MARCH2Q9P0N8 246 aa13.8□□□□□ -0.2
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 STRIP2Q9ULQ0 834 aa13.8□□□□□ -0.2
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PTPRBP23467 1997 aa13.79□□□□□ -0.2
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa13.79□□□□□ -0.2
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC12A8A0AV02 714 aa13.79□□□□□ -0.2
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EPHX1P07099 455 aa13.79□□□□□ -0.2
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MATKP42679 507 aa13.79□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.2 ms