RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000410062.8

UBE2E3-202, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBE2E3, Length 1,570 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3-202ENST00000410062 TMCO5BA8MYB1 307 aa24.83■■□□□ 1.57
UBE2E3-202ENST00000410062 IGLV3-25P01717 112 aa24.83■■□□□ 1.57
UBE2E3-202ENST00000410062 GALK1P51570 392 aa24.83■■□□□ 1.57
UBE2E3-202ENST00000410062 FZD5Q13467 585 aa24.83■■□□□ 1.57
UBE2E3-202ENST00000410062 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
UBE2E3-202ENST00000410062 ACAD10Q6JQN1 1059 aa24.83■■□□□ 1.57
UBE2E3-202ENST00000410062 P2RY13Q9BPV8 354 aa24.83■■□□□ 1.57
UBE2E3-202ENST00000410062 FAM204AQ9H8W3 233 aa24.83■■□□□ 1.57
UBE2E3-202ENST00000410062 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
UBE2E3-202ENST00000410062 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP24.83■■□□□ 1.57
UBE2E3-202ENST00000410062 COX16Q9P0S2 106 aa24.83■■□□□ 1.57
UBE2E3-202ENST00000410062 ZNF318Q5VUA4 2279 aa24.83■■□□□ 1.56
UBE2E3-202ENST00000410062 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
UBE2E3-202ENST00000410062 IRAK2O43187 625 aa24.82■■□□□ 1.56
UBE2E3-202ENST00000410062 NOS2P35228 1153 aa24.82■■□□□ 1.56
UBE2E3-202ENST00000410062 OPRD1P41143 372 aa24.82■■□□□ 1.56
UBE2E3-202ENST00000410062 MATKP42679 507 aa24.82■■□□□ 1.56
UBE2E3-202ENST00000410062 GAD2Q05329 585 aa24.82■■□□□ 1.56
UBE2E3-202ENST00000410062 RING1Q06587 406 aa24.82■■□□□ 1.56
UBE2E3-202ENST00000410062 NNTQ13423 1086 aa24.82■■□□□ 1.56
UBE2E3-202ENST00000410062 TRIM14Q14142 442 aa24.82■■□□□ 1.56
UBE2E3-202ENST00000410062 NUGGCQ68CJ6 796 aa24.82■■□□□ 1.56
UBE2E3-202ENST00000410062 MON1BQ7L1V2 547 aa24.82■■□□□ 1.56
UBE2E3-202ENST00000410062 C12orf40Q86WS4 652 aa24.82■■□□□ 1.56
UBE2E3-202ENST00000410062 BHMTQ93088 406 aa24.82■■□□□ 1.56
UBE2E3-202ENST00000410062 SLC39A13Q96H72 371 aa24.82■■□□□ 1.56
UBE2E3-202ENST00000410062 DDIT4Q9NX09 232 aa24.82■■□□□ 1.56
UBE2E3-202ENST00000410062 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa24.82■■□□□ 1.56
UBE2E3-202ENST00000410062 TMEM59LQ9UK28 342 aa24.82■■□□□ 1.56
UBE2E3-202ENST00000410062 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa24.81■■□□□ 1.56
UBE2E3-202ENST00000410062 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP24.81■■□□□ 1.562e-8■■■□□ 18.9
UBE2E3-202ENST00000410062 GJB6O95452 261 aa24.81■■□□□ 1.56
UBE2E3-202ENST00000410062 SERPING1P05155 500 aa24.81■■□□□ 1.56
UBE2E3-202ENST00000410062 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP24.81■■□□□ 1.56
UBE2E3-202ENST00000410062 CHKAP35790 457 aa24.81■■□□□ 1.56
UBE2E3-202ENST00000410062 FLT3P36888 993 aa24.81■■□□□ 1.56
UBE2E3-202ENST00000410062 SLC6A11P48066 632 aa24.81■■□□□ 1.56
UBE2E3-202ENST00000410062 DNAAF5Q86Y56 855 aa24.81■■□□□ 1.56
UBE2E3-202ENST00000410062 UNC45BQ8IWX7 931 aa24.81■■□□□ 1.56
UBE2E3-202ENST00000410062 NAT16Q8N8M0 369 aa24.81■■□□□ 1.56
UBE2E3-202ENST00000410062 CD101Q93033 1021 aa24.81■■□□□ 1.56
UBE2E3-202ENST00000410062 P2RY11Q96G91 374 aa24.81■■□□□ 1.56
UBE2E3-202ENST00000410062 ANP32EQ9BTT0 268 aa24.81■■□□□ 1.56
UBE2E3-202ENST00000410062 BBS2Q9BXC9 721 aa24.81■■□□□ 1.56
UBE2E3-202ENST00000410062 LMAN1LQ9HAT1 526 aa24.81■■□□□ 1.56
UBE2E3-202ENST00000410062 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
UBE2E3-202ENST00000410062 NCAM2O15394 837 aa24.8■■□□□ 1.56
UBE2E3-202ENST00000410062 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP24.8■■□□□ 1.56
UBE2E3-202ENST00000410062 CALB1P05937 261 aa24.8■■□□□ 1.56
UBE2E3-202ENST00000410062 CHRNB1P11230 501 aa24.8■■□□□ 1.56
UBE2E3-202ENST00000410062 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP24.8■■□□□ 1.56
UBE2E3-202ENST00000410062 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
UBE2E3-202ENST00000410062 NME3Q13232 169 aa24.8■■□□□ 1.56
UBE2E3-202ENST00000410062 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP24.8■■□□□ 1.56
UBE2E3-202ENST00000410062 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
UBE2E3-202ENST00000410062 TMEM196Q5HYL7 178 aa24.8■■□□□ 1.56
UBE2E3-202ENST00000410062 FSTL4Q6MZW2 842 aa24.8■■□□□ 1.56
UBE2E3-202ENST00000410062 TRNP1Q6NT89 227 aa24.8■■□□□ 1.56
UBE2E3-202ENST00000410062 CLDN23Q96B33 292 aa24.8■■□□□ 1.56
UBE2E3-202ENST00000410062 ADAM33Q9BZ11 813 aa24.8■■□□□ 1.56
UBE2E3-202ENST00000410062 PLK2Q9NYY3 685 aa24.8■■□□□ 1.56
UBE2E3-202ENST00000410062 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa24.8■■□□□ 1.56
UBE2E3-202ENST00000410062 WDR35Q9P2L0 1181 aa24.8■■□□□ 1.56
UBE2E3-202ENST00000410062 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
UBE2E3-202ENST00000410062 M0QYT0 321 aa24.8■■□□□ 1.56
UBE2E3-202ENST00000410062 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP24.8■■□□□ 1.56
UBE2E3-202ENST00000410062 GBP1P32455 592 aa24.8■■□□□ 1.56
UBE2E3-202ENST00000410062 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP24.8■■□□□ 1.56
UBE2E3-202ENST00000410062 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP24.8■■□□□ 1.56
UBE2E3-202ENST00000410062 TMC6Q7Z403 805 aa24.8■■□□□ 1.56
UBE2E3-202ENST00000410062 FAM217AQ8IXS0 508 aa24.8■■□□□ 1.56
UBE2E3-202ENST00000410062 MCOLN2Q8IZK6 566 aa24.8■■□□□ 1.56
UBE2E3-202ENST00000410062 EMC1Q8N766 993 aa24.8■■□□□ 1.56
UBE2E3-202ENST00000410062 NPY6RQ99463 290 aa24.8■■□□□ 1.56
UBE2E3-202ENST00000410062 MARK1Q9P0L2 795 aa24.8■■□□□ 1.56
UBE2E3-202ENST00000410062 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa24.79■■□□□ 1.56
UBE2E3-202ENST00000410062 LATS1O95835 1130 aa24.79■■□□□ 1.56
UBE2E3-202ENST00000410062 EGFP01133 1207 aa24.79■■□□□ 1.56
UBE2E3-202ENST00000410062 TYRP14679 529 aa24.79■■□□□ 1.56
UBE2E3-202ENST00000410062 SLC11A2P49281 568 aa24.79■■□□□ 1.56
UBE2E3-202ENST00000410062 SULT1E1P49888 294 aa24.79■■□□□ 1.56
UBE2E3-202ENST00000410062 MESP2Q0VG99 397 aa24.79■■□□□ 1.56
UBE2E3-202ENST00000410062 CCINQ13939 588 aa24.79■■□□□ 1.56
UBE2E3-202ENST00000410062 ADGRF1Q5T601 910 aa24.79■■□□□ 1.56
UBE2E3-202ENST00000410062 CPXM2Q8N436 756 aa24.79■■□□□ 1.56
UBE2E3-202ENST00000410062 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP24.79■■□□□ 1.56
UBE2E3-202ENST00000410062 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
UBE2E3-202ENST00000410062 STOML2Q9UJZ1 356 aa24.79■■□□□ 1.56
UBE2E3-202ENST00000410062 STAP1Q9ULZ2 295 aa24.79■■□□□ 1.56
UBE2E3-202ENST00000410062 ACSL4O60488 711 aa24.78■■□□□ 1.56
UBE2E3-202ENST00000410062 TSPAN3O60637 253 aa24.78■■□□□ 1.56
UBE2E3-202ENST00000410062 TPM1P09493 284 aa24.78■■□□□ 1.56
UBE2E3-202ENST00000410062 ZNF75DP51815 510 aa24.78■■□□□ 1.56
UBE2E3-202ENST00000410062 GSCP56915 257 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
UBE2E3-202ENST00000410062 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa24.78■■□□□ 1.56
UBE2E3-202ENST00000410062 OR8K1Q8NGG5 319 aa24.78■■□□□ 1.56
UBE2E3-202ENST00000410062 JOSD2Q8TAC2 188 aa24.78■■□□□ 1.56
UBE2E3-202ENST00000410062 RNF34Q969K3 372 aa24.78■■□□□ 1.56
UBE2E3-202ENST00000410062 NT5C3BQ969T7 300 aa24.78■■□□□ 1.56
UBE2E3-202ENST00000410062 EXOC4Q96A65 974 aa24.78■■□□□ 1.56
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