RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393537.4

ANKRD39-201, Transcript of ankyrin repeat domain 39, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD39, Length 976 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39-201ENST00000393537 PDCLQ13371 301 aa21.1■□□□□ 0.97
ANKRD39-201ENST00000393537 RAPGEF1Q13905 1077 aa21.1■□□□□ 0.97
ANKRD39-201ENST00000393537 STX1AQ16623 288 aa21.1■□□□□ 0.97
ANKRD39-201ENST00000393537 CCDC183Q5T5S1 534 aa21.1■□□□□ 0.97
ANKRD39-201ENST00000393537 CDKAL1Q5VV42 579 aa21.1■□□□□ 0.97
ANKRD39-201ENST00000393537 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa21.1■□□□□ 0.97
ANKRD39-201ENST00000393537 SMYD5Q6GMV2 418 aa21.1■□□□□ 0.97
ANKRD39-201ENST00000393537 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa21.1■□□□□ 0.97
ANKRD39-201ENST00000393537 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP21.1■□□□□ 0.97
ANKRD39-201ENST00000393537 TMEM110Q86TL2 294 aa21.1■□□□□ 0.97
ANKRD39-201ENST00000393537 KBTBD6Q86V97 674 aa21.1■□□□□ 0.97
ANKRD39-201ENST00000393537 RASSF3Q86WH2 238 aa21.1■□□□□ 0.97
ANKRD39-201ENST00000393537 PASD1Q8IV76 773 aa21.1■□□□□ 0.97
ANKRD39-201ENST00000393537 MDGA1Q8NFP4 955 aa21.1■□□□□ 0.97
ANKRD39-201ENST00000393537 DDI1Q8WTU0 396 aa21.1■□□□□ 0.97
ANKRD39-201ENST00000393537 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP21.1■□□□□ 0.97
ANKRD39-201ENST00000393537 TPSD1Q9BZJ3 242 aa21.1■□□□□ 0.97
ANKRD39-201ENST00000393537 FBXO10Q9UK96 956 aa21.1■□□□□ 0.97
ANKRD39-201ENST00000393537 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa21.1■□□□□ 0.97
ANKRD39-201ENST00000393537 STARD13Q9Y3M8 1113 aa21.1■□□□□ 0.97
ANKRD39-201ENST00000393537 FHOD1Q9Y613 1164 aa21.1■□□□□ 0.97
ANKRD39-201ENST00000393537 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP21.09■□□□□ 0.97
ANKRD39-201ENST00000393537 ALDH1A2O94788 518 aa21.09■□□□□ 0.97
ANKRD39-201ENST00000393537 CLCN1P35523 988 aa21.09■□□□□ 0.97
ANKRD39-201ENST00000393537 TBX4P57082 545 aa21.09■□□□□ 0.97
ANKRD39-201ENST00000393537 SPEM2Q0P670 501 aa21.09■□□□□ 0.97
ANKRD39-201ENST00000393537 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP21.09■□□□□ 0.97
ANKRD39-201ENST00000393537 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa21.09■□□□□ 0.97
ANKRD39-201ENST00000393537 SLC47A2Q86VL8 602 aa21.09■□□□□ 0.97
ANKRD39-201ENST00000393537 FAM71AQ8IYT1 594 aa21.09■□□□□ 0.97
ANKRD39-201ENST00000393537 WDTC1Q8N5D0 677 aa21.09■□□□□ 0.97
ANKRD39-201ENST00000393537 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP21.09■□□□□ 0.97
ANKRD39-201ENST00000393537 VPS16Q9H269 839 aa21.09■□□□□ 0.97
ANKRD39-201ENST00000393537 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP21.09■□□□□ 0.97
ANKRD39-201ENST00000393537 FANCLQ9NW38 375 aa21.09■□□□□ 0.97
ANKRD39-201ENST00000393537 TJP2Q9UDY2 1190 aa21.09■□□□□ 0.97
ANKRD39-201ENST00000393537 PCDHGC3Q9UN70 934 aa21.09■□□□□ 0.97
ANKRD39-201ENST00000393537 SDK1Q7Z5N4 2213 aa21.08■□□□□ 0.97
ANKRD39-201ENST00000393537 DCLK1O15075 740 aa21.08■□□□□ 0.97
ANKRD39-201ENST00000393537 TSPAN3O60637 253 aa21.08■□□□□ 0.97
ANKRD39-201ENST00000393537 LATS1O95835 1130 aa21.08■□□□□ 0.97
ANKRD39-201ENST00000393537 IGLV3-27P01718 113 aa21.08■□□□□ 0.97
ANKRD39-201ENST00000393537 NTSR1P30989 418 aa21.08■□□□□ 0.97
ANKRD39-201ENST00000393537 WASP42768 502 aa21.08■□□□□ 0.97
ANKRD39-201ENST00000393537 KRT31Q15323 416 aa21.08■□□□□ 0.97
ANKRD39-201ENST00000393537 MPPE1Q53F39 396 aa21.08■□□□□ 0.97
ANKRD39-201ENST00000393537 ADGRF1Q5T601 910 aa21.08■□□□□ 0.97
ANKRD39-201ENST00000393537 NUGGCQ68CJ6 796 aa21.08■□□□□ 0.97
ANKRD39-201ENST00000393537 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP21.08■□□□□ 0.97
ANKRD39-201ENST00000393537 ACOX2Q99424 681 aa21.08■□□□□ 0.97
ANKRD39-201ENST00000393537 PARD6AQ9NPB6 346 aa21.08■□□□□ 0.97
ANKRD39-201ENST00000393537 STOML2Q9UJZ1 356 aa21.08■□□□□ 0.97
ANKRD39-201ENST00000393537 CLEC4EQ9ULY5 219 aa21.08■□□□□ 0.97
ANKRD39-201ENST00000393537 USP18Q9UMW8 372 aa21.08■□□□□ 0.97
ANKRD39-201ENST00000393537 INVSQ9Y283 1065 aa21.08■□□□□ 0.97
ANKRD39-201ENST00000393537 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa21.08■□□□□ 0.97
ANKRD39-201ENST00000393537 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa21.07■□□□□ 0.96
ANKRD39-201ENST00000393537 CAPN9O14815 690 aa21.07■□□□□ 0.96
ANKRD39-201ENST00000393537 HOXB2P14652 356 aa21.07■□□□□ 0.96
ANKRD39-201ENST00000393537 TGM1P22735 817 aa21.07■□□□□ 0.96
ANKRD39-201ENST00000393537 KRT9P35527 623 aa21.07■□□□□ 0.96
ANKRD39-201ENST00000393537 RING1Q06587 406 aa21.07■□□□□ 0.96
ANKRD39-201ENST00000393537 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP21.07■□□□□ 0.96
ANKRD39-201ENST00000393537 SYPL2Q5VXT5 272 aa21.07■□□□□ 0.96
ANKRD39-201ENST00000393537 UNC45BQ8IWX7 931 aa21.07■□□□□ 0.96
ANKRD39-201ENST00000393537 CHPFQ8IZ52 775 aa21.07■□□□□ 0.96
ANKRD39-201ENST00000393537 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP21.07■□□□□ 0.96
ANKRD39-201ENST00000393537 ADAM32Q8TC27 787 aa21.07■□□□□ 0.96
ANKRD39-201ENST00000393537 HMGB4Q8WW32 186 aa21.07■□□□□ 0.96
ANKRD39-201ENST00000393537 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa21.07■□□□□ 0.96
ANKRD39-201ENST00000393537 SERPINB11Q96P15 392 aa21.07■□□□□ 0.96
ANKRD39-201ENST00000393537 CPXM1Q96SM3 734 aa21.07■□□□□ 0.96
ANKRD39-201ENST00000393537 TRIM62Q9BVG3 475 aa21.07■□□□□ 0.96
ANKRD39-201ENST00000393537 LHX5Q9H2C1 402 aa21.07■□□□□ 0.96
ANKRD39-201ENST00000393537 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP21.07■□□□□ 0.96
ANKRD39-201ENST00000393537 TPM2P07951 284 aa21.06■□□□□ 0.96
ANKRD39-201ENST00000393537 UCHL3P15374 230 aa21.06■□□□□ 0.96
ANKRD39-201ENST00000393537 SLC11A2P49281 568 aa21.06■□□□□ 0.96
ANKRD39-201ENST00000393537 BPIFB4P59827 614 aa21.06■□□□□ 0.96
ANKRD39-201ENST00000393537 ZNF445P59923 1031 aa21.06■□□□□ 0.96
ANKRD39-201ENST00000393537 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP21.06■□□□□ 0.96
ANKRD39-201ENST00000393537 GEN1Q17RS7 908 aa21.06■□□□□ 0.96
ANKRD39-201ENST00000393537 PLK5Q496M5 336 aa21.06■□□□□ 0.96
ANKRD39-201ENST00000393537 SDE2Q6IQ49 451 aa21.06■□□□□ 0.96
ANKRD39-201ENST00000393537 BEND5Q7L4P6 421 aa21.06■□□□□ 0.96
ANKRD39-201ENST00000393537 TAC4Q86UU9 113 aa21.06■□□□□ 0.96
ANKRD39-201ENST00000393537 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP21.06■□□□□ 0.96
ANKRD39-201ENST00000393537 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP21.06■□□□□ 0.96
ANKRD39-201ENST00000393537 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP21.06■□□□□ 0.96
ANKRD39-201ENST00000393537 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP21.06■□□□□ 0.96
ANKRD39-201ENST00000393537 NOX5Q96PH1 765 aa21.06■□□□□ 0.96
ANKRD39-201ENST00000393537 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP21.06■□□□□ 0.96
ANKRD39-201ENST00000393537 POPDC2Q9HBU9 364 aa21.06■□□□□ 0.96
ANKRD39-201ENST00000393537 PLCB1Q9NQ66 1216 aa21.06■□□□□ 0.96
ANKRD39-201ENST00000393537 TMEM63CQ9P1W3 806 aa21.06■□□□□ 0.96
ANKRD39-201ENST00000393537 CFAP54Q96N23 3096 aa21.06■□□□□ 0.96
ANKRD39-201ENST00000393537 ZNF292O60281 2723 aa21.06■□□□□ 0.96
ANKRD39-201ENST00000393537 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa21.05■□□□□ 0.96
ANKRD39-201ENST00000393537 GFRA2O00451 464 aa21.05■□□□□ 0.96
ANKRD39-201ENST00000393537 ACSL4O60488 711 aa21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.3 ms