RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392496.3

SPHK1-202, Transcript of sphingosine kinase 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPHK1, Length 1,779 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHK1-202ENST00000392496 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP22.13■■□□□ 1.13
SPHK1-202ENST00000392496 TRIM66O15016 1216 aa22.12■■□□□ 1.13
SPHK1-202ENST00000392496 SHBGP04278 402 aa22.12■■□□□ 1.13
SPHK1-202ENST00000392496 CXCR3P49682 368 aa22.12■■□□□ 1.13
SPHK1-202ENST00000392496 CNKSR3Q6P9H4 555 aa22.12■■□□□ 1.13
SPHK1-202ENST00000392496 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
SPHK1-202ENST00000392496 SCN4BQ8IWT1 228 aa22.12■■□□□ 1.13
SPHK1-202ENST00000392496 PWWP2AQ96N64 755 aa22.12■■□□□ 1.13
SPHK1-202ENST00000392496 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP22.12■■□□□ 1.131e-6■■■■□ 26.7
SPHK1-202ENST00000392496 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
SPHK1-202ENST00000392496 PHACTR1Q9C0D0 580 aa22.12■■□□□ 1.13
SPHK1-202ENST00000392496 ARHGEF4Q9NR80 690 aa22.12■■□□□ 1.13
SPHK1-202ENST00000392496 ABCC13Q9NSE7 274 aa22.12■■□□□ 1.13
SPHK1-202ENST00000392496 RFC2P35250 354 aa22.12■■□□□ 1.13
SPHK1-202ENST00000392496 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
SPHK1-202ENST00000392496 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP22.12■■□□□ 1.13
SPHK1-202ENST00000392496 GBE1Q04446 702 aa22.12■■□□□ 1.13
SPHK1-202ENST00000392496 IKBKEQ14164 716 aa22.12■■□□□ 1.13
SPHK1-202ENST00000392496 KCTD16Q68DU8 428 aa22.12■■□□□ 1.13
SPHK1-202ENST00000392496 NAT8LQ8N9F0 302 aa22.12■■□□□ 1.13
SPHK1-202ENST00000392496 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
SPHK1-202ENST00000392496 CPT1BQ92523 772 aa22.12■■□□□ 1.13
SPHK1-202ENST00000392496 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
SPHK1-202ENST00000392496 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa22.12■■□□□ 1.13
SPHK1-202ENST00000392496 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
SPHK1-202ENST00000392496 NINJ2Q9NZG7 142 aa22.12■■□□□ 1.13
SPHK1-202ENST00000392496 PAK5Q9P286 719 aa22.12■■□□□ 1.13
SPHK1-202ENST00000392496 HCSTQ9UBK5 93 aa22.12■■□□□ 1.13
SPHK1-202ENST00000392496 H7C4K7 107 aa22.11■■□□□ 1.13
SPHK1-202ENST00000392496 KCNN4O15554 427 aa22.11■■□□□ 1.13
SPHK1-202ENST00000392496 IGLV3-25P01717 112 aa22.11■■□□□ 1.13
SPHK1-202ENST00000392496 EN2P19622 333 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
SPHK1-202ENST00000392496 RBL1P28749 1068 aa22.11■■□□□ 1.13
SPHK1-202ENST00000392496 ACTN2P35609 894 aa22.11■■□□□ 1.13
SPHK1-202ENST00000392496 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
SPHK1-202ENST00000392496 SEMA3BQ13214 749 aa22.11■■□□□ 1.13
SPHK1-202ENST00000392496 SLC45A4Q5BKX6 768 aa22.11■■□□□ 1.13
SPHK1-202ENST00000392496 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
SPHK1-202ENST00000392496 TAC4Q86UU9 113 aa22.11■■□□□ 1.13
SPHK1-202ENST00000392496 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
SPHK1-202ENST00000392496 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
SPHK1-202ENST00000392496 WDCPQ9H6R7 721 aa22.11■■□□□ 1.13
SPHK1-202ENST00000392496 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
SPHK1-202ENST00000392496 TMEM39AQ9NV64 488 aa22.11■■□□□ 1.13
SPHK1-202ENST00000392496 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa22.11■■□□□ 1.13
SPHK1-202ENST00000392496 HACD1B0YJ81 288 aa22.1■■□□□ 1.13
SPHK1-202ENST00000392496 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
SPHK1-202ENST00000392496 MAGEA4P43358 317 aa22.1■■□□□ 1.13
SPHK1-202ENST00000392496 HCAR3P49019 387 aa22.1■■□□□ 1.13
SPHK1-202ENST00000392496 SMARCB1Q12824 385 aa22.1■■□□□ 1.13
SPHK1-202ENST00000392496 DPYSQ14117 519 aa22.1■■□□□ 1.13
SPHK1-202ENST00000392496 KYNUQ16719 465 aa22.1■■□□□ 1.13
SPHK1-202ENST00000392496 EMC10Q5UCC4 262 aa22.1■■□□□ 1.13
SPHK1-202ENST00000392496 BTBD8Q5XKL5 378 aa22.1■■□□□ 1.13
SPHK1-202ENST00000392496 C4orf22Q6V702 233 aa22.1■■□□□ 1.13
SPHK1-202ENST00000392496 NUP93Q8N1F7 819 aa22.1■■□□□ 1.13
SPHK1-202ENST00000392496 SH2D3CQ8N5H7 860 aa22.1■■□□□ 1.13
SPHK1-202ENST00000392496 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP22.1■■□□□ 1.13
SPHK1-202ENST00000392496 CENPHQ9H3R5 247 aa22.1■■□□□ 1.13
SPHK1-202ENST00000392496 ETNK2Q9NVF9 386 aa22.1■■□□□ 1.13
SPHK1-202ENST00000392496 DTLQ9NZJ0 730 aa22.1■■□□□ 1.13
SPHK1-202ENST00000392496 TBC1D4O60343 1298 aa22.1■■□□□ 1.13
SPHK1-202ENST00000392496 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
SPHK1-202ENST00000392496 C6orf118Q5T5N4 469 aa22.1■■□□□ 1.13
SPHK1-202ENST00000392496 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP22.1■■□□□ 1.131e-7■■■□□ 15.5
SPHK1-202ENST00000392496 RFX8Q6ZV50 586 aa22.1■■□□□ 1.13
SPHK1-202ENST00000392496 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa22.1■■□□□ 1.13
SPHK1-202ENST00000392496 OLFM3Q96PB7 478 aa22.1■■□□□ 1.13
SPHK1-202ENST00000392496 SCML2Q9UQR0 700 aa22.1■■□□□ 1.13
SPHK1-202ENST00000392496 CREB3O43889 395 aa22.09■■□□□ 1.13
SPHK1-202ENST00000392496 DGKIO75912 1065 aa22.09■■□□□ 1.13
SPHK1-202ENST00000392496 ACSL3O95573 720 aa22.09■■□□□ 1.13
SPHK1-202ENST00000392496 CLTBP09497 229 aa22.09■■□□□ 1.13
SPHK1-202ENST00000392496 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
SPHK1-202ENST00000392496 GPR17Q13304 367 aa22.09■■□□□ 1.13
SPHK1-202ENST00000392496 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
SPHK1-202ENST00000392496 KCNT2Q6UVM3 1135 aa22.09■■□□□ 1.13
SPHK1-202ENST00000392496 ANKS3Q6ZW76 656 aa22.09■■□□□ 1.13
SPHK1-202ENST00000392496 CENPUQ71F23 418 aa22.09■■□□□ 1.13
SPHK1-202ENST00000392496 PGM2Q96G03 612 aa22.09■■□□□ 1.13
SPHK1-202ENST00000392496 TTC25Q96NG3 672 aa22.09■■□□□ 1.13
SPHK1-202ENST00000392496 FBXO44Q9H4M3 255 aa22.09■■□□□ 1.13
SPHK1-202ENST00000392496 SAYSD1Q9NPB0 183 aa22.09■■□□□ 1.13
SPHK1-202ENST00000392496 ANLNQ9NQW6 1124 aa22.09■■□□□ 1.13
SPHK1-202ENST00000392496 TMEM51Q9NW97 253 aa22.09■■□□□ 1.13
SPHK1-202ENST00000392496 PLXNA3P51805 1871 aa22.09■■□□□ 1.13
SPHK1-202ENST00000392496 MYO16Q9Y6X6 1858 aa22.09■■□□□ 1.13
SPHK1-202ENST00000392496 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa22.08■■□□□ 1.13
SPHK1-202ENST00000392496 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP22.08■■□□□ 1.133e-7■■■□□ 17.2
SPHK1-202ENST00000392496 MAP3K6O95382 1288 aa22.08■■□□□ 1.13
SPHK1-202ENST00000392496 SKOR1P84550 965 aa22.08■■□□□ 1.13
SPHK1-202ENST00000392496 ANKRD22Q5VYY1 191 aa22.08■■□□□ 1.13
SPHK1-202ENST00000392496 KDM7AQ6ZMT4 941 aa22.08■■□□□ 1.13
SPHK1-202ENST00000392496 SCD5Q86SK9 330 aa22.08■■□□□ 1.13
SPHK1-202ENST00000392496 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
SPHK1-202ENST00000392496 SPPL2BQ8TCT7 592 aa22.08■■□□□ 1.13
SPHK1-202ENST00000392496 B3GALT6Q96L58 329 aa22.08■■□□□ 1.13
SPHK1-202ENST00000392496 TTPALQ9BTX7 342 aa22.08■■□□□ 1.13
SPHK1-202ENST00000392496 TKTL2Q9H0I9 626 aa22.08■■□□□ 1.13
SPHK1-202ENST00000392496 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa22.08■■□□□ 1.13
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