RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392415.6

UBE2E3-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene UBE2E3, Length 1,347 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3-201ENST00000392415 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa21.48■■□□□ 1.03
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UBE2E3-201ENST00000392415 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
UBE2E3-201ENST00000392415 MSI1O43347 362 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
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UBE2E3-201ENST00000392415 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa21.47■■□□□ 1.03
UBE2E3-201ENST00000392415 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
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UBE2E3-201ENST00000392415 WDTC1Q8N5D0 677 aa21.47■■□□□ 1.03
UBE2E3-201ENST00000392415 LHX5Q9H2C1 402 aa21.47■■□□□ 1.03
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UBE2E3-201ENST00000392415 ZNF445P59923 1031 aa21.46■■□□□ 1.03
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UBE2E3-201ENST00000392415 CCDC183Q5T5S1 534 aa21.46■■□□□ 1.03
UBE2E3-201ENST00000392415 ADGRF1Q5T601 910 aa21.46■■□□□ 1.03
UBE2E3-201ENST00000392415 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
UBE2E3-201ENST00000392415 UNC45BQ8IWX7 931 aa21.46■■□□□ 1.03
UBE2E3-201ENST00000392415 MDGA1Q8NFP4 955 aa21.46■■□□□ 1.03
UBE2E3-201ENST00000392415 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
UBE2E3-201ENST00000392415 FAM149B1Q96BN6 582 aa21.46■■□□□ 1.03
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UBE2E3-201ENST00000392415 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
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UBE2E3-201ENST00000392415 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa21.46■■□□□ 1.03
UBE2E3-201ENST00000392415 LRP3O75074 770 aa21.45■■□□□ 1.02
UBE2E3-201ENST00000392415 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
UBE2E3-201ENST00000392415 NTSR1P30989 418 aa21.45■■□□□ 1.02
UBE2E3-201ENST00000392415 TBX4P57082 545 aa21.45■■□□□ 1.02
UBE2E3-201ENST00000392415 BPIFB4P59827 614 aa21.45■■□□□ 1.02
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UBE2E3-201ENST00000392415 KBTBD6Q86V97 674 aa21.45■■□□□ 1.02
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UBE2E3-201ENST00000392415 SERPINB11Q96P15 392 aa21.45■■□□□ 1.02
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UBE2E3-201ENST00000392415 KRT9P35527 623 aa21.44■■□□□ 1.02
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UBE2E3-201ENST00000392415 TPSD1Q9BZJ3 242 aa21.44■■□□□ 1.02
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UBE2E3-201ENST00000392415 TJP2Q9UDY2 1190 aa21.44■■□□□ 1.02
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UBE2E3-201ENST00000392415 OLIG1Q8TAK6 271 aa21.43■■□□□ 1.02
UBE2E3-201ENST00000392415 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
UBE2E3-201ENST00000392415 SLC39A13Q96H72 371 aa21.43■■□□□ 1.02
UBE2E3-201ENST00000392415 NOX5Q96PH1 765 aa21.43■■□□□ 1.02
UBE2E3-201ENST00000392415 ACOX2Q99424 681 aa21.43■■□□□ 1.02
UBE2E3-201ENST00000392415 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
UBE2E3-201ENST00000392415 POPDC2Q9HBU9 364 aa21.43■■□□□ 1.02
UBE2E3-201ENST00000392415 PLCB1Q9NQ66 1216 aa21.43■■□□□ 1.02
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UBE2E3-201ENST00000392415 ACSL4O60488 711 aa21.42■■□□□ 1.02
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