RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373395.3

HJURP-201, Transcript of Holliday junction recognition protein, humanhuman

TSL 5

Gene HJURP, Length 467 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURP-201ENST00000373395 A0A1B0GTH6 734 aa9.49□□□□□ -0.89
HJURP-201ENST00000373395 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
HJURP-201ENST00000373395 H0Y858 1186 aa9.49□□□□□ -0.89
HJURP-201ENST00000373395 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
HJURP-201ENST00000373395 CBFA2T2O43439 604 aa9.49□□□□□ -0.89
HJURP-201ENST00000373395 DESP17661 470 aa9.49□□□□□ -0.89
HJURP-201ENST00000373395 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
HJURP-201ENST00000373395 SCNN1AP37088 669 aa9.49□□□□□ -0.89
HJURP-201ENST00000373395 GRIA2P42262 883 aa9.49□□□□□ -0.89
HJURP-201ENST00000373395 CXCL12P48061 93 aa9.49□□□□□ -0.89
HJURP-201ENST00000373395 GALK1P51570 392 aa9.49□□□□□ -0.89
HJURP-201ENST00000373395 UBASH3AP57075 661 aa9.49□□□□□ -0.89
HJURP-201ENST00000373395 TBX4P57082 545 aa9.49□□□□□ -0.89
HJURP-201ENST00000373395 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
HJURP-201ENST00000373395 CDK17Q00537 523 aa9.49□□□□□ -0.89
HJURP-201ENST00000373395 FANCCQ00597 558 aa9.49□□□□□ -0.89
HJURP-201ENST00000373395 CDR2Q01850 454 aa9.49□□□□□ -0.89
HJURP-201ENST00000373395 RING1Q06587 406 aa9.49□□□□□ -0.89
HJURP-201ENST00000373395 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
HJURP-201ENST00000373395 NFKBIBQ15653 356 aa9.49□□□□□ -0.89
HJURP-201ENST00000373395 ZNF528Q3MIS6 628 aa9.49□□□□□ -0.89
HJURP-201ENST00000373395 DMRTA1Q5VZB9 504 aa9.49□□□□□ -0.89
HJURP-201ENST00000373395 GRAMD4Q6IC98 578 aa9.49□□□□□ -0.89
HJURP-201ENST00000373395 FSTL4Q6MZW2 842 aa9.49□□□□□ -0.89
HJURP-201ENST00000373395 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa9.49□□□□□ -0.89
HJURP-201ENST00000373395 RHBDF2Q6PJF5 856 aa9.49□□□□□ -0.89
HJURP-201ENST00000373395 Q6ZNB5 142 aa9.49□□□□□ -0.89
HJURP-201ENST00000373395 TPGS1Q6ZTW0 290 aa9.49□□□□□ -0.89
HJURP-201ENST00000373395 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
HJURP-201ENST00000373395 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
HJURP-201ENST00000373395 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
HJURP-201ENST00000373395 LUZP1Q86V48 1076 aa9.49□□□□□ -0.89
HJURP-201ENST00000373395 DENND1CQ8IV53 801 aa9.49□□□□□ -0.89
HJURP-201ENST00000373395 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
HJURP-201ENST00000373395 CPXM2Q8N436 756 aa9.49□□□□□ -0.89
HJURP-201ENST00000373395 SPEM1Q8N4L4 309 aa9.49□□□□□ -0.89
HJURP-201ENST00000373395 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
HJURP-201ENST00000373395 CLEC4CQ8WTT0 213 aa9.49□□□□□ -0.89
HJURP-201ENST00000373395 C18orf8Q96DM3 657 aa9.49□□□□□ -0.89
HJURP-201ENST00000373395 CHFRQ96EP1 664 aa9.49□□□□□ -0.89
HJURP-201ENST00000373395 CPXM1Q96SM3 734 aa9.49□□□□□ -0.89
HJURP-201ENST00000373395 NUP58Q9BVL2 599 aa9.49□□□□□ -0.89
HJURP-201ENST00000373395 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
HJURP-201ENST00000373395 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
HJURP-201ENST00000373395 FAM204AQ9H8W3 233 aa9.49□□□□□ -0.89
HJURP-201ENST00000373395 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
HJURP-201ENST00000373395 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
HJURP-201ENST00000373395 MARK1Q9P0L2 795 aa9.49□□□□□ -0.89
HJURP-201ENST00000373395 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa9.49□□□□□ -0.89
HJURP-201ENST00000373395 STAP1Q9ULZ2 295 aa9.49□□□□□ -0.89
HJURP-201ENST00000373395 TLR6Q9Y2C9 796 aa9.49□□□□□ -0.89
HJURP-201ENST00000373395 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa9.49□□□□□ -0.89
HJURP-201ENST00000373395 ZNF318Q5VUA4 2279 aa9.49□□□□□ -0.89
HJURP-201ENST00000373395 TBC1D3BA6NDS4 549 aa9.48□□□□□ -0.89
HJURP-201ENST00000373395 IRAK2O43187 625 aa9.48□□□□□ -0.89
HJURP-201ENST00000373395 TEX33O43247 280 aa9.48□□□□□ -0.89
HJURP-201ENST00000373395 RNF40O75150 1001 aa9.48□□□□□ -0.89
HJURP-201ENST00000373395 DAB1O75553 588 aa9.48□□□□□ -0.89
HJURP-201ENST00000373395 EGFP01133 1207 aa9.48□□□□□ -0.89
HJURP-201ENST00000373395 MMEP08473 750 aa9.48□□□□□ -0.89
HJURP-201ENST00000373395 SLC2A3P11169 496 aa9.48□□□□□ -0.89
HJURP-201ENST00000373395 TYRP14679 529 aa9.48□□□□□ -0.89
HJURP-201ENST00000373395 PLA2G5P39877 138 aa9.48□□□□□ -0.89
HJURP-201ENST00000373395 OPRD1P41143 372 aa9.48□□□□□ -0.89
HJURP-201ENST00000373395 NSFP46459 744 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
HJURP-201ENST00000373395 NOMO3P69849 1222 aa9.48□□□□□ -0.89
HJURP-201ENST00000373395 SLC6A3Q01959 620 aa9.48□□□□□ -0.89
HJURP-201ENST00000373395 ARID5AQ03989 594 aa9.48□□□□□ -0.89
HJURP-201ENST00000373395 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
HJURP-201ENST00000373395 KDSRQ06136 332 aa9.48□□□□□ -0.89
HJURP-201ENST00000373395 TCF15Q12870 199 aa9.48□□□□□ -0.89
HJURP-201ENST00000373395 MTAPQ13126 283 aa9.48□□□□□ -0.89
HJURP-201ENST00000373395 ASIC2Q16515 512 aa9.48□□□□□ -0.89
HJURP-201ENST00000373395 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
HJURP-201ENST00000373395 PTPN20Q4JDL3 420 aa9.48□□□□□ -0.89
HJURP-201ENST00000373395 MPPE1Q53F39 396 aa9.48□□□□□ -0.89
HJURP-201ENST00000373395 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
HJURP-201ENST00000373395 NAA35Q5VZE5 725 aa9.48□□□□□ -0.89
HJURP-201ENST00000373395 LRSAM1Q6UWE0 723 aa9.48□□□□□ -0.89
HJURP-201ENST00000373395 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa9.48□□□□□ -0.89
HJURP-201ENST00000373395 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP9.48□□□□□ -0.89
HJURP-201ENST00000373395 SLC26A9Q7LBE3 791 aa9.48□□□□□ -0.89
HJURP-201ENST00000373395 SPNS2Q8IVW8 549 aa9.48□□□□□ -0.89
HJURP-201ENST00000373395 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa9.48□□□□□ -0.89
HJURP-201ENST00000373395 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
HJURP-201ENST00000373395 DDI1Q8WTU0 396 aa9.48□□□□□ -0.89
HJURP-201ENST00000373395 RNF34Q969K3 372 aa9.48□□□□□ -0.89
HJURP-201ENST00000373395 EDEM3Q9BZQ6 932 aa9.48□□□□□ -0.89
HJURP-201ENST00000373395 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
HJURP-201ENST00000373395 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
HJURP-201ENST00000373395 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
HJURP-201ENST00000373395 TJP2Q9UDY2 1190 aa9.48□□□□□ -0.89
HJURP-201ENST00000373395 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa9.48□□□□□ -0.89
HJURP-201ENST00000373395 CYTH4Q9UIA0 394 aa9.48□□□□□ -0.89
HJURP-201ENST00000373395 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
HJURP-201ENST00000373395 SLC8A2Q9UPR5 921 aa9.48□□□□□ -0.89
HJURP-201ENST00000373395 WDFY4Q6ZS81 3184 aa9.48□□□□□ -0.89
HJURP-201ENST00000373395 SHISA7A6NL88 538 aa9.47□□□□□ -0.89
HJURP-201ENST00000373395 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa9.47□□□□□ -0.89
HJURP-201ENST00000373395 EPHB6O15197 1021 aa9.47□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24 ms