RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368547.3

ECHS1-201, Transcript of enoyl-CoA hydratase, short chain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ECHS1, Length 1,617 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1-201ENST00000368547 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP30.78■■■□□ 2.52
ECHS1-201ENST00000368547 FAM172AQ8WUF8 416 aa30.78■■■□□ 2.52
ECHS1-201ENST00000368547 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP30.78■■■□□ 2.52
ECHS1-201ENST00000368547 GKN1Q9NS71 199 aa30.78■■■□□ 2.52
ECHS1-201ENST00000368547 IRAK2O43187 625 aa30.77■■■□□ 2.52
ECHS1-201ENST00000368547 GBP1P32455 592 aa30.77■■■□□ 2.52
ECHS1-201ENST00000368547 AMPD2Q01433 879 aa30.77■■■□□ 2.52
ECHS1-201ENST00000368547 RAB6CQ53S08 254 aa30.77■■■□□ 2.52
ECHS1-201ENST00000368547 BNIPLQ7Z465 357 aa30.77■■■□□ 2.52
ECHS1-201ENST00000368547 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP30.77■■■□□ 2.52
ECHS1-201ENST00000368547 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP30.77■■■□□ 2.52
ECHS1-201ENST00000368547 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP30.77■■■□□ 2.52
ECHS1-201ENST00000368547 RAB6CQ9H0N0 254 aa30.77■■■□□ 2.52
ECHS1-201ENST00000368547 PRAMEF12O95522 483 aa30.76■■■□□ 2.52
ECHS1-201ENST00000368547 PRLRP16471 622 aa30.76■■■□□ 2.52
ECHS1-201ENST00000368547 DESP17661 470 aa30.76■■■□□ 2.52
ECHS1-201ENST00000368547 SP100P23497 879 aaPredicted RBP30.76■■■□□ 2.52
ECHS1-201ENST00000368547 TERF1P54274 439 aa30.76■■■□□ 2.52
ECHS1-201ENST00000368547 ZXDBP98169 803 aa30.76■■■□□ 2.52
ECHS1-201ENST00000368547 DEUP1Q05D60 604 aa30.76■■■□□ 2.52
ECHS1-201ENST00000368547 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP30.76■■■□□ 2.52
ECHS1-201ENST00000368547 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP30.76■■■□□ 2.52
ECHS1-201ENST00000368547 MESDQ14696 234 aa30.76■■■□□ 2.52
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ECHS1-201ENST00000368547 STRADAQ7RTN6 431 aa30.76■■■□□ 2.52
ECHS1-201ENST00000368547 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP30.76■■■□□ 2.52
ECHS1-201ENST00000368547 ASB16Q96NS5 453 aa30.76■■■□□ 2.52
ECHS1-201ENST00000368547 PIGVQ9NUD9 493 aa30.76■■■□□ 2.52
ECHS1-201ENST00000368547 TDP1Q9NUW8 608 aa30.76■■■□□ 2.52
ECHS1-201ENST00000368547 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa30.76■■■□□ 2.52
ECHS1-201ENST00000368547 CCL26Q9Y258 94 aa30.76■■■□□ 2.52
ECHS1-201ENST00000368547 TLR6Q9Y2C9 796 aa30.76■■■□□ 2.52
ECHS1-201ENST00000368547 MRFAP1Q9Y605 127 aa30.76■■■□□ 2.52
ECHS1-201ENST00000368547 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa30.76■■■□□ 2.51
ECHS1-201ENST00000368547 ENDOD1O94919 500 aa30.76■■■□□ 2.51
ECHS1-201ENST00000368547 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP30.76■■■□□ 2.51
ECHS1-201ENST00000368547 HMBSP08397 361 aa30.76■■■□□ 2.51
ECHS1-201ENST00000368547 LAMP2P13473 410 aa30.76■■■□□ 2.51
ECHS1-201ENST00000368547 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP30.76■■■□□ 2.51
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ECHS1-201ENST00000368547 OTOP3Q7RTS5 596 aa30.76■■■□□ 2.51
ECHS1-201ENST00000368547 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP30.76■■■□□ 2.51
ECHS1-201ENST00000368547 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP30.76■■■□□ 2.51
ECHS1-201ENST00000368547 F9P00740 461 aa30.75■■■□□ 2.51
ECHS1-201ENST00000368547 WEE1P30291 646 aa30.75■■■□□ 2.51
ECHS1-201ENST00000368547 RDXP35241 583 aaKnown RBP30.75■■■□□ 2.51
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ECHS1-201ENST00000368547 COG7P83436 770 aa30.75■■■□□ 2.51
ECHS1-201ENST00000368547 NNTQ13423 1086 aa30.75■■■□□ 2.51
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ECHS1-201ENST00000368547 NIPA2Q8N8Q9 360 aa30.75■■■□□ 2.51
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ECHS1-201ENST00000368547 LCMT1Q9UIC8 334 aa30.75■■■□□ 2.51
ECHS1-201ENST00000368547 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP30.74■■■□□ 2.51
ECHS1-201ENST00000368547 PROSCO94903 275 aa30.74■■■□□ 2.51
ECHS1-201ENST00000368547 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP30.74■■■□□ 2.51
ECHS1-201ENST00000368547 HDAC4P56524 1084 aa30.74■■■□□ 2.51
ECHS1-201ENST00000368547 MEI1Q5TIA1 1274 aa30.74■■■□□ 2.51
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ECHS1-201ENST00000368547 C11orf63Q6NUN7 778 aa30.74■■■□□ 2.51
ECHS1-201ENST00000368547 TTC16Q8NEE8 873 aa30.74■■■□□ 2.51
ECHS1-201ENST00000368547 CDC23Q9UJX2 597 aa30.74■■■□□ 2.51
ECHS1-201ENST00000368547 USTQ9Y2C2 406 aa30.74■■■□□ 2.51
ECHS1-201ENST00000368547 SAR1BQ9Y6B6 198 aa30.74■■■□□ 2.51
ECHS1-201ENST00000368547 ENC1O14682 589 aa30.73■■■□□ 2.51
ECHS1-201ENST00000368547 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP30.73■■■□□ 2.51
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ECHS1-201ENST00000368547 KCNQ1P51787 676 aa30.73■■■□□ 2.51
ECHS1-201ENST00000368547 ACAP1Q15027 740 aa30.73■■■□□ 2.51
ECHS1-201ENST00000368547 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP30.73■■■□□ 2.51
ECHS1-201ENST00000368547 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa30.73■■■□□ 2.51
ECHS1-201ENST00000368547 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa30.73■■■□□ 2.51
ECHS1-201ENST00000368547 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP30.73■■■□□ 2.51
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ECHS1-201ENST00000368547 FAM50BQ9Y247 325 aa30.73■■■□□ 2.51
ECHS1-201ENST00000368547 STC2O76061 302 aa30.73■■■□□ 2.51
ECHS1-201ENST00000368547 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP30.73■■■□□ 2.51
ECHS1-201ENST00000368547 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP30.73■■■□□ 2.51
ECHS1-201ENST00000368547 SH3RF2Q8TEC5 729 aa30.73■■■□□ 2.51
ECHS1-201ENST00000368547 RNF34Q969K3 372 aa30.73■■■□□ 2.51
ECHS1-201ENST00000368547 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP30.73■■■□□ 2.51
ECHS1-201ENST00000368547 SLC39A13Q96H72 371 aa30.73■■■□□ 2.51
ECHS1-201ENST00000368547 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP30.73■■■□□ 2.51
ECHS1-201ENST00000368547 SNX12Q9UMY4 172 aa30.73■■■□□ 2.51
ECHS1-201ENST00000368547 LEFTY2O00292 366 aa30.72■■■□□ 2.51
ECHS1-201ENST00000368547 LRCH4O75427 683 aa30.72■■■□□ 2.51
ECHS1-201ENST00000368547 IGLV3-27P01718 113 aa30.72■■■□□ 2.51
ECHS1-201ENST00000368547 CXCR3P49682 368 aa30.72■■■□□ 2.51
ECHS1-201ENST00000368547 RING1Q06587 406 aa30.72■■■□□ 2.51
ECHS1-201ENST00000368547 DAAM2Q86T65 1068 aa30.72■■■□□ 2.51
ECHS1-201ENST00000368547 FAM131BQ86XD5 332 aa30.72■■■□□ 2.51
ECHS1-201ENST00000368547 CPNE8Q86YQ8 564 aa30.72■■■□□ 2.51
ECHS1-201ENST00000368547 WBP2Q969T9 261 aa30.72■■■□□ 2.51
ECHS1-201ENST00000368547 PLD4Q96BZ4 506 aa30.72■■■□□ 2.51
ECHS1-201ENST00000368547 TLR10Q9BXR5 811 aa30.72■■■□□ 2.51
ECHS1-201ENST00000368547 GOLPH3Q9H4A6 298 aa30.72■■■□□ 2.51
ECHS1-201ENST00000368547 TRPV4Q9HBA0 871 aa30.72■■■□□ 2.51
ECHS1-201ENST00000368547 CFAP97Q9P2B7 532 aa30.72■■■□□ 2.51
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