RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355233.9

PTPRD-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 8,251 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-201ENST00000355233 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
PTPRD-201ENST00000355233 CCDC103Q8IW40 242 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRD-201ENST00000355233 ARHGEF19Q8IW93 802 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRD-201ENST00000355233 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
PTPRD-201ENST00000355233 SPATA18Q8TC71 538 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRD-201ENST00000355233 GORASP1Q9BQQ3 440 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRD-201ENST00000355233 UBXN6Q9BZV1 441 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRD-201ENST00000355233 RGS18Q9NS28 235 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRD-201ENST00000355233 GNPTGQ9UJJ9 305 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRD-201ENST00000355233 C2CD2LO14523 706 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRD-201ENST00000355233 AIREO43918 545 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRD-201ENST00000355233 IL6P05231 212 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRD-201ENST00000355233 AP1S2P56377 157 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRD-201ENST00000355233 PRAMEP78395 509 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRD-201ENST00000355233 SQLEQ14534 574 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRD-201ENST00000355233 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRD-201ENST00000355233 ERICH5Q6P6B1 374 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRD-201ENST00000355233 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRD-201ENST00000355233 DYMQ7RTS9 669 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRD-201ENST00000355233 RNF180Q86T96 592 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRD-201ENST00000355233 SVOPLQ8N434 492 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRD-201ENST00000355233 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
PTPRD-201ENST00000355233 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
PTPRD-201ENST00000355233 EHD4Q9H223 541 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRD-201ENST00000355233 MROH8Q9H579 483 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRD-201ENST00000355233 TRIP11Q15643 1979 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRD-201ENST00000355233 ZBBXA8MT70 800 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRD-201ENST00000355233 MEI4A8MW99 385 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRD-201ENST00000355233 CFLARO15519 480 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRD-201ENST00000355233 DNAJB6O75190 326 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRD-201ENST00000355233 RGS20O76081 388 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRD-201ENST00000355233 UNC5CO95185 931 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRD-201ENST00000355233 EGFRP00533 1210 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRD-201ENST00000355233 PENKP01210 267 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
PTPRD-201ENST00000355233 FTLP02792 175 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
PTPRD-201ENST00000355233 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
PTPRD-201ENST00000355233 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRD-201ENST00000355233 ZCCHC18P0CG32 403 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRD-201ENST00000355233 STAG3L1P0CL83 205 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRD-201ENST00000355233 ZNF18P17022 549 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRD-201ENST00000355233 HIST1H2ADP20671 130 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRD-201ENST00000355233 AKT1P31749 480 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRD-201ENST00000355233 OAZ1P54368 228 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRD-201ENST00000355233 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
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PTPRD-201ENST00000355233 SMARCB1Q12824 385 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRD-201ENST00000355233 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
PTPRD-201ENST00000355233 KATNAL2Q8IYT4 538 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRD-201ENST00000355233 SPICE1Q8N0Z3 855 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRD-201ENST00000355233 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
PTPRD-201ENST00000355233 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
PTPRD-201ENST00000355233 ZNF333Q96JL9 665 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRD-201ENST00000355233 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRD-201ENST00000355233 CNDP1Q96KN2 507 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRD-201ENST00000355233 HIST1H2AJQ99878 128 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRD-201ENST00000355233 H2AFJQ9BTM1 129 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRD-201ENST00000355233 EVA1AQ9H8M9 152 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRD-201ENST00000355233 RAB23Q9ULC3 237 aa5.04□□□□□ -1.6
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PTPRD-201ENST00000355233 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
PTPRD-201ENST00000355233 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
PTPRD-201ENST00000355233 GALNT13Q8IUC8 556 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRD-201ENST00000355233 SLC9A9Q8IVB4 645 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRD-201ENST00000355233 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
PTPRD-201ENST00000355233 FLCNQ8NFG4 579 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRD-201ENST00000355233 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
PTPRD-201ENST00000355233 CALN1Q9BXU9 219 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRD-201ENST00000355233 BLZF1Q9H2G9 400 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRD-201ENST00000355233 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
PTPRD-201ENST00000355233 KCNJ14Q9UNX9 436 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRD-201ENST00000355233 PGK2P07205 417 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRD-201ENST00000355233 RRM1P23921 792 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRD-201ENST00000355233 ADARP55265 1226 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
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PTPRD-201ENST00000355233 ITPK1Q13572 414 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRD-201ENST00000355233 KCNT1Q5JUK3 1230 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRD-201ENST00000355233 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
PTPRD-201ENST00000355233 PEG10Q86TG7 708 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
PTPRD-201ENST00000355233 TBC1D21Q8IYX1 336 aa5.04□□□□□ -1.6
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PTPRD-201ENST00000355233 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
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PTPRD-201ENST00000355233 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
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PTPRD-201ENST00000355233 MORF4L1Q9UBU8 362 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRD-201ENST00000355233 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
PTPRD-201ENST00000355233 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
PTPRD-201ENST00000355233 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
PTPRD-201ENST00000355233 FAM205AQ6ZU69 1335 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRD-201ENST00000355233 DENND3A2RUS2 1198 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRD-201ENST00000355233 UGT2B11O75310 529 aa5.04□□□□□ -1.6
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