RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000335475.5

KCNQ1-202, Transcript of potassium voltage-gated channel subfamily Q member 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene KCNQ1, Length 2,159 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1-202ENST00000335475 KRT16P08779 473 aa21.47■■□□□ 1.03
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KCNQ1-202ENST00000335475 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
KCNQ1-202ENST00000335475 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa21.47■■□□□ 1.03
KCNQ1-202ENST00000335475 KIAA0319Q5VV43 1072 aa21.47■■□□□ 1.03
KCNQ1-202ENST00000335475 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
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KCNQ1-202ENST00000335475 ZNF398Q8TD17 642 aa21.47■■□□□ 1.03
KCNQ1-202ENST00000335475 NPY6RQ99463 290 aa21.47■■□□□ 1.03
KCNQ1-202ENST00000335475 NOD2Q9HC29 1040 aa21.47■■□□□ 1.03
KCNQ1-202ENST00000335475 HACD1B0YJ81 288 aa21.46■■□□□ 1.03
KCNQ1-202ENST00000335475 TRIM49D1C9J1S8 452 aa21.46■■□□□ 1.03
KCNQ1-202ENST00000335475 C2CD2LO14523 706 aa21.46■■□□□ 1.03
KCNQ1-202ENST00000335475 GABRDO14764 452 aa21.46■■□□□ 1.03
KCNQ1-202ENST00000335475 DCTN3O75935 186 aa21.46■■□□□ 1.03
KCNQ1-202ENST00000335475 CSH1P0DML2 217 aa21.46■■□□□ 1.03
KCNQ1-202ENST00000335475 CSH2P0DML3 217 aa21.46■■□□□ 1.03
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KCNQ1-202ENST00000335475 KCTD13Q8WZ19 329 aa21.46■■□□□ 1.03
KCNQ1-202ENST00000335475 FAM149B1Q96BN6 582 aa21.46■■□□□ 1.03
KCNQ1-202ENST00000335475 FAM111AQ96PZ2 611 aa21.46■■□□□ 1.03
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KCNQ1-202ENST00000335475 MANSC1Q9H8J5 431 aa21.46■■□□□ 1.03
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KCNQ1-202ENST00000335475 UGT1A9O60656 530 aa21.46■■□□□ 1.03
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KCNQ1-202ENST00000335475 HTR3CQ8WXA8 447 aa21.46■■□□□ 1.03
KCNQ1-202ENST00000335475 ZFP42Q96MM3 310 aa21.46■■□□□ 1.03
KCNQ1-202ENST00000335475 SLC2A13Q96QE2 648 aa21.46■■□□□ 1.03
KCNQ1-202ENST00000335475 LRRC37BQ96QE4 947 aa21.46■■□□□ 1.03
KCNQ1-202ENST00000335475 UGT1A7Q9HAW7 530 aa21.46■■□□□ 1.03
KCNQ1-202ENST00000335475 UGT1A10Q9HAW8 530 aa21.46■■□□□ 1.03
KCNQ1-202ENST00000335475 UGT1A8Q9HAW9 530 aa21.46■■□□□ 1.03
KCNQ1-202ENST00000335475 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa21.46■■□□□ 1.03
KCNQ1-202ENST00000335475 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
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KCNQ1-202ENST00000335475 CYB561D2O14569 222 aa21.45■■□□□ 1.02
KCNQ1-202ENST00000335475 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
KCNQ1-202ENST00000335475 ARL4AP40617 200 aa21.45■■□□□ 1.02
KCNQ1-202ENST00000335475 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
KCNQ1-202ENST00000335475 NME8Q8N427 588 aa21.45■■□□□ 1.02
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KCNQ1-202ENST00000335475 SPATA13Q96N96 652 aa21.45■■□□□ 1.02
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KCNQ1-202ENST00000335475 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP21.45■■□□□ 1.02
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KCNQ1-202ENST00000335475 NDUFV1P49821 464 aa21.44■■□□□ 1.02
KCNQ1-202ENST00000335475 PURAQ00577 322 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
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KCNQ1-202ENST00000335475 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa21.44■■□□□ 1.02
KCNQ1-202ENST00000335475 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa21.44■■□□□ 1.02
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KCNQ1-202ENST00000335475 NLRP9Q7RTR0 991 aa21.44■■□□□ 1.02
KCNQ1-202ENST00000335475 RNF139Q8WU17 664 aa21.44■■□□□ 1.02
KCNQ1-202ENST00000335475 MKS1Q9NXB0 559 aa21.44■■□□□ 1.02
KCNQ1-202ENST00000335475 CACNG4Q9UBN1 327 aa21.44■■□□□ 1.02
KCNQ1-202ENST00000335475 Q9Y3F1 56 aa21.44■■□□□ 1.02
KCNQ1-202ENST00000335475 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa21.44■■□□□ 1.02
KCNQ1-202ENST00000335475 NUMBLQ9Y6R0 609 aa21.44■■□□□ 1.02
KCNQ1-202ENST00000335475 MEIS3P2A8K0S8 358 aa21.44■■□□□ 1.02
KCNQ1-202ENST00000335475 RFPL1O75677 317 aa21.44■■□□□ 1.02
KCNQ1-202ENST00000335475 SPDYAQ5MJ70 313 aa21.44■■□□□ 1.02
KCNQ1-202ENST00000335475 FYB2Q5VWT5 728 aa21.44■■□□□ 1.02
KCNQ1-202ENST00000335475 HFE2Q6ZVN8 426 aa21.44■■□□□ 1.02
KCNQ1-202ENST00000335475 RFWD2Q8NHY2 731 aa21.44■■□□□ 1.02
KCNQ1-202ENST00000335475 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
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KCNQ1-202ENST00000335475 LRMDAQ9H2I8 198 aa21.44■■□□□ 1.02
KCNQ1-202ENST00000335475 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa21.44■■□□□ 1.02
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KCNQ1-202ENST00000335475 KRT37O76014 449 aa21.43■■□□□ 1.02
KCNQ1-202ENST00000335475 FAM163BP0C2L3 166 aa21.43■■□□□ 1.02
KCNQ1-202ENST00000335475 ALDH3A1P30838 453 aa21.43■■□□□ 1.02
KCNQ1-202ENST00000335475 NBPF20Q3BBV1 942 aa21.43■■□□□ 1.02
KCNQ1-202ENST00000335475 SYPL2Q5VXT5 272 aa21.43■■□□□ 1.02
KCNQ1-202ENST00000335475 STEAP4Q687X5 459 aa21.43■■□□□ 1.02
KCNQ1-202ENST00000335475 RNF169Q8NCN4 708 aa21.43■■□□□ 1.02
KCNQ1-202ENST00000335475 GSTCDQ8NEC7 633 aa21.43■■□□□ 1.02
KCNQ1-202ENST00000335475 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
KCNQ1-202ENST00000335475 AP5M1Q9H0R1 490 aa21.43■■□□□ 1.02
KCNQ1-202ENST00000335475 CRTAC1Q9NQ79 661 aa21.43■■□□□ 1.02
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