RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000271628.8

SF3B4-201, Transcript of splicing factor 3b subunit 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SF3B4, Length 2,085 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B4-201ENST00000271628 LRRTM3Q86VH5 581 aa15.87■□□□□ 0.13
SF3B4-201ENST00000271628 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
SF3B4-201ENST00000271628 DBF4BQ8NFT6 615 aa15.87■□□□□ 0.13
SF3B4-201ENST00000271628 SEPT8Q92599 483 aa15.87■□□□□ 0.13
SF3B4-201ENST00000271628 NTAN1Q96AB6 310 aa15.87■□□□□ 0.13
SF3B4-201ENST00000271628 CHMP6Q96FZ7 201 aa15.87■□□□□ 0.13
SF3B4-201ENST00000271628 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
SF3B4-201ENST00000271628 UNC93B1Q9H1C4 597 aa15.87■□□□□ 0.13
SF3B4-201ENST00000271628 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
SF3B4-201ENST00000271628 TMLHEQ9NVH6 421 aa15.87■□□□□ 0.13
SF3B4-201ENST00000271628 USP3Q9Y6I4 520 aa15.87■□□□□ 0.13
SF3B4-201ENST00000271628 H3BRJ5 948 aa15.86■□□□□ 0.13
SF3B4-201ENST00000271628 KCNN4O15554 427 aa15.86■□□□□ 0.13
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SF3B4-201ENST00000271628 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
SF3B4-201ENST00000271628 FBXW10Q5XX13 1052 aa15.86■□□□□ 0.13
SF3B4-201ENST00000271628 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
SF3B4-201ENST00000271628 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
SF3B4-201ENST00000271628 C9orf72Q96LT7 481 aa15.86■□□□□ 0.13
SF3B4-201ENST00000271628 PIGVQ9NUD9 493 aa15.86■□□□□ 0.13
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SF3B4-201ENST00000271628 SYN3O14994 580 aa15.85■□□□□ 0.13
SF3B4-201ENST00000271628 TADA2AO75478 443 aa15.85■□□□□ 0.13
SF3B4-201ENST00000271628 GOT1P17174 413 aa15.85■□□□□ 0.13
SF3B4-201ENST00000271628 RBL1P28749 1068 aa15.85■□□□□ 0.13
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SF3B4-201ENST00000271628 BASP1P80723 227 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
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SF3B4-201ENST00000271628 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa15.85■□□□□ 0.13
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SF3B4-201ENST00000271628 TAX1BP1Q86VP1 789 aa15.85■□□□□ 0.13
SF3B4-201ENST00000271628 TMEM209Q96SK2 561 aa15.85■□□□□ 0.13
SF3B4-201ENST00000271628 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa15.85■□□□□ 0.13
SF3B4-201ENST00000271628 COX16Q9P0S2 106 aa15.85■□□□□ 0.13
SF3B4-201ENST00000271628 SMIM23A6NLE4 172 aa15.85■□□□□ 0.13
SF3B4-201ENST00000271628 HACD1B0YJ81 288 aa15.85■□□□□ 0.13
SF3B4-201ENST00000271628 CHADO15335 359 aa15.85■□□□□ 0.13
SF3B4-201ENST00000271628 HOXA2O43364 376 aa15.85■□□□□ 0.13
SF3B4-201ENST00000271628 PARNO95453 639 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
SF3B4-201ENST00000271628 DRD4P21917 467 aa15.85■□□□□ 0.13
SF3B4-201ENST00000271628 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
SF3B4-201ENST00000271628 SCAPQ12770 1279 aa15.85■□□□□ 0.13
SF3B4-201ENST00000271628 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa15.85■□□□□ 0.13
SF3B4-201ENST00000271628 BHLHA9Q7RTU4 235 aa15.85■□□□□ 0.13
SF3B4-201ENST00000271628 ZBED8Q8IZ13 594 aa15.85■□□□□ 0.13
SF3B4-201ENST00000271628 PDIK1LQ8N165 341 aa15.85■□□□□ 0.13
SF3B4-201ENST00000271628 PYROXD2Q8N2H3 581 aa15.85■□□□□ 0.13
SF3B4-201ENST00000271628 RNF139Q8WU17 664 aa15.85■□□□□ 0.13
SF3B4-201ENST00000271628 FERMT1Q9BQL6 677 aa15.85■□□□□ 0.13
SF3B4-201ENST00000271628 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa15.85■□□□□ 0.13
SF3B4-201ENST00000271628 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
SF3B4-201ENST00000271628 FBXW11Q9UKB1 542 aa15.85■□□□□ 0.13
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SF3B4-201ENST00000271628 B4GALT3O60512 393 aa15.84■□□□□ 0.13
SF3B4-201ENST00000271628 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP15.84■□□□□ 0.13
SF3B4-201ENST00000271628 AMPD1P23109 780 aa15.84■□□□□ 0.13
SF3B4-201ENST00000271628 GRIK1P39086 918 aa15.84■□□□□ 0.13
SF3B4-201ENST00000271628 SLCO1A2P46721 670 aa15.84■□□□□ 0.13
SF3B4-201ENST00000271628 RABGGTBP53611 331 aa15.84■□□□□ 0.13
SF3B4-201ENST00000271628 GBE1Q04446 702 aa15.84■□□□□ 0.13
SF3B4-201ENST00000271628 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP15.84■□□□□ 0.13
SF3B4-201ENST00000271628 GPNMBQ14956 572 aa15.84■□□□□ 0.13
SF3B4-201ENST00000271628 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP15.84■□□□□ 0.13
SF3B4-201ENST00000271628 LONRF1Q17RB8 773 aa15.84■□□□□ 0.13
SF3B4-201ENST00000271628 SLC45A4Q5BKX6 768 aa15.84■□□□□ 0.13
SF3B4-201ENST00000271628 BSPRYQ5W0U4 402 aa15.84■□□□□ 0.13
SF3B4-201ENST00000271628 CCDC13Q8IYE1 715 aa15.84■□□□□ 0.13
SF3B4-201ENST00000271628 MDM1Q8TC05 714 aa15.84■□□□□ 0.13
SF3B4-201ENST00000271628 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP15.84■□□□□ 0.13
SF3B4-201ENST00000271628 DEFB118Q96PH6 123 aa15.84■□□□□ 0.13
SF3B4-201ENST00000271628 COLEC11Q9BWP8 271 aa15.84■□□□□ 0.13
SF3B4-201ENST00000271628 CCDC134Q9H6E4 229 aa15.84■□□□□ 0.13
SF3B4-201ENST00000271628 PPCSQ9HAB8 311 aa15.84■□□□□ 0.13
SF3B4-201ENST00000271628 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP15.84■□□□□ 0.13
SF3B4-201ENST00000271628 DDIT4Q9NX09 232 aa15.84■□□□□ 0.13
SF3B4-201ENST00000271628 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP15.84■□□□□ 0.13
SF3B4-201ENST00000271628 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP15.84■□□□□ 0.13
SF3B4-201ENST00000271628 OGDHLQ9ULD0 1010 aa15.84■□□□□ 0.13
SF3B4-201ENST00000271628 LRFN2Q9ULH4 789 aa15.84■□□□□ 0.13
SF3B4-201ENST00000271628 PTPRDP23468 1912 aa15.84■□□□□ 0.13
SF3B4-201ENST00000271628 VGLL3A8MV65 326 aa15.83■□□□□ 0.13
SF3B4-201ENST00000271628 CDH16O75309 829 aa15.83■□□□□ 0.13
SF3B4-201ENST00000271628 ALDH2P05091 517 aa15.83■□□□□ 0.13
SF3B4-201ENST00000271628 CHN1P15882 459 aa15.83■□□□□ 0.13
SF3B4-201ENST00000271628 HTRA3P83110 453 aa15.83■□□□□ 0.13
SF3B4-201ENST00000271628 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP15.83■□□□□ 0.13
SF3B4-201ENST00000271628 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP15.83■□□□□ 0.13
SF3B4-201ENST00000271628 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP15.83■□□□□ 0.13
SF3B4-201ENST00000271628 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP15.83■□□□□ 0.13
SF3B4-201ENST00000271628 PYROXD1Q8WU10 500 aa15.83■□□□□ 0.13
SF3B4-201ENST00000271628 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP15.83■□□□□ 0.13
SF3B4-201ENST00000271628 BEGAINQ9BUH8 593 aa15.83■□□□□ 0.13
SF3B4-201ENST00000271628 MAGEB5Q9BZ81 275 aa15.83■□□□□ 0.13
SF3B4-201ENST00000271628 KLC2Q9H0B6 622 aa15.83■□□□□ 0.13
SF3B4-201ENST00000271628 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa15.83■□□□□ 0.13
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