RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000267488.8

SLC38A6-201, Transcript of solute carrier family 38 member 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SLC38A6, Length 1,688 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A6-201ENST00000267488 ITFG1Q8TB96 612 aa14.9□□□□□ -0.02
SLC38A6-201ENST00000267488 ADAM32Q8TC27 787 aa14.9□□□□□ -0.02
SLC38A6-201ENST00000267488 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
SLC38A6-201ENST00000267488 PIGVQ9NUD9 493 aa14.9□□□□□ -0.02
SLC38A6-201ENST00000267488 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP14.9□□□□□ -0.02
SLC38A6-201ENST00000267488 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa14.9□□□□□ -0.02
SLC38A6-201ENST00000267488 AMFRQ9UKV5 643 aa14.9□□□□□ -0.02
SLC38A6-201ENST00000267488 USTQ9Y2C2 406 aa14.9□□□□□ -0.02
SLC38A6-201ENST00000267488 MDM4O15151 490 aa14.89□□□□□ -0.03
SLC38A6-201ENST00000267488 SPOPO43791 374 aa14.89□□□□□ -0.03
SLC38A6-201ENST00000267488 CKMP06732 381 aa14.89□□□□□ -0.03
SLC38A6-201ENST00000267488 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
SLC38A6-201ENST00000267488 CEBPBP17676 345 aa14.89□□□□□ -0.03
SLC38A6-201ENST00000267488 MIPP30301 263 aa14.89□□□□□ -0.03
SLC38A6-201ENST00000267488 AVPR1AP37288 418 aa14.89□□□□□ -0.03
SLC38A6-201ENST00000267488 MTA1Q13330 715 aa14.89□□□□□ -0.03
SLC38A6-201ENST00000267488 TUBB2AQ13885 445 aa14.89□□□□□ -0.03
SLC38A6-201ENST00000267488 PPP2R5DQ14738 602 aa14.89□□□□□ -0.03
SLC38A6-201ENST00000267488 BRMS1LQ5PSV4 323 aa14.89□□□□□ -0.03
SLC38A6-201ENST00000267488 STXBP5Q5T5C0 1151 aa14.89□□□□□ -0.03
SLC38A6-201ENST00000267488 MIB1Q86YT6 1006 aa14.89□□□□□ -0.03
SLC38A6-201ENST00000267488 SLC39A13Q96H72 371 aa14.89□□□□□ -0.03
SLC38A6-201ENST00000267488 CYP2S1Q96SQ9 504 aa14.89□□□□□ -0.03
SLC38A6-201ENST00000267488 TUBB2BQ9BVA1 445 aa14.89□□□□□ -0.03
SLC38A6-201ENST00000267488 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
SLC38A6-201ENST00000267488 GOLPH3Q9H4A6 298 aa14.89□□□□□ -0.03
SLC38A6-201ENST00000267488 WDCPQ9H6R7 721 aa14.89□□□□□ -0.03
SLC38A6-201ENST00000267488 USP18Q9UMW8 372 aa14.89□□□□□ -0.03
SLC38A6-201ENST00000267488 MYOFQ9NZM1 2061 aa14.88□□□□□ -0.03
SLC38A6-201ENST00000267488 SLC12A8A0AV02 714 aa14.88□□□□□ -0.03
SLC38A6-201ENST00000267488 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
SLC38A6-201ENST00000267488 MSI1O43347 362 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
SLC38A6-201ENST00000267488 PRPSAP2O60256 369 aa14.88□□□□□ -0.03
SLC38A6-201ENST00000267488 IGLV3-27P01718 113 aa14.88□□□□□ -0.03
SLC38A6-201ENST00000267488 CCR1P32246 355 aa14.88□□□□□ -0.03
SLC38A6-201ENST00000267488 TBX4P57082 545 aa14.88□□□□□ -0.03
SLC38A6-201ENST00000267488 LRRC38Q5VT99 294 aa14.88□□□□□ -0.03
SLC38A6-201ENST00000267488 POLNQ7Z5Q5 900 aa14.88□□□□□ -0.03
SLC38A6-201ENST00000267488 UNC45BQ8IWX7 931 aa14.88□□□□□ -0.03
SLC38A6-201ENST00000267488 RHOT1Q8IXI2 618 aa14.88□□□□□ -0.03
SLC38A6-201ENST00000267488 SUSD6Q92537 303 aa14.88□□□□□ -0.03
SLC38A6-201ENST00000267488 CD101Q93033 1021 aa14.88□□□□□ -0.03
SLC38A6-201ENST00000267488 NTAN1Q96AB6 310 aa14.88□□□□□ -0.03
SLC38A6-201ENST00000267488 PLD4Q96BZ4 506 aa14.88□□□□□ -0.03
SLC38A6-201ENST00000267488 SLC22A12Q96S37 553 aa14.88□□□□□ -0.03
SLC38A6-201ENST00000267488 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa14.88□□□□□ -0.03
SLC38A6-201ENST00000267488 GDE1Q9NZC3 331 aa14.88□□□□□ -0.03
SLC38A6-201ENST00000267488 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
SLC38A6-201ENST00000267488 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa14.88□□□□□ -0.03
SLC38A6-201ENST00000267488 JRKLQ9Y4A0 524 aa14.88□□□□□ -0.03
SLC38A6-201ENST00000267488 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa14.87□□□□□ -0.03
SLC38A6-201ENST00000267488 PSTPIP1O43586 416 aa14.87□□□□□ -0.03
SLC38A6-201ENST00000267488 KRT7P08729 469 aa14.87□□□□□ -0.03
SLC38A6-201ENST00000267488 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
SLC38A6-201ENST00000267488 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
SLC38A6-201ENST00000267488 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
SLC38A6-201ENST00000267488 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
SLC38A6-201ENST00000267488 ARL13BQ3SXY8 428 aa14.87□□□□□ -0.03
SLC38A6-201ENST00000267488 RAB6CQ53S08 254 aa14.87□□□□□ -0.03
SLC38A6-201ENST00000267488 BOLA3Q53S33 107 aa14.87□□□□□ -0.03
SLC38A6-201ENST00000267488 MEI1Q5TIA1 1274 aa14.87□□□□□ -0.03
SLC38A6-201ENST00000267488 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa14.87□□□□□ -0.03
SLC38A6-201ENST00000267488 NUGGCQ68CJ6 796 aa14.87□□□□□ -0.03
SLC38A6-201ENST00000267488 SCYL2Q6P3W7 929 aa14.87□□□□□ -0.03
SLC38A6-201ENST00000267488 FAM131BQ86XD5 332 aa14.87□□□□□ -0.03
SLC38A6-201ENST00000267488 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP14.87□□□□□ -0.03
SLC38A6-201ENST00000267488 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
SLC38A6-201ENST00000267488 NPAS3Q8IXF0 933 aa14.87□□□□□ -0.03
SLC38A6-201ENST00000267488 SLC35F6Q8N357 371 aa14.87□□□□□ -0.03
SLC38A6-201ENST00000267488 MNS1Q8NEH6 495 aa14.87□□□□□ -0.03
SLC38A6-201ENST00000267488 ING5Q8WYH8 240 aa14.87□□□□□ -0.03
SLC38A6-201ENST00000267488 FGF13Q92913 245 aa14.87□□□□□ -0.03
SLC38A6-201ENST00000267488 HLA-CQ95604 372 aa14.87□□□□□ -0.03
SLC38A6-201ENST00000267488 RNF34Q969K3 372 aa14.87□□□□□ -0.03
SLC38A6-201ENST00000267488 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
SLC38A6-201ENST00000267488 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
SLC38A6-201ENST00000267488 RAB6CQ9H0N0 254 aa14.87□□□□□ -0.03
SLC38A6-201ENST00000267488 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa14.87□□□□□ -0.03
SLC38A6-201ENST00000267488 COX16Q9P0S2 106 aa14.87□□□□□ -0.03
SLC38A6-201ENST00000267488 CDH22Q9UJ99 828 aa14.87□□□□□ -0.03
SLC38A6-201ENST00000267488 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP14.87□□□□□ -0.03
SLC38A6-201ENST00000267488 HYOU1Q9Y4L1 999 aa14.87□□□□□ -0.03
SLC38A6-201ENST00000267488 MRFAP1Q9Y605 127 aa14.87□□□□□ -0.03
SLC38A6-201ENST00000267488 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
SLC38A6-201ENST00000267488 MYO10Q9HD67 2058 aa14.87□□□□□ -0.03
SLC38A6-201ENST00000267488 CCDC66A2RUB6 948 aa14.87□□□□□ -0.03
SLC38A6-201ENST00000267488 KCNU1A8MYU2 1149 aa14.87□□□□□ -0.03
SLC38A6-201ENST00000267488 FTCDO95954 541 aa14.87□□□□□ -0.03
SLC38A6-201ENST00000267488 TCF3P15923 654 aa14.87□□□□□ -0.03
SLC38A6-201ENST00000267488 KCNA5P22460 613 aa14.87□□□□□ -0.03
SLC38A6-201ENST00000267488 CTNNA2P26232 953 aa14.87□□□□□ -0.03
SLC38A6-201ENST00000267488 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
SLC38A6-201ENST00000267488 SSR1P43307 286 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
SLC38A6-201ENST00000267488 TAS2R40P59535 323 aa14.87□□□□□ -0.03
SLC38A6-201ENST00000267488 SCAPQ12770 1279 aa14.87□□□□□ -0.03
SLC38A6-201ENST00000267488 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
SLC38A6-201ENST00000267488 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
SLC38A6-201ENST00000267488 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
SLC38A6-201ENST00000267488 ERMARDQ5T6L9 678 aa14.87□□□□□ -0.03
SLC38A6-201ENST00000267488 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.1 ms