RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641425.1

CASC19-231, Transcript of cancer susceptibility 19, human

Gene CASC19, Length 1,156 nt, Biotype lincRNA.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CASC19-231	ENST00000641425	NAB2	Q15742	525 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CASC19-231	ENST00000641425	DUSP6	Q16828	381 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CASC19-231	ENST00000641425	DCAF4L1	Q3SXM0	396 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CASC19-231	ENST00000641425	DCLRE1A	Q6PJP8	1040 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CASC19-231	ENST00000641425	LIPI	Q6XZB0	460 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CASC19-231	ENST00000641425	SPATA31D4	Q6ZUB0	917 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CASC19-231	ENST00000641425	B3GNT8	Q7Z7M8	397 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CASC19-231	ENST00000641425	CEP57	Q86XR8	500 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CASC19-231	ENST00000641425	PALB2	Q86YC2	1186 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CASC19-231	ENST00000641425	NELFCD	Q8IXH7	590 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CASC19-231	ENST00000641425	CCDC65	Q8IXS2	484 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CASC19-231	ENST00000641425	CEP57L1	Q8IYX8	460 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CASC19-231	ENST00000641425	SYCP3	Q8IZU3	236 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CASC19-231	ENST00000641425	C12orf76	Q8N812	135 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CASC19-231	ENST00000641425	FSIP1	Q8NA03	581 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CASC19-231	ENST00000641425	VN1R2	Q8NFZ6	395 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CASC19-231	ENST00000641425	NOC3L	Q8WTT2	800 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CASC19-231	ENST00000641425	ATXN2L	Q8WWM7	1075 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CASC19-231	ENST00000641425	KLHL5	Q96PQ7	755 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CASC19-231	ENST00000641425	ASB2	Q96Q27	587 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CASC19-231	ENST00000641425	ACCS	Q96QU6	501 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CASC19-231	ENST00000641425	SPATA25	Q9BR10	227 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CASC19-231	ENST00000641425	STRA6	Q9BX79	667 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CASC19-231	ENST00000641425	TRIM9	Q9C026	710 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CASC19-231	ENST00000641425	LRRC27	Q9C0I9	530 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CASC19-231	ENST00000641425	SCAND2P	Q9GZW5	306 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CASC19-231	ENST00000641425	GOLPH3L	Q9H4A5	285 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CASC19-231	ENST00000641425	UBE2Z	Q9H832	354 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CASC19-231	ENST00000641425	SLC39A2	Q9NP94	309 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CASC19-231	ENST00000641425	NGRN	Q9NPE2	291 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CASC19-231	ENST00000641425	CLEC1B	Q9P126	229 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CASC19-231	ENST00000641425	THEG	Q9P2T0	379 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CASC19-231	ENST00000641425	BARX2	Q9UMQ3	279 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CASC19-231	ENST00000641425	COG5	Q9UP83	839 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CASC19-231	ENST00000641425	LZTS1	Q9Y250	596 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CASC19-231	ENST00000641425	ATP6V1D	Q9Y5K8	247 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CASC19-231	ENST00000641425	PHLPP2	Q6ZVD8	1323 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CASC19-231	ENST00000641425	SCN1A	P35498	2009 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CASC19-231	ENST00000641425	TRBV23OR9-2	A0A075B6M9	112 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CASC19-231	ENST00000641425		A0A0B4J269	797 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CASC19-231	ENST00000641425	PVALEF	A0A1B0GWK0	134 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CASC19-231	ENST00000641425	FRMD3	A2A2Y4	597 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CASC19-231	ENST00000641425	ANKRD34B	A5PLL1	514 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CASC19-231	ENST00000641425	GOLGA6L4	A6NEF3	574 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CASC19-231	ENST00000641425	HNRNPDL	O14979	420 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CASC19-231	ENST00000641425	INPPL1	O15357	1258 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CASC19-231	ENST00000641425	NCK2	O43639	380 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CASC19-231	ENST00000641425	PRICKLE3	O43900	615 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CASC19-231	ENST00000641425	B3GAT3	O94766	335 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CASC19-231	ENST00000641425	KCNH1	O95259	989 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CASC19-231	ENST00000641425	GLP2R	O95838	553 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CASC19-231	ENST00000641425	PIGR	P01833	764 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CASC19-231	ENST00000641425	SOD2	P04179	222 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CASC19-231	ENST00000641425	CNP	P09543	421 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CASC19-231	ENST00000641425	WEE2	P0C1S8	567 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CASC19-231	ENST00000641425	IL9	P15248	144 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CASC19-231	ENST00000641425	EPCAM	P16422	314 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CASC19-231	ENST00000641425	ADSS	P30520	456 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CASC19-231	ENST00000641425	HOXD13	P35453	343 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CASC19-231	ENST00000641425	PPM1A	P35813	382 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CASC19-231	ENST00000641425	NDUFV1	P49821	464 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CASC19-231	ENST00000641425	KRTAP10-2	P60368	255 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CASC19-231	ENST00000641425	GRIK3	Q13003	919 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CASC19-231	ENST00000641425	STK4	Q13043	487 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CASC19-231	ENST00000641425	HSP90AA2P	Q14568	343 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CASC19-231	ENST00000641425	SMC1A	Q14683	1233 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CASC19-231	ENST00000641425	BMS1	Q14692	1282 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CASC19-231	ENST00000641425	SLC9A5	Q14940	896 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CASC19-231	ENST00000641425	NOLC1	Q14978	699 aa	Known RBP eCLIP	4.97	□□□□□ -1.61
CASC19-231	ENST00000641425	UPP1	Q16831	310 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CASC19-231	ENST00000641425	LEXM	Q3ZCV2	418 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CASC19-231	ENST00000641425	XKR4	Q5GH76	650 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CASC19-231	ENST00000641425	L1TD1	Q5T7N2	865 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CASC19-231	ENST00000641425	FAM171A1	Q5VUB5	890 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CASC19-231	ENST00000641425	SLFN12L	Q6IEE8	588 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CASC19-231	ENST00000641425	KIAA1841	Q6NSI8	718 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CASC19-231	ENST00000641425	FUT10	Q6P4F1	479 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CASC19-231	ENST00000641425	SYCE2	Q6PIF2	218 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CASC19-231	ENST00000641425	PRSS55	Q6UWB4	352 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CASC19-231	ENST00000641425	CRELD2	Q6UXH1	353 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CASC19-231	ENST00000641425	UNC13D	Q70J99	1090 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CASC19-231	ENST00000641425	APBB1IP	Q7Z5R6	666 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CASC19-231	ENST00000641425	EFHB	Q8N7U6	833 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CASC19-231	ENST00000641425	NETO2	Q8NC67	525 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CASC19-231	ENST00000641425	USP33	Q8TEY7	942 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CASC19-231	ENST00000641425	RIN2	Q8WYP3	895 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CASC19-231	ENST00000641425	POMGNT1	Q8WZA1	660 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CASC19-231	ENST00000641425	ERCC4	Q92889	916 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CASC19-231	ENST00000641425	PABPC5	Q96DU9	382 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CASC19-231	ENST00000641425	SAAL1	Q96ER3	474 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CASC19-231	ENST00000641425	PEX11G	Q96HA9	241 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CASC19-231	ENST00000641425	SEC16B	Q96JE7	1060 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CASC19-231	ENST00000641425	NOX5	Q96PH1	765 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CASC19-231	ENST00000641425	PPP1R10	Q96QC0	940 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CASC19-231	ENST00000641425	FAM213A	Q9BRX8	229 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CASC19-231	ENST00000641425	MSTO1	Q9BUK6	570 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CASC19-231	ENST00000641425	ZBP1	Q9H171	429 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CASC19-231	ENST00000641425	TNMD	Q9H2S6	317 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CASC19-231	ENST00000641425	ACBD3	Q9H3P7	528 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CASC19-231	ENST00000641425	CUEDC2	Q9H467	287 aa		4.97	□□□□□ -1.61

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.6 ms