RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639895.1

SPIN3-231, Transcript of spindlin family member 3, human

TSL 5

Gene SPIN3, Length 4,234 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SPIN3-231	ENST00000639895	MYCLP1	P12525	358 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
SPIN3-231	ENST00000639895	GRK2	P25098	689 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SPIN3-231	ENST00000639895	MAPRE2	Q15555	327 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SPIN3-231	ENST00000639895	CCDC85B	Q15834	202 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
SPIN3-231	ENST00000639895	HABP4	Q5JVS0	413 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
SPIN3-231	ENST00000639895	ZBTB41	Q5SVQ8	909 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SPIN3-231	ENST00000639895	ZNF410	Q86VK4	478 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SPIN3-231	ENST00000639895	NACC1	Q96RE7	527 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SPIN3-231	ENST00000639895	SLC4A5	Q9BY07	1137 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SPIN3-231	ENST00000639895	C6orf62	Q9GZU0	229 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
SPIN3-231	ENST00000639895	WDR41	Q9HAD4	459 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SPIN3-231	ENST00000639895	SUN2	Q9UH99	717 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SPIN3-231	ENST00000639895	ADAMTS6	Q9UKP5	1117 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SPIN3-231	ENST00000639895	PCDHGA3	Q9Y5H0	932 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SPIN3-231	ENST00000639895	TCRBV5S4A2T	A0A5A2	114 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SPIN3-231	ENST00000639895	HOXD11	P31277	338 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
SPIN3-231	ENST00000639895	LAMC2	Q13753	1193 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SPIN3-231	ENST00000639895	CYP2A13	Q16696	494 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SPIN3-231	ENST00000639895	ACAD10	Q6JQN1	1059 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SPIN3-231	ENST00000639895	RWDD4	Q6NW29	188 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
SPIN3-231	ENST00000639895	DUS1L	Q6P1R4	473 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
SPIN3-231	ENST00000639895	TCAIM	Q8N3R3	496 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SPIN3-231	ENST00000639895	DLG3	Q92796	817 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SPIN3-231	ENST00000639895	SMARCAD1	Q9H4L7	1026 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SPIN3-231	ENST00000639895	SACM1L	Q9NTJ5	587 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SPIN3-231	ENST00000639895	HSPBP1	Q9NZL4	362 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SPIN3-231	ENST00000639895	IGSF9	Q9P2J2	1179 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SPIN3-231	ENST00000639895	CDYL	Q9Y232	598 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SPIN3-231	ENST00000639895	FAM32A	Q9Y421	112 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
SPIN3-231	ENST00000639895	CLDN25	C9JDP6	229 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SPIN3-231	ENST00000639895	KCNN4	O15554	427 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SPIN3-231	ENST00000639895	P4HB	P07237	508 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
SPIN3-231	ENST00000639895	FGFR2	P21802	821 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SPIN3-231	ENST00000639895	BTD	P43251	543 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SPIN3-231	ENST00000639895	GSTM4	Q03013	218 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SPIN3-231	ENST00000639895	GABPA	Q06546	454 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SPIN3-231	ENST00000639895	MTX3	Q5HYI7	312 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SPIN3-231	ENST00000639895	PARP8	Q8N3A8	854 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SPIN3-231	ENST00000639895	CCNY	Q8ND76	341 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SPIN3-231	ENST00000639895	SPATA18	Q8TC71	538 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SPIN3-231	ENST00000639895	ILKAP	Q9H0C8	392 aa	Predicted RBP	11.67	□□□□□ -0.54
SPIN3-231	ENST00000639895	DHX35	Q9H5Z1	703 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
SPIN3-231	ENST00000639895	JMJD4	Q9H9V9	463 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SPIN3-231	ENST00000639895	STXBP5L	Q9Y2K9	1186 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SPIN3-231	ENST00000639895	FSCN2	O14926	492 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SPIN3-231	ENST00000639895	GSTA4	O15217	222 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SPIN3-231	ENST00000639895	SRP72	O76094	671 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
SPIN3-231	ENST00000639895	CDH2	P19022	906 aa	Predicted RBP	11.67	□□□□□ -0.54
SPIN3-231	ENST00000639895	MUT	P22033	750 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SPIN3-231	ENST00000639895	GLRA2	P23416	452 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SPIN3-231	ENST00000639895	PSMA4	P25789	261 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
SPIN3-231	ENST00000639895	SERPINB9	P50453	376 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SPIN3-231	ENST00000639895	UBE3A	Q05086	875 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SPIN3-231	ENST00000639895	TRAPPC3L	Q5T215	181 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SPIN3-231	ENST00000639895	TMTC4	Q5T4D3	741 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SPIN3-231	ENST00000639895	N4BP2L1	Q5TBK1	243 aa	Predicted RBP	11.67	□□□□□ -0.54
SPIN3-231	ENST00000639895	UBE2Q1	Q7Z7E8	422 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SPIN3-231	ENST00000639895	ARPC5L	Q9BPX5	153 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SPIN3-231	ENST00000639895	HERC2P3	Q9BVR0	1158 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SPIN3-231	ENST00000639895	BBS2	Q9BXC9	721 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SPIN3-231	ENST00000639895	SERPINB13	Q9UIV8	391 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SPIN3-231	ENST00000639895	ST14	Q9Y5Y6	855 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SPIN3-231	ENST00000639895	ZHX2	Q9Y6X8	837 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SPIN3-231	ENST00000639895	FRMPD4	Q14CM0	1322 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SPIN3-231	ENST00000639895	CYB561D2	O14569	222 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SPIN3-231	ENST00000639895	TBC1D4	O60343	1298 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SPIN3-231	ENST00000639895	TGDS	O95455	350 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SPIN3-231	ENST00000639895	SEC24A	O95486	1093 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SPIN3-231	ENST00000639895	NKX2-5	P52952	324 aa	Predicted RBP	11.67	□□□□□ -0.54
SPIN3-231	ENST00000639895	ASPRV1	Q53RT3	343 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SPIN3-231	ENST00000639895	XKR9	Q5GH70	373 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SPIN3-231	ENST00000639895	WDR45B	Q5MNZ6	344 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SPIN3-231	ENST00000639895	OR8H2	Q8N162	312 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SPIN3-231	ENST00000639895	ACTL9	Q8TC94	416 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SPIN3-231	ENST00000639895	SEC14L1	Q92503	715 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SPIN3-231	ENST00000639895	CELF1	Q92879	486 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
SPIN3-231	ENST00000639895	ZC3H12C	Q9C0D7	883 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
SPIN3-231	ENST00000639895	PARVA	Q9NVD7	372 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SPIN3-231	ENST00000639895	WDR70	Q9NW82	654 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SPIN3-231	ENST00000639895	SEL1L	Q9UBV2	794 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SPIN3-231	ENST00000639895	SLIT3	O75094	1523 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SPIN3-231	ENST00000639895	WDR47	O94967	919 aa		11.66	□□□□□ -0.54
SPIN3-231	ENST00000639895	MAP3K6	O95382	1288 aa		11.66	□□□□□ -0.54
SPIN3-231	ENST00000639895	CYP11B1	P15538	503 aa		11.66	□□□□□ -0.54
SPIN3-231	ENST00000639895	ATF4	P18848	351 aa	Predicted RBP	11.66	□□□□□ -0.54
SPIN3-231	ENST00000639895	GNA15	P30679	374 aa		11.66	□□□□□ -0.54
SPIN3-231	ENST00000639895	SLC5A2	P31639	672 aa		11.66	□□□□□ -0.54
SPIN3-231	ENST00000639895	PHKA2	P46019	1235 aa		11.66	□□□□□ -0.54
SPIN3-231	ENST00000639895	LIG4	P49917	911 aa		11.66	□□□□□ -0.54
SPIN3-231	ENST00000639895	PEX3	P56589	373 aa		11.66	□□□□□ -0.54
SPIN3-231	ENST00000639895	PPAT	Q06203	517 aa		11.66	□□□□□ -0.54
SPIN3-231	ENST00000639895	FCHO2	Q0JRZ9	810 aa		11.66	□□□□□ -0.54
SPIN3-231	ENST00000639895	DNASE1L3	Q13609	305 aa		11.66	□□□□□ -0.54
SPIN3-231	ENST00000639895	DGCR6	Q14129	220 aa		11.66	□□□□□ -0.54
SPIN3-231	ENST00000639895	TMEM26	Q6ZUK4	368 aa		11.66	□□□□□ -0.54
SPIN3-231	ENST00000639895	FBXL13	Q8NEE6	735 aa		11.66	□□□□□ -0.54
SPIN3-231	ENST00000639895	ZNF555	Q8NEP9	628 aa		11.66	□□□□□ -0.54
SPIN3-231	ENST00000639895	OR7A2P	Q8NGA2	310 aa		11.66	□□□□□ -0.54
SPIN3-231	ENST00000639895	ELMO3	Q96BJ8	720 aa		11.66	□□□□□ -0.54
SPIN3-231	ENST00000639895	FAM84B	Q96KN1	310 aa	Predicted RBP	11.66	□□□□□ -0.54

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