RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636616.1

EFHC1-223, Transcript of EF-hand domain containing 1, human

TSL 5

Gene EFHC1, Length 1,636 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFHC1-223	ENST00000636616	CXorf56	Q9H5V9	222 aa		5.41	□□□□□ -1.54
EFHC1-223	ENST00000636616	LDAH	Q9H6V9	325 aa		5.41	□□□□□ -1.54
EFHC1-223	ENST00000636616	SYNC	Q9H7C4	482 aa		5.41	□□□□□ -1.54
EFHC1-223	ENST00000636616	BRF2	Q9HAW0	419 aa		5.41	□□□□□ -1.54
EFHC1-223	ENST00000636616	HEYL	Q9NQ87	328 aa	Predicted RBP	5.41	□□□□□ -1.54
EFHC1-223	ENST00000636616	A1CF	Q9NQ94	594 aa	Known RBP	5.41	□□□□□ -1.54
EFHC1-223	ENST00000636616	HSF4	Q9ULV5	492 aa		5.41	□□□□□ -1.54
EFHC1-223	ENST00000636616	NAALADL1	Q9UQQ1	740 aa		5.41	□□□□□ -1.54
EFHC1-223	ENST00000636616	DNAJC16	Q9Y2G8	782 aa		5.41	□□□□□ -1.54
EFHC1-223	ENST00000636616	PSAT1	Q9Y617	370 aa		5.41	□□□□□ -1.54
EFHC1-223	ENST00000636616	TNS2	Q63HR2	1409 aa		5.41	□□□□□ -1.54
EFHC1-223	ENST00000636616	MEGF6	O75095	1541 aa		5.41	□□□□□ -1.54
EFHC1-223	ENST00000636616	PKD1L3	Q7Z443	1732 aa		5.4	□□□□□ -1.54
EFHC1-223	ENST00000636616	CEMIP	Q8WUJ3	1361 aa		5.4	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	IL16	Q14005	1332 aa		5.4	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	CCDC78	A2IDD5	438 aa		5.4	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	PRSS29P	A6NIE9	313 aa		5.4	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	UBE2C	O00762	179 aa		5.4	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	KRT38	O76015	456 aa		5.4	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	BEST1	O76090	585 aa		5.4	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	GLP2R	O95838	553 aa		5.4	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	BTF3	P20290	206 aa	Known RBP	5.4	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	DDC	P20711	480 aa		5.4	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	HMGB2	P26583	209 aa	Known RBP	5.4	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	SREBF1	P36956	1147 aa		5.4	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	DPP6	P42658	865 aa		5.4	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF131	P52739	623 aa		5.4	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	CAP1	Q01518	475 aa		5.4	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	PPARD	Q03181	441 aa		5.4	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	NEXN	Q0ZGT2	675 aa		5.4	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	CHAF1B	Q13112	559 aa		5.4	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	MAMLD1	Q13495	774 aa		5.4	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	SMC1A	Q14683	1233 aa	Known RBP	5.4	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	TBCC	Q15814	346 aa		5.4	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	SKIDA1	Q1XH10	827 aa		5.4	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	NAA16	Q6N069	864 aa	Predicted RBP	5.4	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	USP17L6P	Q6QN14	398 aa		5.4	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	IL27RA	Q6UWB1	636 aa		5.4	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	CPLX4	Q7Z7G2	160 aa		5.4	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	CCDC28A	Q8IWP9	274 aa		5.4	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	DIS3L2	Q8IYB7	885 aa	Known RBP	5.4	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	ARL6IP6	Q8N6S5	226 aa		5.4	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	KCTD6	Q8NC69	237 aa		5.4	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	TOR1AIP2	Q8NFQ8	470 aa		5.4	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	GOT1L1	Q8NHS2	421 aa	Predicted RBP	5.4	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	USP6NL	Q92738	828 aa		5.4	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	DACT3	Q96B18	629 aa	Predicted RBP	5.4	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	FAM120B	Q96EK7	910 aa	Known RBP	5.4	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	ZSWIM3	Q96MP5	696 aa		5.4	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	CLIC6	Q96NY7	704 aa		5.4	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	EDEM3	Q9BZQ6	932 aa		5.4	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	CHODL	Q9H9P2	273 aa		5.4	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	NOD2	Q9HC29	1040 aa		5.4	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	XAB2	Q9HCS7	855 aa	Known RBP	5.4	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	SPATA6	Q9NWH7	488 aa	Predicted RBP	5.4	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	KCMF1	Q9P0J7	381 aa		5.4	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	TBC1D14	Q9P2M4	693 aa		5.4	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF215	Q9UL58	517 aa	Predicted RBP	5.4	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	TMEM5	Q9Y2B1	443 aa		5.4	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	USP15	Q9Y4E8	981 aa	Predicted RBP	5.4	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	PAXBP1	Q9Y5B6	917 aa		5.4	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	WNK3	Q9BYP7	1800 aa		5.39	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	VWA3A	A6NCI4	1184 aa		5.39	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	CHL1	O00533	1208 aa		5.39	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	CUTA	O60888	179 aa		5.39	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	F9	P00740	461 aa		5.39	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	TUBB4A	P04350	444 aa		5.39	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	CLEC3B	P05452	202 aa		5.39	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	KLRK1	P26718	216 aa		5.39	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	PCSK1	P29120	753 aa		5.39	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	ABCD1	P33897	745 aa		5.39	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	ATP6V1E1	P36543	226 aa		5.39	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	HADHA	P40939	763 aa		5.39	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	PHKA1	P46020	1223 aa		5.39	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	CTCF	P49711	727 aa	Predicted RBP	5.39	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	MEF2A	Q02078	507 aa	Predicted RBP	5.39	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	CD69	Q07108	199 aa		5.39	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	LRMP	Q12912	555 aa		5.39	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	HABP2	Q14520	560 aa	Predicted RBP	5.39	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	RTP5	Q14D33	572 aa		5.39	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	ANKRD1	Q15327	319 aa		5.39	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	GPR68	Q15743	365 aa		5.39	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	SLC5A9	Q2M3M2	681 aa		5.39	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	DUSP28	Q4G0W2	176 aa		5.39	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	EEF1AKMT2	Q5JPI9	291 aa	Known RBP	5.39	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	PHF19	Q5T6S3	580 aa		5.39	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	TTC22	Q5TAA0	569 aa		5.39	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF530	Q6P9A1	599 aa	Predicted RBP	5.39	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	KRT27	Q7Z3Y8	459 aa		5.39	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	BMP8A	Q7Z5Y6	402 aa		5.39	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	CEP97	Q8IW35	865 aa		5.39	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	PQLC1	Q8N2U9	271 aa		5.39	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	MPP5	Q8N3R9	675 aa		5.39	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	TTC39C	Q8N584	583 aa		5.39	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	SRBD1	Q8N5C6	995 aa	Known RBP	5.39	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	PCSK9	Q8NBP7	692 aa	Known RBP	5.39	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	CYFIP2	Q96F07	1278 aa		5.39	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	FEM1C	Q96JP0	617 aa		5.39	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	EYA3	Q99504	573 aa		5.39	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	TRPV4	Q9HBA0	871 aa		5.39	□□□□□ -1.55

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.1 ms