RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628306.2

CAPNS1-216, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-216ENST00000628306 PLEKHO2Q8TD55 490 aa25.44■■□□□ 1.66
CAPNS1-216ENST00000628306 RLN3Q8WXF3 142 aa25.44■■□□□ 1.66
CAPNS1-216ENST00000628306 GATA6Q92908 595 aa25.44■■□□□ 1.66
CAPNS1-216ENST00000628306 TMEM8AQ9HCN3 771 aa25.44■■□□□ 1.66
CAPNS1-216ENST00000628306 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa25.44■■□□□ 1.66
CAPNS1-216ENST00000628306 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
CAPNS1-216ENST00000628306 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
CAPNS1-216ENST00000628306 PKD1L2Q7Z442 2459 aa25.43■■□□□ 1.66
CAPNS1-216ENST00000628306 ATRXP46100 2492 aa25.43■■□□□ 1.66
CAPNS1-216ENST00000628306 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa25.43■■□□□ 1.66
CAPNS1-216ENST00000628306 PCNX2A6NKB5 2137 aa25.43■■□□□ 1.66
CAPNS1-216ENST00000628306 SGK1O00141 431 aa25.43■■□□□ 1.66
CAPNS1-216ENST00000628306 PDGFRBP09619 1106 aa25.43■■□□□ 1.66
CAPNS1-216ENST00000628306 CEACAM1P13688 526 aa25.43■■□□□ 1.66
CAPNS1-216ENST00000628306 GRIK1P39086 918 aa25.43■■□□□ 1.66
CAPNS1-216ENST00000628306 AP3M2P53677 418 aa25.43■■□□□ 1.66
CAPNS1-216ENST00000628306 NOP14P78316 857 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
CAPNS1-216ENST00000628306 PPP3CAQ08209 521 aa25.43■■□□□ 1.66
CAPNS1-216ENST00000628306 SURF1Q15526 300 aa25.43■■□□□ 1.66
CAPNS1-216ENST00000628306 CBWD6Q4V339 395 aa25.43■■□□□ 1.66
CAPNS1-216ENST00000628306 CBWD3Q5JTY5 395 aa25.43■■□□□ 1.66
CAPNS1-216ENST00000628306 CBWD5Q5RIA9 395 aa25.43■■□□□ 1.66
CAPNS1-216ENST00000628306 EMC10Q5UCC4 262 aa25.43■■□□□ 1.66
CAPNS1-216ENST00000628306 KRT39Q6A163 491 aa25.43■■□□□ 1.66
CAPNS1-216ENST00000628306 TRIM65Q6PJ69 517 aa25.43■■□□□ 1.66
CAPNS1-216ENST00000628306 RHBDF2Q6PJF5 856 aa25.43■■□□□ 1.66
CAPNS1-216ENST00000628306 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
CAPNS1-216ENST00000628306 LMO3Q8TAP4 145 aa25.43■■□□□ 1.66
CAPNS1-216ENST00000628306 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa25.43■■□□□ 1.66
CAPNS1-216ENST00000628306 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
CAPNS1-216ENST00000628306 SIX2Q9NPC8 291 aa25.43■■□□□ 1.66
CAPNS1-216ENST00000628306 TMEM74BQ9NUR3 256 aa25.43■■□□□ 1.66
CAPNS1-216ENST00000628306 CPQQ9Y646 472 aa25.43■■□□□ 1.66
CAPNS1-216ENST00000628306 BAHCC1Q9P281 2608 aa25.42■■□□□ 1.66
CAPNS1-216ENST00000628306 DSPP15924 2871 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
CAPNS1-216ENST00000628306 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
CAPNS1-216ENST00000628306 F8VP50 259 aa25.42■■□□□ 1.66
CAPNS1-216ENST00000628306 ADAM23O75077 832 aa25.42■■□□□ 1.66
CAPNS1-216ENST00000628306 TRIM49P0CI25 452 aa25.42■■□□□ 1.66
CAPNS1-216ENST00000628306 TRIM49CP0CI26 452 aa25.42■■□□□ 1.66
CAPNS1-216ENST00000628306 PDE6CP51160 858 aa25.42■■□□□ 1.66
CAPNS1-216ENST00000628306 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
CAPNS1-216ENST00000628306 DLG4P78352 724 aa25.42■■□□□ 1.66
CAPNS1-216ENST00000628306 MYO1EQ12965 1108 aa25.42■■□□□ 1.66
CAPNS1-216ENST00000628306 RRAGAQ7L523 313 aa25.42■■□□□ 1.66
CAPNS1-216ENST00000628306 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa25.42■■□□□ 1.66
CAPNS1-216ENST00000628306 C8orf48Q96LL4 319 aa25.42■■□□□ 1.66
CAPNS1-216ENST00000628306 PI4KAP42356 2102 aa25.41■■□□□ 1.66
CAPNS1-216ENST00000628306 PTGER3P43115 390 aa25.41■■□□□ 1.66
CAPNS1-216ENST00000628306 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP25.41■■□□□ 1.66
CAPNS1-216ENST00000628306 MAP7D1Q3KQU3 841 aa25.41■■□□□ 1.66
CAPNS1-216ENST00000628306 PIGKQ92643 395 aa25.41■■□□□ 1.66
CAPNS1-216ENST00000628306 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
CAPNS1-216ENST00000628306 ADAM33Q9BZ11 813 aa25.41■■□□□ 1.66
CAPNS1-216ENST00000628306 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa25.41■■□□□ 1.66
CAPNS1-216ENST00000628306 SMPD4Q9NXE4 827 aa25.41■■□□□ 1.66
CAPNS1-216ENST00000628306 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
CAPNS1-216ENST00000628306 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa25.4■■□□□ 1.66
CAPNS1-216ENST00000628306 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
CAPNS1-216ENST00000628306 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
CAPNS1-216ENST00000628306 CST3P01034 146 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
CAPNS1-216ENST00000628306 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
CAPNS1-216ENST00000628306 MXI1P50539 228 aa25.4■■□□□ 1.66
CAPNS1-216ENST00000628306 CYP27A1Q02318 531 aa25.4■■□□□ 1.66
CAPNS1-216ENST00000628306 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
CAPNS1-216ENST00000628306 MDH1BQ5I0G3 518 aa25.4■■□□□ 1.66
CAPNS1-216ENST00000628306 RAD9BQ6WBX8 426 aa25.4■■□□□ 1.66
CAPNS1-216ENST00000628306 DEFB124Q8NES8 71 aa25.4■■□□□ 1.66
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM81BQ96LP2 452 aa25.4■■□□□ 1.66
CAPNS1-216ENST00000628306 STK33Q9BYT3 514 aa25.4■■□□□ 1.66
CAPNS1-216ENST00000628306 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
CAPNS1-216ENST00000628306 ADGRG1Q9Y653 693 aa25.4■■□□□ 1.66
CAPNS1-216ENST00000628306 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
CAPNS1-216ENST00000628306 LAMA5O15230 3695 aa25.4■■□□□ 1.66
CAPNS1-216ENST00000628306 LRRC53A6NM62 1247 aa25.39■■□□□ 1.65
CAPNS1-216ENST00000628306 TRIM66O15016 1216 aa25.39■■□□□ 1.65
CAPNS1-216ENST00000628306 KAT7O95251 611 aa25.39■■□□□ 1.65
CAPNS1-216ENST00000628306 ANXA13P27216 316 aa25.39■■□□□ 1.65
CAPNS1-216ENST00000628306 TIE1P35590 1138 aa25.39■■□□□ 1.65
CAPNS1-216ENST00000628306 TAF10Q12962 218 aa25.39■■□□□ 1.65
CAPNS1-216ENST00000628306 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.65
CAPNS1-216ENST00000628306 SFMBT2Q5VUG0 894 aa25.39■■□□□ 1.65
CAPNS1-216ENST00000628306 PNKPQ96T60 521 aa25.39■■□□□ 1.65
CAPNS1-216ENST00000628306 SCNM1Q9BWG6 230 aa25.39■■□□□ 1.65
CAPNS1-216ENST00000628306 DPEP3Q9H4B8 488 aa25.39■■□□□ 1.65
CAPNS1-216ENST00000628306 CFAP97Q9P2B7 532 aa25.39■■□□□ 1.65
CAPNS1-216ENST00000628306 HCN2Q9UL51 889 aa25.39■■□□□ 1.65
CAPNS1-216ENST00000628306 NBEAQ8NFP9 2946 aa25.38■■□□□ 1.65
CAPNS1-216ENST00000628306 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa25.38■■□□□ 1.65
CAPNS1-216ENST00000628306 SOWAHDA6NJG2 315 aa25.38■■□□□ 1.65
CAPNS1-216ENST00000628306 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP25.38■■□□□ 1.65
CAPNS1-216ENST00000628306 TNFRSF10BO14763 440 aa25.38■■□□□ 1.65
CAPNS1-216ENST00000628306 TACC1O75410 805 aa25.38■■□□□ 1.65
CAPNS1-216ENST00000628306 CCDC175P0C221 793 aa25.38■■□□□ 1.65
CAPNS1-216ENST00000628306 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP25.38■■□□□ 1.65
CAPNS1-216ENST00000628306 PPP3CCP48454 512 aa25.38■■□□□ 1.65
CAPNS1-216ENST00000628306 GCLMP48507 274 aa25.38■■□□□ 1.65
CAPNS1-216ENST00000628306 DUOXA2Q1HG44 320 aa25.38■■□□□ 1.65
CAPNS1-216ENST00000628306 TRIM61Q5EBN2 209 aa25.38■■□□□ 1.65
CAPNS1-216ENST00000628306 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP25.38■■□□□ 1.65
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