RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000618056.4

PMS1-220, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PMS1, Length 1,468 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-220ENST00000618056 SLC6A11P48066 632 aa26.02■■□□□ 1.76
PMS1-220ENST00000618056 MRE11P49959 708 aa26.02■■□□□ 1.76
PMS1-220ENST00000618056 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP26.02■■□□□ 1.76
PMS1-220ENST00000618056 PKN3Q6P5Z2 889 aa26.02■■□□□ 1.76
PMS1-220ENST00000618056 TSSK4Q6SA08 328 aa26.02■■□□□ 1.76
PMS1-220ENST00000618056 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP26.02■■□□□ 1.76
PMS1-220ENST00000618056 WDTC1Q8N5D0 677 aa26.02■■□□□ 1.76
PMS1-220ENST00000618056 ZBTB44Q8NCP5 570 aa26.02■■□□□ 1.76
PMS1-220ENST00000618056 FUCA2Q9BTY2 467 aa26.02■■□□□ 1.76
PMS1-220ENST00000618056 MIS12Q9H081 205 aa26.02■■□□□ 1.76
PMS1-220ENST00000618056 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP26.01■■□□□ 1.76
PMS1-220ENST00000618056 HMBSP08397 361 aa26.01■■□□□ 1.75
PMS1-220ENST00000618056 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP26.01■■□□□ 1.75
PMS1-220ENST00000618056 NRLP54845 237 aa26.01■■□□□ 1.75
PMS1-220ENST00000618056 ANO4Q32M45 955 aa26.01■■□□□ 1.75
PMS1-220ENST00000618056 BEND5Q7L4P6 421 aa26.01■■□□□ 1.75
PMS1-220ENST00000618056 C2orf42Q9NWW7 574 aa26.01■■□□□ 1.75
PMS1-220ENST00000618056 WDR35Q9P2L0 1181 aa26.01■■□□□ 1.75
PMS1-220ENST00000618056 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa26.01■■□□□ 1.75
PMS1-220ENST00000618056 SIK3Q9Y2K2 1263 aa26.01■■□□□ 1.75
PMS1-220ENST00000618056 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa26.01■■□□□ 1.75
PMS1-220ENST00000618056 E5RJQ4 531 aa26■■□□□ 1.75
PMS1-220ENST00000618056 F8VZ95 297 aa26■■□□□ 1.75
PMS1-220ENST00000618056 K7EQS6 105 aa26■■□□□ 1.75
PMS1-220ENST00000618056 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP26■■□□□ 1.75
PMS1-220ENST00000618056 KRT9P35527 623 aa26■■□□□ 1.75
PMS1-220ENST00000618056 CHKAP35790 457 aa26■■□□□ 1.75
PMS1-220ENST00000618056 PHTF2Q8N3S3 785 aa26■■□□□ 1.75
PMS1-220ENST00000618056 TRIM62Q9BVG3 475 aa26■■□□□ 1.75
PMS1-220ENST00000618056 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
PMS1-220ENST00000618056 R4GN57 208 aa26■■□□□ 1.75
PMS1-220ENST00000618056 SMTNL1A8MU46 457 aa25.99■■□□□ 1.75
PMS1-220ENST00000618056 K7ESF4 209 aa25.99■■□□□ 1.75
PMS1-220ENST00000618056 CACNG3O60359 315 aa25.99■■□□□ 1.75
PMS1-220ENST00000618056 TULP3O75386 442 aa25.99■■□□□ 1.75
PMS1-220ENST00000618056 KAT7O95251 611 aa25.99■■□□□ 1.75
PMS1-220ENST00000618056 FYNP06241 537 aa25.99■■□□□ 1.75
PMS1-220ENST00000618056 HOXA6P31267 233 aa25.99■■□□□ 1.75
PMS1-220ENST00000618056 KLK7P49862 253 aa25.99■■□□□ 1.75
PMS1-220ENST00000618056 MESP2Q0VG99 397 aa25.99■■□□□ 1.75
PMS1-220ENST00000618056 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP25.99■■□□□ 1.75
PMS1-220ENST00000618056 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
PMS1-220ENST00000618056 DENND1CQ8IV53 801 aa25.99■■□□□ 1.75
PMS1-220ENST00000618056 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
PMS1-220ENST00000618056 FAM217AQ8IXS0 508 aa25.99■■□□□ 1.75
PMS1-220ENST00000618056 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP25.99■■□□□ 1.75
PMS1-220ENST00000618056 NOX5Q96PH1 765 aa25.99■■□□□ 1.75
PMS1-220ENST00000618056 ERGIC2Q96RQ1 377 aa25.99■■□□□ 1.75
PMS1-220ENST00000618056 BBS2Q9BXC9 721 aa25.99■■□□□ 1.75
PMS1-220ENST00000618056 ARHGEF4Q9NR80 690 aa25.99■■□□□ 1.75
PMS1-220ENST00000618056 SPAG17Q6Q759 2223 aa25.99■■□□□ 1.75
PMS1-220ENST00000618056 GPR179Q6PRD1 2367 aa25.99■■□□□ 1.75
PMS1-220ENST00000618056 LILRB5O75023 590 aa25.98■■□□□ 1.75
PMS1-220ENST00000618056 APODP05090 189 aa25.98■■□□□ 1.75
PMS1-220ENST00000618056 TYRP14679 529 aa25.98■■□□□ 1.75
PMS1-220ENST00000618056 CYP11B1P15538 503 aa25.98■■□□□ 1.75
PMS1-220ENST00000618056 GRIA2P42262 883 aa25.98■■□□□ 1.75
PMS1-220ENST00000618056 ZNF165P49910 485 aa25.98■■□□□ 1.75
PMS1-220ENST00000618056 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa25.98■■□□□ 1.75
PMS1-220ENST00000618056 CPXM1Q96SM3 734 aa25.98■■□□□ 1.75
PMS1-220ENST00000618056 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP25.98■■□□□ 1.75
PMS1-220ENST00000618056 DEC1Q9P2X7 70 aa25.98■■□□□ 1.75
PMS1-220ENST00000618056 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa25.98■■□□□ 1.75
PMS1-220ENST00000618056 ATP1A3P13637 1013 aa25.98■■□□□ 1.75
PMS1-220ENST00000618056 HARS2P49590 506 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
PMS1-220ENST00000618056 SYCP1Q15431 976 aa25.98■■□□□ 1.75
PMS1-220ENST00000618056 TPGS1Q6ZTW0 290 aa25.98■■□□□ 1.75
PMS1-220ENST00000618056 PASD1Q8IV76 773 aa25.98■■□□□ 1.75
PMS1-220ENST00000618056 CPXM2Q8N436 756 aa25.98■■□□□ 1.75
PMS1-220ENST00000618056 NAT16Q8N8M0 369 aa25.98■■□□□ 1.75
PMS1-220ENST00000618056 USP33Q8TEY7 942 aa25.98■■□□□ 1.75
PMS1-220ENST00000618056 ATRIPQ8WXE1 791 aa25.98■■□□□ 1.75
PMS1-220ENST00000618056 ACDQ96AP0 544 aa25.98■■□□□ 1.75
PMS1-220ENST00000618056 FAM149B1Q96BN6 582 aa25.98■■□□□ 1.75
PMS1-220ENST00000618056 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa25.98■■□□□ 1.75
PMS1-220ENST00000618056 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
PMS1-220ENST00000618056 CEP83Q9Y592 693 aa25.98■■□□□ 1.75
PMS1-220ENST00000618056 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa25.97■■□□□ 1.75
PMS1-220ENST00000618056 EPHB6O15197 1021 aa25.97■■□□□ 1.75
PMS1-220ENST00000618056 MSI1O43347 362 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
PMS1-220ENST00000618056 LATS1O95835 1130 aa25.97■■□□□ 1.75
PMS1-220ENST00000618056 IGLV3-27P01718 113 aa25.97■■□□□ 1.75
PMS1-220ENST00000618056 NCAM1P13591 858 aa25.97■■□□□ 1.75
PMS1-220ENST00000618056 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP25.97■■□□□ 1.75
PMS1-220ENST00000618056 TNFRSF4P43489 277 aa25.97■■□□□ 1.75
PMS1-220ENST00000618056 JAM2P57087 298 aa25.97■■□□□ 1.75
PMS1-220ENST00000618056 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
PMS1-220ENST00000618056 UBXN1Q04323 297 aa25.97■■□□□ 1.75
PMS1-220ENST00000618056 RING1Q06587 406 aa25.97■■□□□ 1.75
PMS1-220ENST00000618056 SYT13Q7L8C5 426 aa25.97■■□□□ 1.75
PMS1-220ENST00000618056 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
PMS1-220ENST00000618056 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
PMS1-220ENST00000618056 TJP2Q9UDY2 1190 aa25.97■■□□□ 1.75
PMS1-220ENST00000618056 STOML2Q9UJZ1 356 aa25.97■■□□□ 1.75
PMS1-220ENST00000618056 ZNF292O60281 2723 aa25.97■■□□□ 1.75
PMS1-220ENST00000618056 EML5Q05BV3 1969 aa25.97■■□□□ 1.75
PMS1-220ENST00000618056 SYCE3A1L190 88 aa25.96■■□□□ 1.75
PMS1-220ENST00000618056 PRR23AA6NEV1 266 aa25.96■■□□□ 1.75
PMS1-220ENST00000618056 PENKP01210 267 aaPredicted RBP25.96■■□□□ 1.75
PMS1-220ENST00000618056 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP25.96■■□□□ 1.75
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