RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617451.4

PTPRF-216, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRF, Length 1,129 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-216ENST00000617451 RHOBTB3O94955 611 aa26.22■■□□□ 1.79
PTPRF-216ENST00000617451 CD58P19256 250 aa26.22■■□□□ 1.79
PTPRF-216ENST00000617451 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP26.22■■□□□ 1.79
PTPRF-216ENST00000617451 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP26.22■■□□□ 1.79
PTPRF-216ENST00000617451 ERLEC1Q96DZ1 483 aa26.22■■□□□ 1.79
PTPRF-216ENST00000617451 MRGPRX1Q96LB2 322 aa26.22■■□□□ 1.79
PTPRF-216ENST00000617451 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP26.22■■□□□ 1.79
PTPRF-216ENST00000617451 PLK2Q9NYY3 685 aa26.22■■□□□ 1.79
PTPRF-216ENST00000617451 CLIC5Q9NZA1 410 aa26.22■■□□□ 1.79
PTPRF-216ENST00000617451 RAD54BQ9Y620 910 aa26.22■■□□□ 1.79
PTPRF-216ENST00000617451 FAM208BQ5VWN6 2430 aa26.22■■□□□ 1.79
PTPRF-216ENST00000617451 KLKB1P03952 638 aa26.21■■□□□ 1.79
PTPRF-216ENST00000617451 KRT13P13646 458 aa26.21■■□□□ 1.79
PTPRF-216ENST00000617451 FAM186BQ8IYM0 893 aa26.21■■□□□ 1.79
PTPRF-216ENST00000617451 HDDC3Q8N4P3 179 aa26.21■■□□□ 1.79
PTPRF-216ENST00000617451 SLC6A17Q9H1V8 727 aa26.21■■□□□ 1.79
PTPRF-216ENST00000617451 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa26.21■■□□□ 1.79
PTPRF-216ENST00000617451 A0A1W2PQD8 194 aa26.2■■□□□ 1.78
PTPRF-216ENST00000617451 WASH3PC4AMC7 463 aa26.2■■□□□ 1.78
PTPRF-216ENST00000617451 PRR29P0C7W0 189 aa26.2■■□□□ 1.78
PTPRF-216ENST00000617451 RALAP11233 206 aa26.2■■□□□ 1.78
PTPRF-216ENST00000617451 SYKP43405 635 aa26.2■■□□□ 1.78
PTPRF-216ENST00000617451 TRIML1Q8N9V2 468 aa26.2■■□□□ 1.78
PTPRF-216ENST00000617451 GATA6Q92908 595 aa26.2■■□□□ 1.78
PTPRF-216ENST00000617451 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP26.2■■□□□ 1.78
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP26.2■■□□□ 1.78
PTPRF-216ENST00000617451 HSPA12BQ96MM6 686 aa26.2■■□□□ 1.78
PTPRF-216ENST00000617451 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP26.2■■□□□ 1.78
PTPRF-216ENST00000617451 DNAI2Q9GZS0 605 aa26.2■■□□□ 1.78
PTPRF-216ENST00000617451 TMEM8AQ9HCN3 771 aa26.2■■□□□ 1.78
PTPRF-216ENST00000617451 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa26.2■■□□□ 1.78
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF510Q9Y2H8 683 aa26.2■■□□□ 1.78
PTPRF-216ENST00000617451 PCDH15Q96QU1 1955 aa26.2■■□□□ 1.78
PTPRF-216ENST00000617451 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa26.19■■□□□ 1.78
PTPRF-216ENST00000617451 ARHGAP33O14559 1287 aa26.19■■□□□ 1.78
PTPRF-216ENST00000617451 PENKP01210 267 aaPredicted RBP26.19■■□□□ 1.78
PTPRF-216ENST00000617451 RPL13P26373 211 aaKnown RBP26.19■■□□□ 1.78
PTPRF-216ENST00000617451 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP26.19■■□□□ 1.78
PTPRF-216ENST00000617451 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP26.19■■□□□ 1.78
PTPRF-216ENST00000617451 DPYDQ12882 1025 aa26.19■■□□□ 1.78
PTPRF-216ENST00000617451 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa26.19■■□□□ 1.78
PTPRF-216ENST00000617451 CCDC150Q8NCX0 1101 aa26.19■■□□□ 1.78
PTPRF-216ENST00000617451 MMRN2Q9H8L6 949 aa26.19■■□□□ 1.78
PTPRF-216ENST00000617451 CD93Q9NPY3 652 aa26.19■■□□□ 1.78
PTPRF-216ENST00000617451 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa26.19■■□□□ 1.78
PTPRF-216ENST00000617451 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa26.19■■□□□ 1.78
PTPRF-216ENST00000617451 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa26.18■■□□□ 1.78
PTPRF-216ENST00000617451 OPHN1O60890 802 aa26.18■■□□□ 1.78
PTPRF-216ENST00000617451 GTF2H1P32780 548 aa26.18■■□□□ 1.78
PTPRF-216ENST00000617451 NDUFA8P51970 172 aa26.18■■□□□ 1.78
PTPRF-216ENST00000617451 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP26.18■■□□□ 1.78
PTPRF-216ENST00000617451 COG7P83436 770 aa26.18■■□□□ 1.78
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF394Q53GI3 561 aa26.18■■□□□ 1.78
PTPRF-216ENST00000617451 FYB2Q5VWT5 728 aa26.18■■□□□ 1.78
PTPRF-216ENST00000617451 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP26.18■■□□□ 1.78
PTPRF-216ENST00000617451 MINDY1Q8N5J2 469 aa26.18■■□□□ 1.78
PTPRF-216ENST00000617451 SPATA32Q96LK8 384 aa26.18■■□□□ 1.78
PTPRF-216ENST00000617451 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP26.18■■□□□ 1.78
PTPRF-216ENST00000617451 STON1Q9Y6Q2 735 aa26.18■■□□□ 1.78
PTPRF-216ENST00000617451 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa26.17■■□□□ 1.78
PTPRF-216ENST00000617451 TMEM8BA6NDV4 472 aa26.17■■□□□ 1.78
PTPRF-216ENST00000617451 NDUFS2O75306 463 aa26.17■■□□□ 1.78
PTPRF-216ENST00000617451 CHKAP35790 457 aa26.17■■□□□ 1.78
PTPRF-216ENST00000617451 MFAP3P55082 362 aa26.17■■□□□ 1.78
PTPRF-216ENST00000617451 ADAM9Q13443 819 aa26.17■■□□□ 1.78
PTPRF-216ENST00000617451 KRT39Q6A163 491 aa26.17■■□□□ 1.78
PTPRF-216ENST00000617451 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP26.17■■□□□ 1.78
PTPRF-216ENST00000617451 FAXDC2Q96IV6 333 aa26.17■■□□□ 1.78
PTPRF-216ENST00000617451 UBXN6Q9BZV1 441 aa26.17■■□□□ 1.78
PTPRF-216ENST00000617451 DCLK3Q9C098 648 aa26.17■■□□□ 1.78
PTPRF-216ENST00000617451 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP26.17■■□□□ 1.78
PTPRF-216ENST00000617451 RASAL2Q9UJF2 1139 aa26.17■■□□□ 1.78
PTPRF-216ENST00000617451 NPC1O15118 1278 aa26.16■■□□□ 1.78
PTPRF-216ENST00000617451 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP26.16■■□□□ 1.78
PTPRF-216ENST00000617451 SYPP08247 313 aa26.16■■□□□ 1.78
PTPRF-216ENST00000617451 EFEMP1Q12805 493 aa26.16■■□□□ 1.78
PTPRF-216ENST00000617451 FUT11Q495W5 492 aa26.16■■□□□ 1.78
PTPRF-216ENST00000617451 ZCWPW2Q504Y3 356 aa26.16■■□□□ 1.78
PTPRF-216ENST00000617451 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP26.16■■□□□ 1.78
PTPRF-216ENST00000617451 TTC39CQ8N584 583 aa26.16■■□□□ 1.78
PTPRF-216ENST00000617451 OR2I1PQ8NGU4 316 aa26.16■■□□□ 1.78
PTPRF-216ENST00000617451 SEMA4DQ92854 862 aa26.16■■□□□ 1.78
PTPRF-216ENST00000617451 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP26.16■■□□□ 1.78
PTPRF-216ENST00000617451 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP26.16■■□□□ 1.78
PTPRF-216ENST00000617451 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP26.16■■□□□ 1.78
PTPRF-216ENST00000617451 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa26.16■■□□□ 1.78
PTPRF-216ENST00000617451 HMBSP08397 361 aa26.15■■□□□ 1.78
PTPRF-216ENST00000617451 CD59P13987 128 aa26.15■■□□□ 1.78
PTPRF-216ENST00000617451 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP26.15■■□□□ 1.78
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF132P52740 706 aa26.15■■□□□ 1.78
PTPRF-216ENST00000617451 KRT85P78386 507 aa26.15■■□□□ 1.78
PTPRF-216ENST00000617451 ENPP2Q13822 863 aa26.15■■□□□ 1.78
PTPRF-216ENST00000617451 STARD3Q14849 445 aa26.15■■□□□ 1.78
PTPRF-216ENST00000617451 GEN1Q17RS7 908 aa26.15■■□□□ 1.78
PTPRF-216ENST00000617451 SYCP2LQ5T4T6 812 aa26.15■■□□□ 1.78
PTPRF-216ENST00000617451 RGL4Q8IZJ4 473 aa26.15■■□□□ 1.78
PTPRF-216ENST00000617451 SLC4A11Q8NBS3 891 aa26.15■■□□□ 1.78
PTPRF-216ENST00000617451 FOXJ1Q92949 421 aa26.15■■□□□ 1.78
PTPRF-216ENST00000617451 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa26.15■■□□□ 1.78
PTPRF-216ENST00000617451 CISHQ9NSE2 258 aa26.15■■□□□ 1.78
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