RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000615742.4

DDX3X-211, Transcript of DEAD-box helicase 3 X-linked, humanhuman

TSL 4

Gene DDX3X, Length 485 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX3X-211ENST00000615742 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa8.69□□□□□ -1.02
DDX3X-211ENST00000615742 LNP1A1A4G5 178 aa8.69□□□□□ -1.02
DDX3X-211ENST00000615742 LGALS16A8MUM7 142 aa8.69□□□□□ -1.02
DDX3X-211ENST00000615742 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
DDX3X-211ENST00000615742 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
DDX3X-211ENST00000615742 MAP3K13O43283 966 aa8.69□□□□□ -1.02
DDX3X-211ENST00000615742 CACNG3O60359 315 aa8.69□□□□□ -1.02
DDX3X-211ENST00000615742 STX10O60499 249 aa8.69□□□□□ -1.02
DDX3X-211ENST00000615742 CILPO75339 1184 aa8.69□□□□□ -1.02
DDX3X-211ENST00000615742 BEST1O76090 585 aa8.69□□□□□ -1.02
DDX3X-211ENST00000615742 TRIM49P0CI25 452 aa8.69□□□□□ -1.02
DDX3X-211ENST00000615742 TRIM49CP0CI26 452 aa8.69□□□□□ -1.02
DDX3X-211ENST00000615742 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP8.69□□□□□ -1.02
DDX3X-211ENST00000615742 CD58P19256 250 aa8.69□□□□□ -1.02
DDX3X-211ENST00000615742 ACO1P21399 889 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
DDX3X-211ENST00000615742 BCKDHBP21953 392 aa8.69□□□□□ -1.02
DDX3X-211ENST00000615742 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
DDX3X-211ENST00000615742 MXI1P50539 228 aa8.69□□□□□ -1.02
DDX3X-211ENST00000615742 COPB1P53618 953 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
DDX3X-211ENST00000615742 MARSP56192 900 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
DDX3X-211ENST00000615742 PPP3CAQ08209 521 aa8.69□□□□□ -1.02
DDX3X-211ENST00000615742 FKBP15Q5T1M5 1219 aa8.69□□□□□ -1.02
DDX3X-211ENST00000615742 KRT39Q6A163 491 aa8.69□□□□□ -1.02
DDX3X-211ENST00000615742 GRAMD4Q6IC98 578 aa8.69□□□□□ -1.02
DDX3X-211ENST00000615742 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa8.69□□□□□ -1.02
DDX3X-211ENST00000615742 TMEM25Q86YD3 366 aa8.69□□□□□ -1.02
DDX3X-211ENST00000615742 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
DDX3X-211ENST00000615742 NAT16Q8N8M0 369 aa8.69□□□□□ -1.02
DDX3X-211ENST00000615742 TAS1R2Q8TE23 839 aa8.69□□□□□ -1.02
DDX3X-211ENST00000615742 JAKMIP2Q96AA8 810 aa8.69□□□□□ -1.02
DDX3X-211ENST00000615742 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
DDX3X-211ENST00000615742 CYFIP2Q96F07 1278 aa8.69□□□□□ -1.02
DDX3X-211ENST00000615742 PDLIM2Q96JY6 352 aa8.69□□□□□ -1.02
DDX3X-211ENST00000615742 TWNKQ96RR1 684 aa8.69□□□□□ -1.02
DDX3X-211ENST00000615742 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
DDX3X-211ENST00000615742 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
DDX3X-211ENST00000615742 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
DDX3X-211ENST00000615742 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
DDX3X-211ENST00000615742 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
DDX3X-211ENST00000615742 MARK1Q9P0L2 795 aa8.69□□□□□ -1.02
DDX3X-211ENST00000615742 WDR35Q9P2L0 1181 aa8.69□□□□□ -1.02
DDX3X-211ENST00000615742 DNMT3LQ9UJW3 386 aa8.69□□□□□ -1.02
DDX3X-211ENST00000615742 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa8.69□□□□□ -1.02
DDX3X-211ENST00000615742 INVSQ9Y283 1065 aa8.69□□□□□ -1.02
DDX3X-211ENST00000615742 PTPRDP23468 1912 aa8.69□□□□□ -1.02
DDX3X-211ENST00000615742 USP24Q9UPU5 2620 aa8.69□□□□□ -1.02
DDX3X-211ENST00000615742 CHD6Q8TD26 2715 aa8.68□□□□□ -1.02
DDX3X-211ENST00000615742 HELZP42694 1942 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
DDX3X-211ENST00000615742 GREB1Q4ZG55 1949 aa8.68□□□□□ -1.02
DDX3X-211ENST00000615742 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
DDX3X-211ENST00000615742 ZZEF1O43149 2961 aa8.68□□□□□ -1.02
DDX3X-211ENST00000615742 ANTXRLA6NF34 631 aa8.68□□□□□ -1.02
DDX3X-211ENST00000615742 LRRC10BA6NIK2 292 aa8.68□□□□□ -1.02
DDX3X-211ENST00000615742 HHLA1C9JL84 531 aa8.68□□□□□ -1.02
DDX3X-211ENST00000615742 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa8.68□□□□□ -1.02
DDX3X-211ENST00000615742 AP5Z1O43299 807 aa8.68□□□□□ -1.02
DDX3X-211ENST00000615742 GREM1O60565 184 aa8.68□□□□□ -1.02
DDX3X-211ENST00000615742 ADAM23O75077 832 aa8.68□□□□□ -1.02
DDX3X-211ENST00000615742 TBX18O95935 607 aa8.68□□□□□ -1.02
DDX3X-211ENST00000615742 TPM1P09493 284 aa8.68□□□□□ -1.02
DDX3X-211ENST00000615742 RALAP11233 206 aa8.68□□□□□ -1.02
DDX3X-211ENST00000615742 RARGP13631 454 aa8.68□□□□□ -1.02
DDX3X-211ENST00000615742 HOXB2P14652 356 aa8.68□□□□□ -1.02
DDX3X-211ENST00000615742 TYRP14679 529 aa8.68□□□□□ -1.02
DDX3X-211ENST00000615742 PMLP29590 882 aa8.68□□□□□ -1.02
DDX3X-211ENST00000615742 NTSR1P30989 418 aa8.68□□□□□ -1.02
DDX3X-211ENST00000615742 HOXD12P35452 270 aa8.68□□□□□ -1.02
DDX3X-211ENST00000615742 PLA2G4AP47712 749 aa8.68□□□□□ -1.02
DDX3X-211ENST00000615742 PGFP49763 221 aa8.68□□□□□ -1.02
DDX3X-211ENST00000615742 KIF11P52732 1056 aa8.68□□□□□ -1.02
DDX3X-211ENST00000615742 SLC8A3P57103 927 aa8.68□□□□□ -1.02
DDX3X-211ENST00000615742 SHC2P98077 582 aa8.68□□□□□ -1.02
DDX3X-211ENST00000615742 UBXN1Q04323 297 aa8.68□□□□□ -1.02
DDX3X-211ENST00000615742 LMAN2Q12907 356 aa8.68□□□□□ -1.02
DDX3X-211ENST00000615742 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
DDX3X-211ENST00000615742 C10orf120Q5SQS8 335 aa8.68□□□□□ -1.02
DDX3X-211ENST00000615742 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
DDX3X-211ENST00000615742 EMC10Q5UCC4 262 aa8.68□□□□□ -1.02
DDX3X-211ENST00000615742 TCERG1LQ5VWI1 586 aa8.68□□□□□ -1.02
DDX3X-211ENST00000615742 LYSMD4Q5XG99 296 aa8.68□□□□□ -1.02
DDX3X-211ENST00000615742 SDE2Q6IQ49 451 aa8.68□□□□□ -1.02
DDX3X-211ENST00000615742 CCDC186Q7Z3E2 898 aa8.68□□□□□ -1.02
DDX3X-211ENST00000615742 IRF2BP1Q8IU81 584 aa8.68□□□□□ -1.02
DDX3X-211ENST00000615742 PGBD3Q8N328 593 aa8.68□□□□□ -1.02
DDX3X-211ENST00000615742 ZNF276Q8N554 614 aa8.68□□□□□ -1.02
DDX3X-211ENST00000615742 HMGB4Q8WW32 186 aa8.68□□□□□ -1.02
DDX3X-211ENST00000615742 PIGKQ92643 395 aa8.68□□□□□ -1.02
DDX3X-211ENST00000615742 PPP1R9BQ96SB3 815 aa8.68□□□□□ -1.02
DDX3X-211ENST00000615742 BBS2Q9BXC9 721 aa8.68□□□□□ -1.02
DDX3X-211ENST00000615742 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
DDX3X-211ENST00000615742 DUSP16Q9BY84 665 aa8.68□□□□□ -1.02
DDX3X-211ENST00000615742 VPS16Q9H269 839 aa8.68□□□□□ -1.02
DDX3X-211ENST00000615742 MMRN2Q9H8L6 949 aa8.68□□□□□ -1.02
DDX3X-211ENST00000615742 TMEM9BQ9NQ34 198 aa8.68□□□□□ -1.02
DDX3X-211ENST00000615742 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
DDX3X-211ENST00000615742 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP8.68□□□□□ -1.02
DDX3X-211ENST00000615742 OSER1Q9NX31 292 aa8.68□□□□□ -1.02
DDX3X-211ENST00000615742 CLIC5Q9NZA1 410 aa8.68□□□□□ -1.02
DDX3X-211ENST00000615742 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
DDX3X-211ENST00000615742 NAGPAQ9UK23 515 aa8.68□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.8 ms