RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612229.4

PTPRT-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 11,285 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-209ENST00000612229 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 TMEM8AQ9HCN3 771 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 ANAPC2Q9UJX6 822 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 ASAP1Q9ULH1 1129 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 UBOX5O94941 541 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 NPR2P20594 1047 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 HPCAL1P37235 193 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 ACTR3P61158 418 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 FAM81AQ8TBF8 368 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 TMEM117Q9H0C3 514 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 ANXA9O76027 345 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 TMEM63BQ5T3F8 832 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 OXER1Q8TDS5 423 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 HDAC7Q8WUI4 952 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 CRYL1Q9Y2S2 319 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 SDR42E2A6NKP2 422 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 OTUD5Q96G74 571 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 GYS1P13807 737 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 TGM2P21980 687 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP7.16□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 SPIRE1Q08AE8 756 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 MRNIPQ6NTE8 343 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 KHDRBS3O75525 346 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 AKT1P31749 480 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 MAPK9P45984 424 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 SULT1E1P49888 294 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP7.16□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 TTLL4Q14679 1199 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 FAM189A2Q15884 450 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 SPAG16Q8N0X2 631 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 WDR48Q8TAF3 677 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 C15orf40Q8WUR7 153 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 KCNB2Q92953 911 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 FAM111AQ96PZ2 611 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 THAP1Q9NVV9 213 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 F5H423 210 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 RAD51BO15315 384 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 GSTT1P30711 240 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 CRKLP46109 303 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 PRKG1Q13976 671 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 HEATR4Q86WZ0 1026 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 C10orf53Q8N6V4 93 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 TSPAN14Q8NG11 270 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 VPS35Q96QK1 796 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 HK2P52789 917 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 PROSER3Q2NL68 480 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 TP53INP1Q96A56 240 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 TMEM47Q9BQJ4 181 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 ZSWIM1Q9BR11 485 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 RAB23Q9ULC3 237 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 KCNA6P17658 529 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 TNFRSF8P28908 595 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 ALDH3A2P51648 485 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 NCOA4Q13772 614 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 KIZQ2M2Z5 673 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 BTBD8Q5XKL5 378 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 RAD9BQ6WBX8 426 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 TRIM48Q8IWZ4 208 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 HEATR9A2RTY3 570 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 KCNQ3O43525 872 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 SNAP91O60641 907 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 LCP1P13796 627 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 S100A2P29034 98 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 RPS6KA3P51812 740 aa7.16□□□□□ -1.26
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