RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590874.5

CAPNS1-211, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-211ENST00000590874 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa26.98■■□□□ 1.91
CAPNS1-211ENST00000590874 GON4LQ3T8J9 2241 aa26.98■■□□□ 1.91
CAPNS1-211ENST00000590874 CEP192Q8TEP8 1941 aa26.97■■□□□ 1.91
CAPNS1-211ENST00000590874 TRIM49P0CI25 452 aa26.97■■□□□ 1.91
CAPNS1-211ENST00000590874 TRIM49CP0CI26 452 aa26.97■■□□□ 1.91
CAPNS1-211ENST00000590874 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP26.97■■□□□ 1.91
CAPNS1-211ENST00000590874 CD58P19256 250 aa26.97■■□□□ 1.91
CAPNS1-211ENST00000590874 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP26.97■■□□□ 1.91
CAPNS1-211ENST00000590874 VAMP7P51809 220 aa26.97■■□□□ 1.91
CAPNS1-211ENST00000590874 FUT11Q495W5 492 aa26.97■■□□□ 1.91
CAPNS1-211ENST00000590874 CCDC186Q7Z3E2 898 aa26.97■■□□□ 1.91
CAPNS1-211ENST00000590874 TAS1R2Q8TE23 839 aa26.97■■□□□ 1.91
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP26.97■■□□□ 1.91
CAPNS1-211ENST00000590874 CACNA1EQ15878 2313 aa26.96■■□□□ 1.91
CAPNS1-211ENST00000590874 PI4KAP42356 2102 aa26.96■■□□□ 1.91
CAPNS1-211ENST00000590874 H0Y626 953 aa26.96■■□□□ 1.91
CAPNS1-211ENST00000590874 SH3BP5O60239 455 aa26.96■■□□□ 1.91
CAPNS1-211ENST00000590874 CILPO75339 1184 aa26.96■■□□□ 1.91
CAPNS1-211ENST00000590874 TRIM16O95361 564 aa26.96■■□□□ 1.91
CAPNS1-211ENST00000590874 PENKP01210 267 aaPredicted RBP26.96■■□□□ 1.91
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CAPNS1-211ENST00000590874 MFAP3P55082 362 aa26.96■■□□□ 1.91
CAPNS1-211ENST00000590874 GEN1Q17RS7 908 aa26.96■■□□□ 1.91
CAPNS1-211ENST00000590874 SYCP2LQ5T4T6 812 aa26.96■■□□□ 1.91
CAPNS1-211ENST00000590874 FYB2Q5VWT5 728 aa26.96■■□□□ 1.91
CAPNS1-211ENST00000590874 IMPG2Q9BZV3 1241 aa26.96■■□□□ 1.91
CAPNS1-211ENST00000590874 NIF3L1Q9GZT8 377 aa26.96■■□□□ 1.91
CAPNS1-211ENST00000590874 CYP3A43Q9HB55 503 aa26.96■■□□□ 1.91
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa26.96■■□□□ 1.91
CAPNS1-211ENST00000590874 USP3Q9Y6I4 520 aa26.96■■□□□ 1.91
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM221BA6H8Z2 402 aa26.95■■□□□ 1.9
CAPNS1-211ENST00000590874 IL12RB1P42701 662 aa26.95■■□□□ 1.9
CAPNS1-211ENST00000590874 GCLMP48507 274 aa26.95■■□□□ 1.9
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CAPNS1-211ENST00000590874 PKP1Q13835 747 aa26.95■■□□□ 1.9
CAPNS1-211ENST00000590874 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP26.95■■□□□ 1.9
CAPNS1-211ENST00000590874 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP26.95■■□□□ 1.9
CAPNS1-211ENST00000590874 TADA2BQ86TJ2 420 aa26.95■■□□□ 1.9
CAPNS1-211ENST00000590874 FOXJ1Q92949 421 aa26.95■■□□□ 1.9
CAPNS1-211ENST00000590874 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP26.95■■□□□ 1.9
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CAPNS1-211ENST00000590874 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP26.95■■□□□ 1.9
CAPNS1-211ENST00000590874 SUSD2Q9UGT4 822 aa26.95■■□□□ 1.9
CAPNS1-211ENST00000590874 RASAL2Q9UJF2 1139 aa26.95■■□□□ 1.9
CAPNS1-211ENST00000590874 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa26.95■■□□□ 1.9
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM208BQ5VWN6 2430 aa26.95■■□□□ 1.9
CAPNS1-211ENST00000590874 CALUO43852 315 aaPredicted RBP26.94■■□□□ 1.9
CAPNS1-211ENST00000590874 KIF20AO95235 890 aa26.94■■□□□ 1.9
CAPNS1-211ENST00000590874 HMBSP08397 361 aa26.94■■□□□ 1.9
CAPNS1-211ENST00000590874 PSEN1P49768 467 aa26.94■■□□□ 1.9
CAPNS1-211ENST00000590874 GRIK2Q13002 908 aa26.94■■□□□ 1.9
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC14A1Q13336 389 aa26.94■■□□□ 1.9
CAPNS1-211ENST00000590874 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP26.94■■□□□ 1.9
CAPNS1-211ENST00000590874 STARD3Q14849 445 aa26.94■■□□□ 1.9
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF423Q2M1K9 1284 aa26.94■■□□□ 1.9
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CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF276Q8N554 614 aa26.94■■□□□ 1.9
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CAPNS1-211ENST00000590874 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP26.94■■□□□ 1.9
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CAPNS1-211ENST00000590874 KCNJ18B7U540 433 aa26.93■■□□□ 1.9
CAPNS1-211ENST00000590874 MAPK13O15264 365 aa26.93■■□□□ 1.9
CAPNS1-211ENST00000590874 RALAP11233 206 aa26.93■■□□□ 1.9
CAPNS1-211ENST00000590874 GNSP15586 552 aa26.93■■□□□ 1.9
CAPNS1-211ENST00000590874 PFKFB1P16118 471 aa26.93■■□□□ 1.9
CAPNS1-211ENST00000590874 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP26.93■■□□□ 1.9
CAPNS1-211ENST00000590874 RDXP35241 583 aaKnown RBP26.93■■□□□ 1.9
CAPNS1-211ENST00000590874 ENPP2Q13822 863 aa26.93■■□□□ 1.9
CAPNS1-211ENST00000590874 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP26.93■■□□□ 1.9
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF394Q53GI3 561 aa26.93■■□□□ 1.9
CAPNS1-211ENST00000590874 ATL3Q6DD88 541 aa26.93■■□□□ 1.9
CAPNS1-211ENST00000590874 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP26.93■■□□□ 1.9
CAPNS1-211ENST00000590874 MMRN2Q9H8L6 949 aa26.93■■□□□ 1.9
CAPNS1-211ENST00000590874 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP26.93■■□□□ 1.9
CAPNS1-211ENST00000590874 CFAP45Q9UL16 551 aa26.93■■□□□ 1.9
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF510Q9Y2H8 683 aa26.93■■□□□ 1.9
CAPNS1-211ENST00000590874 PCNX2A6NKB5 2137 aa26.92■■□□□ 1.9
CAPNS1-211ENST00000590874 A0A1B0GVL5 298 aa26.92■■□□□ 1.9
CAPNS1-211ENST00000590874 MEI4A8MW99 385 aa26.92■■□□□ 1.9
CAPNS1-211ENST00000590874 NR2F2P24468 414 aa26.92■■□□□ 1.9
CAPNS1-211ENST00000590874 RING1Q06587 406 aa26.92■■□□□ 1.9
CAPNS1-211ENST00000590874 EFEMP1Q12805 493 aa26.92■■□□□ 1.9
CAPNS1-211ENST00000590874 NAXDQ8IW45 347 aa26.92■■□□□ 1.9
CAPNS1-211ENST00000590874 DNASE2BQ8WZ79 361 aa26.92■■□□□ 1.9
CAPNS1-211ENST00000590874 SNX21Q969T3 373 aa26.92■■□□□ 1.9
CAPNS1-211ENST00000590874 GPR174Q9BXC1 333 aa26.92■■□□□ 1.9
CAPNS1-211ENST00000590874 ITM2CQ9NQX7 267 aa26.92■■□□□ 1.9
CAPNS1-211ENST00000590874 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP26.92■■□□□ 1.9
CAPNS1-211ENST00000590874 CLEC4EQ9ULY5 219 aa26.92■■□□□ 1.9
CAPNS1-211ENST00000590874 TAF4O00268 1085 aa26.91■■□□□ 1.9
CAPNS1-211ENST00000590874 NCAM1P13591 858 aa26.91■■□□□ 1.9
CAPNS1-211ENST00000590874 CHKAP35790 457 aa26.91■■□□□ 1.9
CAPNS1-211ENST00000590874 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP26.91■■□□□ 1.9
CAPNS1-211ENST00000590874 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP26.91■■□□□ 1.9
CAPNS1-211ENST00000590874 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP26.91■■□□□ 1.9
CAPNS1-211ENST00000590874 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP26.91■■□□□ 1.9
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