RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583649.1

CASC3-208, Transcript of CASC3, exon junction complex subunit, human

TSL 3

Gene CASC3, Length 577 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CASC3-208	ENST00000583649	SLC27A6	Q9Y2P4	619 aa		11.76	□□□□□ -0.53
CASC3-208	ENST00000583649	MYO18B	Q8IUG5	2567 aa		11.75	□□□□□ -0.53
CASC3-208	ENST00000583649	KCNK3	O14649	394 aa		11.75	□□□□□ -0.53
CASC3-208	ENST00000583649	VILL	O15195	856 aa		11.75	□□□□□ -0.53
CASC3-208	ENST00000583649	TLR5	O60602	858 aa		11.75	□□□□□ -0.53
CASC3-208	ENST00000583649	FSBP	O95073	299 aa		11.75	□□□□□ -0.53
CASC3-208	ENST00000583649	DNTT	P04053	509 aa		11.75	□□□□□ -0.53
CASC3-208	ENST00000583649	EPHX1	P07099	455 aa		11.75	□□□□□ -0.53
CASC3-208	ENST00000583649	UBA7	P41226	1012 aa		11.75	□□□□□ -0.53
CASC3-208	ENST00000583649	ACADVL	P49748	655 aa		11.75	□□□□□ -0.53
CASC3-208	ENST00000583649	TNNC1	P63316	161 aa		11.75	□□□□□ -0.53
CASC3-208	ENST00000583649	IRX6	P78412	446 aa	Predicted RBP	11.75	□□□□□ -0.53
CASC3-208	ENST00000583649	HMGN5	P82970	282 aa	Known RBP	11.75	□□□□□ -0.53
CASC3-208	ENST00000583649	GRIN1	Q05586	938 aa		11.75	□□□□□ -0.53
CASC3-208	ENST00000583649	LY6D	Q14210	128 aa		11.75	□□□□□ -0.53
CASC3-208	ENST00000583649	DUOXA2	Q1HG44	320 aa		11.75	□□□□□ -0.53
CASC3-208	ENST00000583649	CRELD2	Q6UXH1	353 aa	Predicted RBP	11.75	□□□□□ -0.53
CASC3-208	ENST00000583649	ANKS1B	Q7Z6G8	1248 aa		11.75	□□□□□ -0.53
CASC3-208	ENST00000583649	ERICH1	Q86X53	443 aa		11.75	□□□□□ -0.53
CASC3-208	ENST00000583649	SYCP3	Q8IZU3	236 aa		11.75	□□□□□ -0.53
CASC3-208	ENST00000583649	OR2T3	Q8NH03	318 aa		11.75	□□□□□ -0.53
CASC3-208	ENST00000583649	NOC3L	Q8WTT2	800 aa	Known RBP	11.75	□□□□□ -0.53
CASC3-208	ENST00000583649	NAF1	Q96HR8	494 aa	Known RBP	11.75	□□□□□ -0.53
CASC3-208	ENST00000583649	TRIM9	Q9C026	710 aa		11.75	□□□□□ -0.53
CASC3-208	ENST00000583649	CCSER2	Q9H7U1	834 aa		11.75	□□□□□ -0.53
CASC3-208	ENST00000583649	GDF3	Q9NR23	364 aa		11.75	□□□□□ -0.53
CASC3-208	ENST00000583649	PLA2G4C	Q9UP65	541 aa		11.75	□□□□□ -0.53
CASC3-208	ENST00000583649	MYO18A	Q92614	2054 aa	Known RBP	11.75	□□□□□ -0.53
CASC3-208	ENST00000583649	KIAA0391	O15091	583 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
CASC3-208	ENST00000583649	KLK10	O43240	276 aa		11.74	□□□□□ -0.53
CASC3-208	ENST00000583649	HCRT	O43612	131 aa		11.74	□□□□□ -0.53
CASC3-208	ENST00000583649	CKMT2	P17540	419 aa		11.74	□□□□□ -0.53
CASC3-208	ENST00000583649	PTPN1	P18031	435 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
CASC3-208	ENST00000583649	ACO1	P21399	889 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
CASC3-208	ENST00000583649	GART	P22102	1010 aa		11.74	□□□□□ -0.53
CASC3-208	ENST00000583649	ERVPABLB-1	P60509	514 aa		11.74	□□□□□ -0.53
CASC3-208	ENST00000583649	DNAJC3	Q13217	504 aa		11.74	□□□□□ -0.53
CASC3-208	ENST00000583649	CCDC142	Q17RM4	750 aa		11.74	□□□□□ -0.53
CASC3-208	ENST00000583649	SGO2	Q562F6	1265 aa		11.74	□□□□□ -0.53
CASC3-208	ENST00000583649	XKR5	Q6UX68	686 aa		11.74	□□□□□ -0.53
CASC3-208	ENST00000583649	ZNF574	Q6ZN55	896 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
CASC3-208	ENST00000583649	CACUL1	Q86Y37	369 aa		11.74	□□□□□ -0.53
CASC3-208	ENST00000583649	EID2	Q8N6I1	236 aa		11.74	□□□□□ -0.53
CASC3-208	ENST00000583649	KBTBD7	Q8WVZ9	684 aa		11.74	□□□□□ -0.53
CASC3-208	ENST00000583649	GOLGA1	Q92805	767 aa		11.74	□□□□□ -0.53
CASC3-208	ENST00000583649	BIRC7	Q96CA5	298 aa		11.74	□□□□□ -0.53
CASC3-208	ENST00000583649	ACCS	Q96QU6	501 aa		11.74	□□□□□ -0.53
CASC3-208	ENST00000583649	LLPH	Q9BRT6	129 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
CASC3-208	ENST00000583649	MED10	Q9BTT4	135 aa		11.74	□□□□□ -0.53
CASC3-208	ENST00000583649	CIPC	Q9C0C6	399 aa		11.74	□□□□□ -0.53
CASC3-208	ENST00000583649	MTMR12	Q9C0I1	747 aa		11.74	□□□□□ -0.53
CASC3-208	ENST00000583649	C6orf106	Q9H6K1	298 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
CASC3-208	ENST00000583649	CPNE5	Q9HCH3	593 aa		11.74	□□□□□ -0.53
CASC3-208	ENST00000583649	DMAP1	Q9NPF5	467 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
CASC3-208	ENST00000583649	THSD1	Q9NS62	852 aa		11.74	□□□□□ -0.53
CASC3-208	ENST00000583649	TPX2	Q9ULW0	747 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
CASC3-208	ENST00000583649	VWA3A	A6NCI4	1184 aa		11.73	□□□□□ -0.53
CASC3-208	ENST00000583649		A8MXQ7	604 aa		11.73	□□□□□ -0.53
CASC3-208	ENST00000583649	PYCARD-AS1	I3L0S3	204 aa		11.73	□□□□□ -0.53
CASC3-208	ENST00000583649	TSPAN3	O60637	253 aa		11.73	□□□□□ -0.53
CASC3-208	ENST00000583649	TACC1	O75410	805 aa		11.73	□□□□□ -0.53
CASC3-208	ENST00000583649	CISD3	P0C7P0	127 aa		11.73	□□□□□ -0.53
CASC3-208	ENST00000583649	COL5A1	P20908	1838 aa	Predicted RBP	11.73	□□□□□ -0.53
CASC3-208	ENST00000583649	PLA2G4A	P47712	749 aa		11.73	□□□□□ -0.53
CASC3-208	ENST00000583649	SLC5A3	P53794	718 aa		11.73	□□□□□ -0.53
CASC3-208	ENST00000583649	ENPP2	Q13822	863 aa		11.73	□□□□□ -0.53
CASC3-208	ENST00000583649	ZNF234	Q14588	700 aa		11.73	□□□□□ -0.53
CASC3-208	ENST00000583649	TMEM119	Q4V9L6	283 aa		11.73	□□□□□ -0.53
CASC3-208	ENST00000583649	RILPL1	Q5EBL4	403 aa		11.73	□□□□□ -0.53
CASC3-208	ENST00000583649	ARL6IP4	Q66PJ3	421 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
CASC3-208	ENST00000583649	ATG14	Q6ZNE5	492 aa		11.73	□□□□□ -0.53
CASC3-208	ENST00000583649	GATAD2A	Q86YP4	633 aa		11.73	□□□□□ -0.53
CASC3-208	ENST00000583649	DCBLD1	Q8N8Z6	715 aa		11.73	□□□□□ -0.53
CASC3-208	ENST00000583649	B3GALNT2	Q8NCR0	500 aa		11.73	□□□□□ -0.53
CASC3-208	ENST00000583649	RFFL	Q8WZ73	363 aa		11.73	□□□□□ -0.53
CASC3-208	ENST00000583649	BHMT	Q93088	406 aa		11.73	□□□□□ -0.53
CASC3-208	ENST00000583649	SMARCD1	Q96GM5	515 aa		11.73	□□□□□ -0.53
CASC3-208	ENST00000583649	TNIP3	Q96KP6	325 aa		11.73	□□□□□ -0.53
CASC3-208	ENST00000583649	MRPL44	Q9H9J2	332 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
CASC3-208	ENST00000583649	EVA1B	Q9NVM1	165 aa		11.73	□□□□□ -0.53
CASC3-208	ENST00000583649	ELOVL2	Q9NXB9	296 aa		11.73	□□□□□ -0.53
CASC3-208	ENST00000583649	SEL1L	Q9UBV2	794 aa		11.73	□□□□□ -0.53
CASC3-208	ENST00000583649	SCML1	Q9UN30	329 aa		11.73	□□□□□ -0.53
CASC3-208	ENST00000583649	PCDHB13	Q9Y5F0	798 aa		11.73	□□□□□ -0.53
CASC3-208	ENST00000583649	SPTA1	P02549	2419 aa		11.72	□□□□□ -0.53
CASC3-208	ENST00000583649	TISP43	B9A030	160 aa		11.72	□□□□□ -0.53
CASC3-208	ENST00000583649	MAGEC1	O60732	1142 aa		11.72	□□□□□ -0.53
CASC3-208	ENST00000583649	SFTPC	P11686	197 aa		11.72	□□□□□ -0.53
CASC3-208	ENST00000583649	ACSL1	P33121	698 aa		11.72	□□□□□ -0.53
CASC3-208	ENST00000583649	COPA	P53621	1224 aa		11.72	□□□□□ -0.53
CASC3-208	ENST00000583649	MFAP3	P55082	362 aa		11.72	□□□□□ -0.53
CASC3-208	ENST00000583649	INHBC	P55103	352 aa		11.72	□□□□□ -0.53
CASC3-208	ENST00000583649	ALCAM	Q13740	583 aa		11.72	□□□□□ -0.53
CASC3-208	ENST00000583649	IL17A	Q16552	155 aa		11.72	□□□□□ -0.53
CASC3-208	ENST00000583649	ZNF720	Q7Z2F6	126 aa		11.72	□□□□□ -0.53
CASC3-208	ENST00000583649	LIMS2	Q7Z4I7	341 aa		11.72	□□□□□ -0.53
CASC3-208	ENST00000583649	SAP25	Q8TEE9	199 aa		11.72	□□□□□ -0.53
CASC3-208	ENST00000583649	GANC	Q8TET4	914 aa		11.72	□□□□□ -0.53
CASC3-208	ENST00000583649	SNRNP27	Q8WVK2	155 aa	Known RBP	11.72	□□□□□ -0.53
CASC3-208	ENST00000583649	TSC1	Q92574	1164 aa		11.72	□□□□□ -0.53

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