RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000576084.5

COX11-208, Transcript of cytochrome c oxidase copper chaperone COX11, human

TSL 3

Gene COX11, Length 652 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
COX11-208	ENST00000576084	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		4.06	□□□□□ -1.76
COX11-208	ENST00000576084		A0A1W2PPC4	97 aa		4.06	□□□□□ -1.76
COX11-208	ENST00000576084	WDR91	A4D1P6	747 aa		4.06	□□□□□ -1.76
COX11-208	ENST00000576084	CLCA1	A8K7I4	914 aa		4.06	□□□□□ -1.76
COX11-208	ENST00000576084	PSMD9	O00233	223 aa		4.06	□□□□□ -1.76
COX11-208	ENST00000576084	PPP6C	O00743	305 aa		4.06	□□□□□ -1.76
COX11-208	ENST00000576084	AREL1	O15033	823 aa		4.06	□□□□□ -1.76
COX11-208	ENST00000576084	KPNA5	O15131	536 aa		4.06	□□□□□ -1.76
COX11-208	ENST00000576084	KCNQ3	O43525	872 aa		4.06	□□□□□ -1.76
COX11-208	ENST00000576084	CBFA2T3	O75081	653 aa		4.06	□□□□□ -1.76
COX11-208	ENST00000576084	INMT	O95050	263 aa		4.06	□□□□□ -1.76
COX11-208	ENST00000576084	MT-CO3	P00414	261 aa		4.06	□□□□□ -1.76
COX11-208	ENST00000576084	TUBB4A	P04350	444 aa		4.06	□□□□□ -1.76
COX11-208	ENST00000576084	PRR35	P0CG20	571 aa		4.06	□□□□□ -1.76
COX11-208	ENST00000576084	CYP2D6	P10635	497 aa		4.06	□□□□□ -1.76
COX11-208	ENST00000576084	CREB1	P16220	341 aa		4.06	□□□□□ -1.76
COX11-208	ENST00000576084	SUMO2	P61956	95 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
COX11-208	ENST00000576084	SUPT20HL1	Q3ZLR7	823 aa		4.06	□□□□□ -1.76
COX11-208	ENST00000576084	KSR2	Q6VAB6	950 aa		4.06	□□□□□ -1.76
COX11-208	ENST00000576084	KIAA0408	Q6ZU52	694 aa		4.06	□□□□□ -1.76
COX11-208	ENST00000576084	RNF44	Q7L0R7	432 aa		4.06	□□□□□ -1.76
COX11-208	ENST00000576084	NEK8	Q86SG6	692 aa		4.06	□□□□□ -1.76
COX11-208	ENST00000576084	PNISR	Q8TF01	805 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
COX11-208	ENST00000576084	EDC3	Q96F86	508 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
COX11-208	ENST00000576084	ZNF668	Q96K58	619 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
COX11-208	ENST00000576084	ZNF778	Q96MU6	729 aa		4.06	□□□□□ -1.76
COX11-208	ENST00000576084	HIST1H2AA	Q96QV6	131 aa		4.06	□□□□□ -1.76
COX11-208	ENST00000576084	COLEC11	Q9BWP8	271 aa		4.06	□□□□□ -1.76
COX11-208	ENST00000576084	MYO1A	Q9UBC5	1043 aa		4.06	□□□□□ -1.76
COX11-208	ENST00000576084	BTBD3	Q9Y2F9	522 aa		4.06	□□□□□ -1.76
COX11-208	ENST00000576084	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		4.06	□□□□□ -1.76
COX11-208	ENST00000576084	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		4.05	□□□□□ -1.76
COX11-208	ENST00000576084	ZNF804B	A4D1E1	1349 aa		4.05	□□□□□ -1.76
COX11-208	ENST00000576084	SMIM35	A0A1B0GVV1	85 aa		4.05	□□□□□ -1.76
COX11-208	ENST00000576084	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		4.05	□□□□□ -1.76
COX11-208	ENST00000576084	POM121B	A6NF01	834 aa		4.05	□□□□□ -1.76
COX11-208	ENST00000576084		A8MVJ9	347 aa		4.05	□□□□□ -1.76
COX11-208	ENST00000576084		H3BNC9	293 aa		4.05	□□□□□ -1.76
COX11-208	ENST00000576084	PMM2	O15305	246 aa		4.05	□□□□□ -1.76
COX11-208	ENST00000576084	PLIN1	O60240	522 aa		4.05	□□□□□ -1.76
COX11-208	ENST00000576084	MBP	P02686	304 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
COX11-208	ENST00000576084	CHRM5	P08912	532 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
COX11-208	ENST00000576084	AR	P10275	920 aa		4.05	□□□□□ -1.76
COX11-208	ENST00000576084	FGFR2	P21802	821 aa		4.05	□□□□□ -1.76
COX11-208	ENST00000576084	CERS1	P27544	350 aa		4.05	□□□□□ -1.76
COX11-208	ENST00000576084	EPHB2	P29323	1055 aa		4.05	□□□□□ -1.76
COX11-208	ENST00000576084	CLCA4	Q14CN2	919 aa		4.05	□□□□□ -1.76
COX11-208	ENST00000576084	DAZAP2	Q15038	168 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
COX11-208	ENST00000576084	SAFB	Q15424	915 aa	Known RBP eCLIP	4.05	□□□□□ -1.76
COX11-208	ENST00000576084	FAM187B	Q17R55	369 aa		4.05	□□□□□ -1.76
COX11-208	ENST00000576084	AWAT1	Q58HT5	328 aa		4.05	□□□□□ -1.76
COX11-208	ENST00000576084	ZNF626	Q68DY1	528 aa		4.05	□□□□□ -1.76
COX11-208	ENST00000576084	GRHL2	Q6ISB3	625 aa		4.05	□□□□□ -1.76
COX11-208	ENST00000576084	CLEC9A	Q6UXN8	241 aa		4.05	□□□□□ -1.76
COX11-208	ENST00000576084	YTHDF3	Q7Z739	585 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
COX11-208	ENST00000576084	DEFB132	Q7Z7B7	95 aa		4.05	□□□□□ -1.76
COX11-208	ENST00000576084	LIX1L	Q8IVB5	337 aa		4.05	□□□□□ -1.76
COX11-208	ENST00000576084	GALNT16	Q8N428	558 aa		4.05	□□□□□ -1.76
COX11-208	ENST00000576084	PJA1	Q8NG27	643 aa		4.05	□□□□□ -1.76
COX11-208	ENST00000576084	SUN3	Q8TAQ9	357 aa		4.05	□□□□□ -1.76
COX11-208	ENST00000576084	ADAMTS18	Q8TE60	1221 aa		4.05	□□□□□ -1.76
COX11-208	ENST00000576084	IPCEF1	Q8WWN9	437 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
COX11-208	ENST00000576084	IGFBPL1	Q8WX77	278 aa		4.05	□□□□□ -1.76
COX11-208	ENST00000576084	IQCD	Q96DY2	449 aa		4.05	□□□□□ -1.76
COX11-208	ENST00000576084	C5orf34	Q96MH7	638 aa		4.05	□□□□□ -1.76
COX11-208	ENST00000576084	TBCB	Q99426	244 aa		4.05	□□□□□ -1.76
COX11-208	ENST00000576084	PNPLA8	Q9NP80	782 aa		4.05	□□□□□ -1.76
COX11-208	ENST00000576084	PDGFC	Q9NRA1	345 aa		4.05	□□□□□ -1.76
COX11-208	ENST00000576084	SEMA5B	Q9P283	1151 aa		4.05	□□□□□ -1.76
COX11-208	ENST00000576084	MGAT4C	Q9UBM8	478 aa		4.05	□□□□□ -1.76
COX11-208	ENST00000576084	ZNF70	Q9UC06	446 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
COX11-208	ENST00000576084	NKX1-2	Q9UD57	310 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
COX11-208	ENST00000576084	SHPRH	Q149N8	1683 aa		4.05	□□□□□ -1.76
COX11-208	ENST00000576084	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
COX11-208	ENST00000576084	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		4.05	□□□□□ -1.76
COX11-208	ENST00000576084	EP400	Q96L91	3159 aa		4.04	□□□□□ -1.76
COX11-208	ENST00000576084	TMEM94	Q12767	1356 aa		4.04	□□□□□ -1.76
COX11-208	ENST00000576084	BTBD19	C9JJ37	291 aa		4.04	□□□□□ -1.76
COX11-208	ENST00000576084	TP73	O15350	636 aa		4.04	□□□□□ -1.76
COX11-208	ENST00000576084	THAP12	O43422	761 aa		4.04	□□□□□ -1.76
COX11-208	ENST00000576084	TMPRSS11D	O60235	418 aa		4.04	□□□□□ -1.76
COX11-208	ENST00000576084	PHKG2	P15735	406 aa		4.04	□□□□□ -1.76
COX11-208	ENST00000576084	KEL	P23276	732 aa		4.04	□□□□□ -1.76
COX11-208	ENST00000576084	RBL1	P28749	1068 aa		4.04	□□□□□ -1.76
COX11-208	ENST00000576084	ATIC	P31939	592 aa		4.04	□□□□□ -1.76
COX11-208	ENST00000576084	TM4SF4	P48230	202 aa		4.04	□□□□□ -1.76
COX11-208	ENST00000576084	COPB1	P53618	953 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
COX11-208	ENST00000576084	GPC5	P78333	572 aa		4.04	□□□□□ -1.76
COX11-208	ENST00000576084	CFHR3	Q02985	330 aa		4.04	□□□□□ -1.76
COX11-208	ENST00000576084	LARS2	Q15031	903 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
COX11-208	ENST00000576084	ACOX1	Q15067	660 aa		4.04	□□□□□ -1.76
COX11-208	ENST00000576084	SEC23B	Q15437	767 aa		4.04	□□□□□ -1.76
COX11-208	ENST00000576084	MAP9	Q49MG5	647 aa		4.04	□□□□□ -1.76
COX11-208	ENST00000576084	MTX3	Q5HYI7	312 aa		4.04	□□□□□ -1.76
COX11-208	ENST00000576084	LRCH2	Q5VUJ6	765 aa		4.04	□□□□□ -1.76
COX11-208	ENST00000576084	ZNF425	Q6IV72	752 aa		4.04	□□□□□ -1.76
COX11-208	ENST00000576084	SLC18B1	Q6NT16	456 aa		4.04	□□□□□ -1.76
COX11-208	ENST00000576084	MZT2A	Q6P582	158 aa		4.04	□□□□□ -1.76
COX11-208	ENST00000576084	MBD3L2	Q8NHZ7	208 aa	Predicted RBP	4.04	□□□□□ -1.76
COX11-208	ENST00000576084	GADD45GIP1	Q8TAE8	222 aa	Predicted RBP	4.04	□□□□□ -1.76

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