RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574205.5

CTDNEP1-209, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 1,506 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-209ENST00000574205 TMEM59LQ9UK28 342 aa34.55■■■■□ 3.12
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CTDNEP1-209ENST00000574205 GREM1O60565 184 aa34.54■■■■□ 3.12
CTDNEP1-209ENST00000574205 FTLP02792 175 aaPredicted RBP34.54■■■■□ 3.12
CTDNEP1-209ENST00000574205 FAM228BP0C875 321 aa34.54■■■■□ 3.12
CTDNEP1-209ENST00000574205 NOS2P35228 1153 aa34.54■■■■□ 3.12
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CTDNEP1-209ENST00000574205 SIGLEC14Q08ET2 396 aa34.54■■■■□ 3.12
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CTDNEP1-209ENST00000574205 TRIM68Q6AZZ1 485 aa34.54■■■■□ 3.12
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CTDNEP1-209ENST00000574205 ISCUQ9H1K1 167 aa34.54■■■■□ 3.12
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CTDNEP1-209ENST00000574205 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa34.53■■■■□ 3.12
CTDNEP1-209ENST00000574205 ATP2A3Q93084 1043 aa34.53■■■■□ 3.12
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CTDNEP1-209ENST00000574205 DCLK3Q9C098 648 aa34.53■■■■□ 3.12
CTDNEP1-209ENST00000574205 EBF3Q9H4W6 596 aa34.53■■■■□ 3.12
CTDNEP1-209ENST00000574205 RRN3Q9NYV6 651 aa34.53■■■■□ 3.12
CTDNEP1-209ENST00000574205 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP34.53■■■■□ 3.12
CTDNEP1-209ENST00000574205 FBXL21Q9UKT6 434 aa34.53■■■■□ 3.12
CTDNEP1-209ENST00000574205 COL4A2P08572 1712 aa34.53■■■■□ 3.12
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CTDNEP1-209ENST00000574205 LINC00597Q9H2U6 94 aa34.52■■■■□ 3.12
CTDNEP1-209ENST00000574205 DEF6Q9H4E7 631 aa34.52■■■■□ 3.12
CTDNEP1-209ENST00000574205 STAP1Q9ULZ2 295 aa34.52■■■■□ 3.12
CTDNEP1-209ENST00000574205 TLR6Q9Y2C9 796 aa34.52■■■■□ 3.12
CTDNEP1-209ENST00000574205 IGLV3-25P01717 112 aa34.51■■■■□ 3.12
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CTDNEP1-209ENST00000574205 TNK2Q07912 1038 aa34.51■■■■□ 3.12
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CTDNEP1-209ENST00000574205 ADAM32Q8TC27 787 aa34.51■■■■□ 3.12
CTDNEP1-209ENST00000574205 CHP1Q99653 195 aa34.51■■■■□ 3.12
CTDNEP1-209ENST00000574205 GRPEL1Q9HAV7 217 aa34.51■■■■□ 3.12
CTDNEP1-209ENST00000574205 HPS4Q9NQG7 708 aa34.51■■■■□ 3.12
CTDNEP1-209ENST00000574205 GTSE1Q9NYZ3 720 aa34.51■■■■□ 3.12
CTDNEP1-209ENST00000574205 IMPACTQ9P2X3 320 aa34.51■■■■□ 3.12
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF510Q9Y2H8 683 aa34.51■■■■□ 3.12
CTDNEP1-209ENST00000574205 IGLV3-27P01718 113 aa34.5■■■■□ 3.11
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CTDNEP1-209ENST00000574205 RUNX3Q13761 415 aa34.5■■■■□ 3.11
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CTDNEP1-209ENST00000574205 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa34.5■■■■□ 3.11
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CTDNEP1-209ENST00000574205 NFATC1O95644 943 aa34.5■■■■□ 3.11
CTDNEP1-209ENST00000574205 ARSAP15289 507 aa34.5■■■■□ 3.11
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CTDNEP1-209ENST00000574205 SLC18A3Q16572 532 aa34.5■■■■□ 3.11
CTDNEP1-209ENST00000574205 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP34.5■■■■□ 3.11
CTDNEP1-209ENST00000574205 DNAJC24Q6P3W2 148 aa34.5■■■■□ 3.11
CTDNEP1-209ENST00000574205 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP34.5■■■■□ 3.11
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CTDNEP1-209ENST00000574205 HEBP1Q9NRV9 189 aa34.5■■■■□ 3.11
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CTDNEP1-209ENST00000574205 SLC44A4Q53GD3 710 aa34.49■■■■□ 3.11
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CTDNEP1-209ENST00000574205 CPA6Q8N4T0 437 aa34.48■■■■□ 3.11
CTDNEP1-209ENST00000574205 SLC39A13Q96H72 371 aa34.48■■■■□ 3.11
CTDNEP1-209ENST00000574205 ECT2Q9H8V3 914 aa34.48■■■■□ 3.11
CTDNEP1-209ENST00000574205 DDIT4Q9NX09 232 aa34.48■■■■□ 3.11
CTDNEP1-209ENST00000574205 CA14Q9ULX7 337 aa34.48■■■■□ 3.11
CTDNEP1-209ENST00000574205 AKR1B10O60218 316 aa34.47■■■■□ 3.11
CTDNEP1-209ENST00000574205 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP34.47■■■■□ 3.11
CTDNEP1-209ENST00000574205 SLC25A52Q3SY17 297 aa34.47■■■■□ 3.11
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