RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567542.5

PRMT7-223, Transcript of protein arginine methyltransferase 7, human

TSL 1 (best)

Gene PRMT7, Length 3,542 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PRMT7-223	ENST00000567542	SNAPC2	Q13487	334 aa		13.48	□□□□□ -0.25
PRMT7-223	ENST00000567542	LAMB3	Q13751	1172 aa		13.48	□□□□□ -0.25
PRMT7-223	ENST00000567542	PRKD1	Q15139	912 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
PRMT7-223	ENST00000567542	DHX35	Q9H5Z1	703 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
PRMT7-223	ENST00000567542	KCNK4	Q9NYG8	393 aa		13.48	□□□□□ -0.25
PRMT7-223	ENST00000567542	APOL1	O14791	398 aa		13.47	□□□□□ -0.25
PRMT7-223	ENST00000567542	MAP7	Q14244	749 aa		13.47	□□□□□ -0.25
PRMT7-223	ENST00000567542	KIZ	Q2M2Z5	673 aa		13.47	□□□□□ -0.25
PRMT7-223	ENST00000567542	GLRA4	Q5JXX5	417 aa		13.47	□□□□□ -0.25
PRMT7-223	ENST00000567542	LPCAT4	Q643R3	524 aa		13.47	□□□□□ -0.25
PRMT7-223	ENST00000567542	FASTKD5	Q7L8L6	764 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
PRMT7-223	ENST00000567542	NME8	Q8N427	588 aa		13.47	□□□□□ -0.25
PRMT7-223	ENST00000567542	NMD3	Q96D46	503 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
PRMT7-223	ENST00000567542	GPR20	Q99678	358 aa		13.47	□□□□□ -0.25
PRMT7-223	ENST00000567542	SOX13	Q9UN79	622 aa		13.47	□□□□□ -0.25
PRMT7-223	ENST00000567542	CXorf49	A8MYA2	514 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25
PRMT7-223	ENST00000567542	DYNC1LI2	O43237	492 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25
PRMT7-223	ENST00000567542	SPAG6	O75602	509 aa		13.47	□□□□□ -0.25
PRMT7-223	ENST00000567542	LYN	P07948	512 aa		13.47	□□□□□ -0.25
PRMT7-223	ENST00000567542	TYK2	P29597	1187 aa		13.47	□□□□□ -0.25
PRMT7-223	ENST00000567542	COPA	P53621	1224 aa		13.47	□□□□□ -0.25
PRMT7-223	ENST00000567542	RXFP2	Q8WXD0	754 aa		13.47	□□□□□ -0.25
PRMT7-223	ENST00000567542	PTCD3	Q96EY7	689 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
PRMT7-223	ENST00000567542	ZNF518B	Q9C0D4	1074 aa		13.47	□□□□□ -0.25
PRMT7-223	ENST00000567542	SLC7A8	Q9UHI5	535 aa		13.47	□□□□□ -0.25
PRMT7-223	ENST00000567542	CPA4	Q9UI42	421 aa		13.47	□□□□□ -0.25
PRMT7-223	ENST00000567542	NFASC	O94856	1347 aa		13.47	□□□□□ -0.25
PRMT7-223	ENST00000567542		A0A0G2JLL6	359 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25
PRMT7-223	ENST00000567542	DCAF8L1	A6NGE4	600 aa		13.47	□□□□□ -0.25
PRMT7-223	ENST00000567542	SIGLEC16	A6NMB1	481 aa		13.47	□□□□□ -0.25
PRMT7-223	ENST00000567542	NEMP1	O14524	444 aa		13.47	□□□□□ -0.25
PRMT7-223	ENST00000567542	PEX6	Q13608	980 aa		13.47	□□□□□ -0.25
PRMT7-223	ENST00000567542	CTC1	Q2NKJ3	1217 aa		13.47	□□□□□ -0.25
PRMT7-223	ENST00000567542	FASTKD1	Q53R41	847 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
PRMT7-223	ENST00000567542	EFHC1	Q5JVL4	640 aa		13.47	□□□□□ -0.25
PRMT7-223	ENST00000567542	ATF7IP2	Q5U623	682 aa		13.47	□□□□□ -0.25
PRMT7-223	ENST00000567542	C15orf39	Q6ZRI6	1047 aa		13.47	□□□□□ -0.25
PRMT7-223	ENST00000567542	PRRT2	Q7Z6L0	340 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25
PRMT7-223	ENST00000567542	NETO2	Q8NC67	525 aa		13.47	□□□□□ -0.25
PRMT7-223	ENST00000567542	GPRC5A	Q8NFJ5	357 aa		13.47	□□□□□ -0.25
PRMT7-223	ENST00000567542	SKA1	Q96BD8	255 aa		13.47	□□□□□ -0.25
PRMT7-223	ENST00000567542	ECSIT	Q9BQ95	431 aa		13.47	□□□□□ -0.25
PRMT7-223	ENST00000567542	CEP41	Q9BYV8	373 aa		13.47	□□□□□ -0.25
PRMT7-223	ENST00000567542	SMYD2	Q9NRG4	433 aa		13.47	□□□□□ -0.25
PRMT7-223	ENST00000567542	FARP1	Q9Y4F1	1045 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25
PRMT7-223	ENST00000567542	SSC5D	A1L4H1	1573 aa		13.46	□□□□□ -0.25
PRMT7-223	ENST00000567542	C11orf97	A0A1B0GVM6	126 aa	Predicted RBP	13.46	□□□□□ -0.25
PRMT7-223	ENST00000567542	HMGCR	P04035	888 aa		13.46	□□□□□ -0.25
PRMT7-223	ENST00000567542	ITGB3	P05106	788 aa		13.46	□□□□□ -0.25
PRMT7-223	ENST00000567542	ATP6V1B1	P15313	513 aa		13.46	□□□□□ -0.25
PRMT7-223	ENST00000567542	AMHR2	Q16671	573 aa		13.46	□□□□□ -0.25
PRMT7-223	ENST00000567542	CELF3	Q5SZQ8	465 aa	Known RBP	13.46	□□□□□ -0.25
PRMT7-223	ENST00000567542	TUBGCP5	Q96RT8	1024 aa		13.46	□□□□□ -0.25
PRMT7-223	ENST00000567542	PPM1H	Q9ULR3	514 aa		13.46	□□□□□ -0.25
PRMT7-223	ENST00000567542	HES2	Q9Y543	173 aa		13.46	□□□□□ -0.25
PRMT7-223	ENST00000567542	ABLIM1	O14639	778 aa		13.46	□□□□□ -0.25
PRMT7-223	ENST00000567542	CELF2	O95319	508 aa	Known RBP	13.46	□□□□□ -0.25
PRMT7-223	ENST00000567542	HSPA4L	O95757	839 aa		13.46	□□□□□ -0.25
PRMT7-223	ENST00000567542	SDC4	P31431	198 aa		13.46	□□□□□ -0.25
PRMT7-223	ENST00000567542	GJA5	P36382	358 aa		13.46	□□□□□ -0.25
PRMT7-223	ENST00000567542	TRMT10B	Q6PF06	316 aa	Known RBP	13.46	□□□□□ -0.25
PRMT7-223	ENST00000567542	WDR49	Q8IV35	697 aa		13.46	□□□□□ -0.25
PRMT7-223	ENST00000567542	BRSK2	Q8IWQ3	736 aa		13.46	□□□□□ -0.25
PRMT7-223	ENST00000567542	DEFB107A	Q8IZN7	70 aa		13.46	□□□□□ -0.25
PRMT7-223	ENST00000567542	GALNT15	Q8N3T1	639 aa		13.46	□□□□□ -0.25
PRMT7-223	ENST00000567542	ICA1L	Q8NDH6	482 aa		13.46	□□□□□ -0.25
PRMT7-223	ENST00000567542	STKLD1	Q8NE28	680 aa		13.46	□□□□□ -0.25
PRMT7-223	ENST00000567542	SSU72	Q9NP77	194 aa	Known RBP	13.46	□□□□□ -0.25
PRMT7-223	ENST00000567542	PLLP	Q9Y342	182 aa		13.46	□□□□□ -0.25
PRMT7-223	ENST00000567542	AIM2	O14862	343 aa		13.46	□□□□□ -0.26
PRMT7-223	ENST00000567542	OGT	O15294	1046 aa		13.46	□□□□□ -0.26
PRMT7-223	ENST00000567542	GPD1	P21695	349 aa		13.46	□□□□□ -0.26
PRMT7-223	ENST00000567542	SH3D19	Q5HYK7	790 aa		13.46	□□□□□ -0.26
PRMT7-223	ENST00000567542	HEATR6	Q6AI08	1181 aa	Known RBP	13.46	□□□□□ -0.26
PRMT7-223	ENST00000567542	SREK1	Q8WXA9	508 aa	Known RBP	13.46	□□□□□ -0.26
PRMT7-223	ENST00000567542	FAM49B	Q9NUQ9	324 aa		13.46	□□□□□ -0.26
PRMT7-223	ENST00000567542	WDR35	Q9P2L0	1181 aa		13.46	□□□□□ -0.26
PRMT7-223	ENST00000567542	KIAA1217	Q5T5P2	1943 aa		13.45	□□□□□ -0.26
PRMT7-223	ENST00000567542		E9PBE3	544 aa		13.45	□□□□□ -0.26
PRMT7-223	ENST00000567542	CXCL11	O14625	94 aa		13.45	□□□□□ -0.26
PRMT7-223	ENST00000567542	KLHL41	O60662	606 aa		13.45	□□□□□ -0.26
PRMT7-223	ENST00000567542	DGKI	O75912	1065 aa		13.45	□□□□□ -0.26
PRMT7-223	ENST00000567542	PGM3	O95394	542 aa		13.45	□□□□□ -0.26
PRMT7-223	ENST00000567542	SLC25A27	O95847	323 aa		13.45	□□□□□ -0.26
PRMT7-223	ENST00000567542	ARL2	P36404	184 aa		13.45	□□□□□ -0.26
PRMT7-223	ENST00000567542	KRT72	Q14CN4	511 aa		13.45	□□□□□ -0.26
PRMT7-223	ENST00000567542	ZC3H12A	Q5D1E8	599 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
PRMT7-223	ENST00000567542	RALGPS1	Q5JS13	557 aa		13.45	□□□□□ -0.26
PRMT7-223	ENST00000567542	NOL9	Q5SY16	702 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
PRMT7-223	ENST00000567542	FAM149B1	Q96BN6	582 aa		13.45	□□□□□ -0.26
PRMT7-223	ENST00000567542	FERMT1	Q9BQL6	677 aa		13.45	□□□□□ -0.26
PRMT7-223	ENST00000567542	SETD4	Q9NVD3	440 aa		13.45	□□□□□ -0.26
PRMT7-223	ENST00000567542	NR2E3	Q9Y5X4	410 aa		13.45	□□□□□ -0.26
PRMT7-223	ENST00000567542	CCDC78	A2IDD5	438 aa		13.45	□□□□□ -0.26
PRMT7-223	ENST00000567542	SMAP	O00193	183 aa		13.45	□□□□□ -0.26
PRMT7-223	ENST00000567542	TM7SF2	O76062	418 aa		13.45	□□□□□ -0.26
PRMT7-223	ENST00000567542	ERBB2	P04626	1255 aa		13.45	□□□□□ -0.26
PRMT7-223	ENST00000567542	DYNC1I2	Q13409	638 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
PRMT7-223	ENST00000567542	N4BP2L1	Q5TBK1	243 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
PRMT7-223	ENST00000567542	CES3	Q6UWW8	571 aa		13.45	□□□□□ -0.26

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