RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567271.1

NME3-210, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

TSL 2

Gene NME3, Length 752 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3-210ENST00000567271 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
NME3-210ENST00000567271 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa22.6■■□□□ 1.21
NME3-210ENST00000567271 ADH5P11766 374 aa22.59■■□□□ 1.21
NME3-210ENST00000567271 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
NME3-210ENST00000567271 OPRD1P41143 372 aa22.59■■□□□ 1.21
NME3-210ENST00000567271 UBASH3AP57075 661 aa22.59■■□□□ 1.21
NME3-210ENST00000567271 GAD2Q05329 585 aa22.59■■□□□ 1.21
NME3-210ENST00000567271 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP22.59■■□□□ 1.21
NME3-210ENST00000567271 TCF15Q12870 199 aa22.59■■□□□ 1.21
NME3-210ENST00000567271 TAF5Q15542 800 aa22.59■■□□□ 1.21
NME3-210ENST00000567271 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa22.59■■□□□ 1.21
NME3-210ENST00000567271 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
NME3-210ENST00000567271 BAP1Q92560 729 aa22.59■■□□□ 1.21
NME3-210ENST00000567271 CD101Q93033 1021 aa22.59■■□□□ 1.21
NME3-210ENST00000567271 CHRDQ9H2X0 955 aa22.59■■□□□ 1.21
NME3-210ENST00000567271 SYNCQ9H7C4 482 aa22.59■■□□□ 1.21
NME3-210ENST00000567271 POPDC2Q9HBU9 364 aa22.59■■□□□ 1.21
NME3-210ENST00000567271 ASNSD1Q9NWL6 643 aa22.59■■□□□ 1.21
NME3-210ENST00000567271 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
NME3-210ENST00000567271 CAPN9O14815 690 aa22.58■■□□□ 1.21
NME3-210ENST00000567271 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
NME3-210ENST00000567271 MSI1O43347 362 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
NME3-210ENST00000567271 GLI1P08151 1106 aa22.58■■□□□ 1.21
NME3-210ENST00000567271 DRD1P21728 446 aa22.58■■□□□ 1.21
NME3-210ENST00000567271 GABRB2P47870 512 aa22.58■■□□□ 1.21
NME3-210ENST00000567271 FMO1Q01740 532 aa22.58■■□□□ 1.21
NME3-210ENST00000567271 ARID5AQ03989 594 aa22.58■■□□□ 1.21
NME3-210ENST00000567271 EFHC1Q5JVL4 640 aa22.58■■□□□ 1.21
NME3-210ENST00000567271 SYPL2Q5VXT5 272 aa22.58■■□□□ 1.21
NME3-210ENST00000567271 OR6B2Q6IFH4 312 aa22.58■■□□□ 1.21
NME3-210ENST00000567271 OLFML1Q6UWY5 402 aa22.58■■□□□ 1.21
NME3-210ENST00000567271 DENND1CQ8IV53 801 aa22.58■■□□□ 1.21
NME3-210ENST00000567271 C1orf210Q8IVY1 113 aa22.58■■□□□ 1.21
NME3-210ENST00000567271 SYNPOQ8N3V7 929 aa22.58■■□□□ 1.21
NME3-210ENST00000567271 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
NME3-210ENST00000567271 MYO6Q9UM54 1294 aa22.58■■□□□ 1.21
NME3-210ENST00000567271 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
NME3-210ENST00000567271 PBX1P40424 430 aa22.57■■□□□ 1.2
NME3-210ENST00000567271 SLC6A11P48066 632 aa22.57■■□□□ 1.2
NME3-210ENST00000567271 HARS2P49590 506 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
NME3-210ENST00000567271 NOMO3P69849 1222 aa22.57■■□□□ 1.2
NME3-210ENST00000567271 SLC6A3Q01959 620 aa22.57■■□□□ 1.2
NME3-210ENST00000567271 ERICH1Q86X53 443 aa22.57■■□□□ 1.2
NME3-210ENST00000567271 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa22.57■■□□□ 1.2
NME3-210ENST00000567271 CPA5Q8WXQ8 436 aa22.57■■□□□ 1.2
NME3-210ENST00000567271 IER2Q9BTL4 223 aa22.57■■□□□ 1.2
NME3-210ENST00000567271 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
NME3-210ENST00000567271 MARK1Q9P0L2 795 aa22.57■■□□□ 1.2
NME3-210ENST00000567271 MYOFQ9NZM1 2061 aa22.56■■□□□ 1.2
NME3-210ENST00000567271 HSF2BPO75031 334 aa22.56■■□□□ 1.2
NME3-210ENST00000567271 EGFP01133 1207 aa22.56■■□□□ 1.2
NME3-210ENST00000567271 IGLV3-27P01718 113 aa22.56■■□□□ 1.2
NME3-210ENST00000567271 FERP16591 822 aa22.56■■□□□ 1.2
NME3-210ENST00000567271 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
NME3-210ENST00000567271 PTPN5P54829 565 aa22.56■■□□□ 1.2
NME3-210ENST00000567271 ZNF445P59923 1031 aa22.56■■□□□ 1.2
NME3-210ENST00000567271 MTAPQ13126 283 aa22.56■■□□□ 1.2
NME3-210ENST00000567271 GAS6Q14393 721 aa22.56■■□□□ 1.2
NME3-210ENST00000567271 ANGPT1Q15389 498 aa22.56■■□□□ 1.2
NME3-210ENST00000567271 ANO4Q32M45 955 aa22.56■■□□□ 1.2
NME3-210ENST00000567271 NAA35Q5VZE5 725 aa22.56■■□□□ 1.2
NME3-210ENST00000567271 MAMSTRQ6ZN01 415 aa22.56■■□□□ 1.2
NME3-210ENST00000567271 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa22.56■■□□□ 1.2
NME3-210ENST00000567271 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa22.56■■□□□ 1.2
NME3-210ENST00000567271 C12orf40Q86WS4 652 aa22.56■■□□□ 1.2
NME3-210ENST00000567271 C18orf8Q96DM3 657 aa22.56■■□□□ 1.2
NME3-210ENST00000567271 SERPINB11Q96P15 392 aa22.56■■□□□ 1.2
NME3-210ENST00000567271 SLC2A13Q96QE2 648 aa22.56■■□□□ 1.2
NME3-210ENST00000567271 EDEM3Q9BZQ6 932 aa22.56■■□□□ 1.2
NME3-210ENST00000567271 TTYH3Q9C0H2 523 aa22.56■■□□□ 1.2
NME3-210ENST00000567271 CCDC172P0C7W6 258 aa22.55■■□□□ 1.2
NME3-210ENST00000567271 CHKAP35790 457 aa22.55■■□□□ 1.2
NME3-210ENST00000567271 TBX4P57082 545 aa22.55■■□□□ 1.2
NME3-210ENST00000567271 RING1Q06587 406 aa22.55■■□□□ 1.2
NME3-210ENST00000567271 FIGNQ5HY92 759 aa22.55■■□□□ 1.2
NME3-210ENST00000567271 TRIM72Q6ZMU5 477 aa22.55■■□□□ 1.2
NME3-210ENST00000567271 Q6ZS52 159 aa22.55■■□□□ 1.2
NME3-210ENST00000567271 TPGS1Q6ZTW0 290 aa22.55■■□□□ 1.2
NME3-210ENST00000567271 SLC26A9Q7LBE3 791 aa22.55■■□□□ 1.2
NME3-210ENST00000567271 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa22.55■■□□□ 1.2
NME3-210ENST00000567271 FAM217AQ8IXS0 508 aa22.55■■□□□ 1.2
NME3-210ENST00000567271 DEFB106AQ8N104 65 aa22.55■■□□□ 1.2
NME3-210ENST00000567271 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
NME3-210ENST00000567271 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
NME3-210ENST00000567271 PCDHB18PQ96TA0 734 aa22.55■■□□□ 1.2
NME3-210ENST00000567271 IFNKQ9P0W0 207 aa22.55■■□□□ 1.2
NME3-210ENST00000567271 WDR35Q9P2L0 1181 aa22.55■■□□□ 1.2
NME3-210ENST00000567271 STOML2Q9UJZ1 356 aa22.55■■□□□ 1.2
NME3-210ENST00000567271 FAM170AA1A519 330 aa22.54■■□□□ 1.2
NME3-210ENST00000567271 LRRC53A6NM62 1247 aa22.54■■□□□ 1.2
NME3-210ENST00000567271 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
NME3-210ENST00000567271 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa22.54■■□□□ 1.2
NME3-210ENST00000567271 H0Y858 1186 aa22.54■■□□□ 1.2
NME3-210ENST00000567271 GRAP2O75791 330 aa22.54■■□□□ 1.2
NME3-210ENST00000567271 LATS1O95835 1130 aa22.54■■□□□ 1.2
NME3-210ENST00000567271 NNTQ13423 1086 aa22.54■■□□□ 1.2
NME3-210ENST00000567271 DCAF6Q58WW2 860 aa22.54■■□□□ 1.2
NME3-210ENST00000567271 TAC4Q86UU9 113 aa22.54■■□□□ 1.2
NME3-210ENST00000567271 XYLT1Q86Y38 959 aa22.54■■□□□ 1.2
NME3-210ENST00000567271 UNC45BQ8IWX7 931 aa22.54■■□□□ 1.2
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