RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552688.5

CS-233, Transcript of citrate synthase, human

TSL 4

Gene CS, Length 580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-233	ENST00000552688	TPGS1	Q6ZTW0	290 aa		7.22	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	PAQR9	Q6ZVX9	377 aa		7.22	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	TMPRSS7	Q7RTY8	843 aa		7.22	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	TADA2B	Q86TJ2	420 aa		7.22	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	FAM35A	Q86V20	835 aa		7.22	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	MIB1	Q86YT6	1006 aa		7.22	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	GALNT15	Q8N3T1	639 aa		7.22	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	ZNF276	Q8N554	614 aa		7.22	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	OR2I1P	Q8NGU4	316 aa		7.22	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	SCAMP5	Q8TAC9	235 aa		7.22	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	ZNF507	Q8TCN5	953 aa		7.22	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	SETD7	Q8WTS6	366 aa	Known RBP	7.22	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	UCMA	Q8WVF2	138 aa		7.22	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	ELMO3	Q96BJ8	720 aa		7.22	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	CCDC127	Q96BQ5	260 aa		7.22	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	CCDC34	Q96HJ3	373 aa		7.22	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	TIGD1	Q96MW7	591 aa		7.22	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	CAMK1G	Q96NX5	476 aa		7.22	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	CDK5RAP1	Q96SZ6	601 aa	Known RBP	7.22	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	ACOX2	Q99424	681 aa		7.22	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	MED10	Q9BTT4	135 aa		7.22	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	NUP58	Q9BVL2	599 aa		7.22	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	KLF16	Q9BXK1	252 aa	Predicted RBP	7.22	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	XYLT2	Q9H1B5	865 aa		7.22	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	DPEP3	Q9H4B8	488 aa		7.22	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	CCSER2	Q9H7U1	834 aa		7.22	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	MMRN2	Q9H8L6	949 aa		7.22	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	PRDM16	Q9HAZ2	1276 aa		7.22	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	CSNK1G1	Q9HCP0	422 aa		7.22	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	AGPAT3	Q9NRZ7	376 aa		7.22	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	USP36	Q9P275	1121 aa	Known RBP	7.22	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	NXF1	Q9UBU9	619 aa	Known RBP	7.22	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	HOOK1	Q9UJC3	728 aa	Known RBP	7.22	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	FBXO10	Q9UK96	956 aa		7.22	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	SLC27A6	Q9Y2P4	619 aa		7.22	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	ZFHX4	Q86UP3	3567 aa		7.22	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	WDR87	Q6ZQQ6	2873 aa		7.22	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	PCNX2	A6NKB5	2137 aa		7.21	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	ZNF638	Q14966	1978 aa	Known RBP	7.21	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688		E9PAM4	449 aa		7.21	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	BCAT2	O15382	392 aa	Predicted RBP	7.21	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	TIMM44	O43615	452 aa		7.21	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	SYNCRIP	O60506	623 aa	Known RBP	7.21	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	CILP	O75339	1184 aa		7.21	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	AP1G2	O75843	785 aa		7.21	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	DKK1	O94907	266 aa		7.21	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	CLSTN1	O94985	981 aa		7.21	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	IGLV3-19	P01714	112 aa		7.21	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	CISD3	P0C7P0	127 aa		7.21	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	IRF1	P10914	325 aa		7.21	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	NCAM1	P13591	858 aa		7.21	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	ACO1	P21399	889 aa	Known RBP	7.21	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	MAOB	P27338	520 aa		7.21	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	CHKA	P35790	457 aa		7.21	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	MATK	P42679	507 aa		7.21	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	CASP4	P49662	377 aa		7.21	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	TPMT	P51580	245 aa		7.21	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	PMS1	P54277	932 aa	Known RBP	7.21	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	COG7	P83436	770 aa		7.21	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	ENPP2	Q13822	863 aa		7.21	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	KNOP1	Q1ED39	458 aa	Known RBP	7.21	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	SGSM1	Q2NKQ1	1148 aa		7.21	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	ZNF658	Q5TYW1	1059 aa	Predicted RBP	7.21	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	KIAA1324	Q6UXG2	1013 aa	Known RBP	7.21	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	SLCO6A1	Q86UG4	719 aa		7.21	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	UNC93A	Q86WB7	457 aa		7.21	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	TMPRSS6	Q8IU80	811 aa		7.21	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	C12orf56	Q8IXR9	622 aa		7.21	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	FUK	Q8N0W3	1084 aa		7.21	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	CRYBG2	Q8N1P7	616 aa		7.21	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	PNPLA1	Q8N8W4	532 aa		7.21	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	GOLGA5	Q8TBA6	731 aa		7.21	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	RHBDD1	Q8TEB9	315 aa		7.21	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	ZNF516	Q92618	1163 aa		7.21	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	PRCC	Q92733	491 aa	Predicted RBP	7.21	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	TOE1	Q96GM8	510 aa	Known RBP	7.21	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	GPR174	Q9BXC1	333 aa		7.21	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	DNAI2	Q9GZS0	605 aa		7.21	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	GAREM1	Q9H706	876 aa		7.21	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	PNPLA8	Q9NP80	782 aa		7.21	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	TM7SF3	Q9NS93	570 aa		7.21	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	KRT82	Q9NSB4	513 aa		7.21	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	RMND1	Q9NWS8	449 aa		7.21	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	CACNA2D2	Q9NY47	1150 aa		7.21	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	GMIP	Q9P107	970 aa		7.21	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	TMEM63C	Q9P1W3	806 aa		7.21	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	THAP10	Q9P2Z0	257 aa	Predicted RBP	7.21	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	DNMT3L	Q9UJW3	386 aa		7.21	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	SCML2	Q9UQR0	700 aa		7.21	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	STON1	Q9Y6Q2	735 aa		7.21	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	OBSL1	O75147	1896 aa		7.21	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	UBE4B	O95155	1302 aa		7.21	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	ASCC3	Q8N3C0	2202 aa	Known RBP	7.2	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688		A0A087WV48	116 aa		7.2	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	TK2	O00142	265 aa		7.2	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	TRIM24	O15164	1050 aa		7.2	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	TNFSF14	O43557	240 aa		7.2	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	DFNA5	O60443	496 aa		7.2	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	EXOC3	O60645	756 aa		7.2	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	NR3C1	P04150	777 aa		7.2	□□□□□ -1.26

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