RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000535535.5

LMO3-212, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene LMO3, Length 1,488 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-212ENST00000535535 TKFCQ3LXA3 575 aa8.37□□□□□ -1.07
LMO3-212ENST00000535535 FAM47CQ5HY64 1035 aa8.37□□□□□ -1.07
LMO3-212ENST00000535535 HYIQ5T013 277 aa8.37□□□□□ -1.07
LMO3-212ENST00000535535 NXNQ6DKJ4 435 aa8.37□□□□□ -1.07
LMO3-212ENST00000535535 ZNF585AQ6P3V2 769 aa8.37□□□□□ -1.07
LMO3-212ENST00000535535 RUFY3Q7L099 469 aa8.37□□□□□ -1.07
LMO3-212ENST00000535535 GPR155Q7Z3F1 870 aa8.37□□□□□ -1.07
LMO3-212ENST00000535535 ITPRIPQ8IWB1 547 aa8.37□□□□□ -1.07
LMO3-212ENST00000535535 LILRB2Q8N423 598 aa8.37□□□□□ -1.07
LMO3-212ENST00000535535 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP8.37□□□□□ -1.07
LMO3-212ENST00000535535 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
LMO3-212ENST00000535535 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
LMO3-212ENST00000535535 FAM81AQ8TBF8 368 aa8.37□□□□□ -1.07
LMO3-212ENST00000535535 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
LMO3-212ENST00000535535 C8orf76Q96K31 380 aa8.37□□□□□ -1.07
LMO3-212ENST00000535535 TRIM8Q9BZR9 551 aa8.37□□□□□ -1.07
LMO3-212ENST00000535535 SYNCQ9H7C4 482 aa8.37□□□□□ -1.07
LMO3-212ENST00000535535 SEC61A2Q9H9S3 476 aa8.37□□□□□ -1.07
LMO3-212ENST00000535535 SH3GLB2Q9NR46 395 aa8.37□□□□□ -1.07
LMO3-212ENST00000535535 MTMR4Q9NYA4 1195 aa8.37□□□□□ -1.07
LMO3-212ENST00000535535 MTUS1Q9ULD2 1270 aa8.37□□□□□ -1.07
LMO3-212ENST00000535535 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
LMO3-212ENST00000535535 TTLL3Q9Y4R7 772 aa8.37□□□□□ -1.07
LMO3-212ENST00000535535 COL4A6Q14031 1691 aa8.36□□□□□ -1.07
LMO3-212ENST00000535535 LINC01553A4QN01 128 aa8.36□□□□□ -1.07
LMO3-212ENST00000535535 GOLGA8AA7E2F4 631 aa8.36□□□□□ -1.07
LMO3-212ENST00000535535 TMEM232C9JQI7 657 aa8.36□□□□□ -1.07
LMO3-212ENST00000535535 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
LMO3-212ENST00000535535 GJB5O95377 273 aa8.36□□□□□ -1.07
LMO3-212ENST00000535535 TTLL1O95922 423 aa8.36□□□□□ -1.07
LMO3-212ENST00000535535 ALAS1P13196 640 aa8.36□□□□□ -1.07
LMO3-212ENST00000535535 BTF3P20290 206 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
LMO3-212ENST00000535535 NUCB1Q02818 461 aa8.36□□□□□ -1.07
LMO3-212ENST00000535535 ARMC4Q5T2S8 1044 aa8.36□□□□□ -1.07
LMO3-212ENST00000535535 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa8.36□□□□□ -1.07
LMO3-212ENST00000535535 C10orf67Q8IYJ2 551 aa8.36□□□□□ -1.07
LMO3-212ENST00000535535 TTC39CQ8N584 583 aa8.36□□□□□ -1.07
LMO3-212ENST00000535535 PGBD4Q96DM1 585 aa8.36□□□□□ -1.07
LMO3-212ENST00000535535 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
LMO3-212ENST00000535535 WDR11Q9BZH6 1224 aa8.36□□□□□ -1.07
LMO3-212ENST00000535535 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
LMO3-212ENST00000535535 BOLA2Q9H3K6 86 aa8.36□□□□□ -1.07
LMO3-212ENST00000535535 HDAC6Q9UBN7 1215 aa8.36□□□□□ -1.07
LMO3-212ENST00000535535 SRPK3Q9UPE1 567 aa8.36□□□□□ -1.07
LMO3-212ENST00000535535 PRELID1Q9Y255 219 aa8.36□□□□□ -1.07
LMO3-212ENST00000535535 SNX5Q9Y5X3 404 aa8.36□□□□□ -1.07
LMO3-212ENST00000535535 DMDP11532 3685 aa8.35□□□□□ -1.07
LMO3-212ENST00000535535 A0A1B0GUA9 196 aa8.35□□□□□ -1.07
LMO3-212ENST00000535535 GSG1L2A8MUP6 293 aa8.35□□□□□ -1.07
LMO3-212ENST00000535535 H0Y858 1186 aa8.35□□□□□ -1.07
LMO3-212ENST00000535535 TTI1O43156 1089 aa8.35□□□□□ -1.07
LMO3-212ENST00000535535 PLA2G6O60733 806 aa8.35□□□□□ -1.07
LMO3-212ENST00000535535 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
LMO3-212ENST00000535535 C6P13671 934 aa8.35□□□□□ -1.07
LMO3-212ENST00000535535 ATP5JP18859 108 aa8.35□□□□□ -1.07
LMO3-212ENST00000535535 TACR2P21452 398 aa8.35□□□□□ -1.07
LMO3-212ENST00000535535 ELF1P32519 619 aa8.35□□□□□ -1.07
LMO3-212ENST00000535535 RAB27AP51159 221 aa8.35□□□□□ -1.07
LMO3-212ENST00000535535 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
LMO3-212ENST00000535535 BPIFB3P59826 476 aa8.35□□□□□ -1.07
LMO3-212ENST00000535535 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
LMO3-212ENST00000535535 ACAP1Q15027 740 aa8.35□□□□□ -1.07
LMO3-212ENST00000535535 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
LMO3-212ENST00000535535 SPATA1Q5VX52 437 aa8.35□□□□□ -1.07
LMO3-212ENST00000535535 CRIP3Q6Q6R5 217 aa8.35□□□□□ -1.07
LMO3-212ENST00000535535 UNC5DQ6UXZ4 953 aa8.35□□□□□ -1.07
LMO3-212ENST00000535535 RASGRP2Q7LDG7 609 aa8.35□□□□□ -1.07
LMO3-212ENST00000535535 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
LMO3-212ENST00000535535 FAM160B2Q86V87 743 aa8.35□□□□□ -1.07
LMO3-212ENST00000535535 CEP57Q86XR8 500 aa8.35□□□□□ -1.07
LMO3-212ENST00000535535 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa8.35□□□□□ -1.07
LMO3-212ENST00000535535 TNIP2Q8NFZ5 429 aa8.35□□□□□ -1.07
LMO3-212ENST00000535535 TRIM58Q8NG06 486 aa8.35□□□□□ -1.07
LMO3-212ENST00000535535 OR6J1Q8NGC5 347 aa8.35□□□□□ -1.07
LMO3-212ENST00000535535 CAGE1Q8TC20 777 aa8.35□□□□□ -1.07
LMO3-212ENST00000535535 SPATA18Q8TC71 538 aa8.35□□□□□ -1.07
LMO3-212ENST00000535535 AFAP1L1Q8TED9 768 aa8.35□□□□□ -1.07
LMO3-212ENST00000535535 CHURC1Q8WUH1 139 aa8.35□□□□□ -1.07
LMO3-212ENST00000535535 APPBP2Q92624 585 aa8.35□□□□□ -1.07
LMO3-212ENST00000535535 ANKS1AQ92625 1134 aa8.35□□□□□ -1.07
LMO3-212ENST00000535535 SH3KBP1Q96B97 665 aa8.35□□□□□ -1.07
LMO3-212ENST00000535535 KIF1BPQ96EK5 621 aa8.35□□□□□ -1.07
LMO3-212ENST00000535535 CTAGE1Q96RT6 745 aa8.35□□□□□ -1.07
LMO3-212ENST00000535535 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
LMO3-212ENST00000535535 RAD9AQ99638 391 aa8.35□□□□□ -1.07
LMO3-212ENST00000535535 BRD8Q9H0E9 1235 aa8.35□□□□□ -1.07
LMO3-212ENST00000535535 ARNT2Q9HBZ2 717 aa8.35□□□□□ -1.07
LMO3-212ENST00000535535 TMEM165Q9HC07 324 aa8.35□□□□□ -1.07
LMO3-212ENST00000535535 AIPL1Q9NZN9 384 aa8.35□□□□□ -1.07
LMO3-212ENST00000535535 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
LMO3-212ENST00000535535 V9GYY5 206 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
LMO3-212ENST00000535535 PLXNA3P51805 1871 aa8.35□□□□□ -1.07
LMO3-212ENST00000535535 AQP7O14520 342 aa8.34□□□□□ -1.07
LMO3-212ENST00000535535 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
LMO3-212ENST00000535535 PDPK1O15530 556 aa8.34□□□□□ -1.07
LMO3-212ENST00000535535 PRDM1O75626 825 aa8.34□□□□□ -1.07
LMO3-212ENST00000535535 CXCL10P02778 98 aa8.34□□□□□ -1.07
LMO3-212ENST00000535535 AMPD3Q01432 767 aa8.34□□□□□ -1.07
LMO3-212ENST00000535535 PAK1Q13153 545 aa8.34□□□□□ -1.07
LMO3-212ENST00000535535 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.4 ms