RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533719.1

AIFM1-208, Transcript of apoptosis inducing factor mitochondria associated 1, human

TSL 2

Gene AIFM1, Length 845 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AIFM1-208	ENST00000533719	PCDH18	Q9HCL0	1135 aa		11.27	□□□□□ -0.61
AIFM1-208	ENST00000533719	TMEM51	Q9NW97	253 aa		11.27	□□□□□ -0.61
AIFM1-208	ENST00000533719	SLTM	Q9NWH9	1034 aa	Known RBP eCLIP	11.27	□□□□□ -0.61
AIFM1-208	ENST00000533719	CLIC5	Q9NZA1	410 aa		11.27	□□□□□ -0.61
AIFM1-208	ENST00000533719	FAM120A	Q9NZB2	1118 aa	Known RBP eCLIP	11.27	□□□□□ -0.61
AIFM1-208	ENST00000533719	UXT	Q9UBK9	157 aa	Predicted RBP	11.27	□□□□□ -0.61
AIFM1-208	ENST00000533719	RASAL2	Q9UJF2	1139 aa		11.27	□□□□□ -0.61
AIFM1-208	ENST00000533719	IRAK3	Q9Y616	596 aa		11.27	□□□□□ -0.61
AIFM1-208	ENST00000533719		H3BRJ5	948 aa		11.26	□□□□□ -0.61
AIFM1-208	ENST00000533719	FSCN2	O14926	492 aa		11.26	□□□□□ -0.61
AIFM1-208	ENST00000533719	ARHGEF15	O94989	841 aa		11.26	□□□□□ -0.61
AIFM1-208	ENST00000533719	IGLV3-25	P01717	112 aa		11.26	□□□□□ -0.61
AIFM1-208	ENST00000533719	C8A	P07357	584 aa		11.26	□□□□□ -0.61
AIFM1-208	ENST00000533719	RARG	P13631	454 aa		11.26	□□□□□ -0.61
AIFM1-208	ENST00000533719	KLRC2	P26717	231 aa		11.26	□□□□□ -0.61
AIFM1-208	ENST00000533719	CHRNA3	P32297	505 aa		11.26	□□□□□ -0.61
AIFM1-208	ENST00000533719	DYNLT1	P63172	113 aa		11.26	□□□□□ -0.61
AIFM1-208	ENST00000533719	SCAP	Q12770	1279 aa		11.26	□□□□□ -0.61
AIFM1-208	ENST00000533719	KLF1	Q13351	362 aa	Predicted RBP	11.26	□□□□□ -0.61
AIFM1-208	ENST00000533719	TFDP2	Q14188	446 aa		11.26	□□□□□ -0.61
AIFM1-208	ENST00000533719	LLGL1	Q15334	1064 aa		11.26	□□□□□ -0.61
AIFM1-208	ENST00000533719	ZC3H12A	Q5D1E8	599 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
AIFM1-208	ENST00000533719	PPP6R3	Q5H9R7	873 aa	Predicted RBP	11.26	□□□□□ -0.61
AIFM1-208	ENST00000533719	BRMS1L	Q5PSV4	323 aa		11.26	□□□□□ -0.61
AIFM1-208	ENST00000533719	PPP2R2D	Q66LE6	453 aa		11.26	□□□□□ -0.61
AIFM1-208	ENST00000533719	GPR161	Q8N6U8	529 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
AIFM1-208	ENST00000533719	C12orf50	Q8NA57	414 aa	Predicted RBP	11.26	□□□□□ -0.61
AIFM1-208	ENST00000533719	SPPL3	Q8TCT6	385 aa		11.26	□□□□□ -0.61
AIFM1-208	ENST00000533719	RUBCN	Q92622	972 aa		11.26	□□□□□ -0.61
AIFM1-208	ENST00000533719	TRMT2B	Q96GJ1	504 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
AIFM1-208	ENST00000533719	ZNF512	Q96ME7	567 aa	Predicted RBP	11.26	□□□□□ -0.61
AIFM1-208	ENST00000533719	GCNA	Q96QF7	691 aa		11.26	□□□□□ -0.61
AIFM1-208	ENST00000533719	KCTD15	Q96SI1	283 aa	Predicted RBP	11.26	□□□□□ -0.61
AIFM1-208	ENST00000533719	NACA2	Q9H009	215 aa		11.26	□□□□□ -0.61
AIFM1-208	ENST00000533719	WDR6	Q9NNW5	1121 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
AIFM1-208	ENST00000533719	HOMER3	Q9NSC5	361 aa		11.26	□□□□□ -0.61
AIFM1-208	ENST00000533719	MTPAP	Q9NVV4	582 aa	Known RBP eCLIP	11.26	□□□□□ -0.61
AIFM1-208	ENST00000533719	CALCOCO1	Q9P1Z2	691 aa		11.26	□□□□□ -0.61
AIFM1-208	ENST00000533719	RCOR3	Q9P2K3	495 aa	Predicted RBP	11.26	□□□□□ -0.61
AIFM1-208	ENST00000533719	MSRA	Q9UJ68	235 aa		11.26	□□□□□ -0.61
AIFM1-208	ENST00000533719	FZD10	Q9ULW2	581 aa		11.26	□□□□□ -0.61
AIFM1-208	ENST00000533719	EFR3B	Q9Y2G0	817 aa		11.26	□□□□□ -0.61
AIFM1-208	ENST00000533719	YBX2	Q9Y2T7	364 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
AIFM1-208	ENST00000533719	TCRBV7S2A1N4T	A0A589	114 aa		11.25	□□□□□ -0.61
AIFM1-208	ENST00000533719	C2orf71	A6NGG8	1288 aa		11.25	□□□□□ -0.61
AIFM1-208	ENST00000533719	C3orf70	A6NLC5	250 aa	Predicted RBP	11.25	□□□□□ -0.61
AIFM1-208	ENST00000533719	DYNC1I1	O14576	645 aa		11.25	□□□□□ -0.61
AIFM1-208	ENST00000533719	APOL1	O14791	398 aa		11.25	□□□□□ -0.61
AIFM1-208	ENST00000533719	MSI1	O43347	362 aa	Known RBP	11.25	□□□□□ -0.61
AIFM1-208	ENST00000533719	TGM5	O43548	720 aa		11.25	□□□□□ -0.61
AIFM1-208	ENST00000533719	TLR5	O60602	858 aa		11.25	□□□□□ -0.61
AIFM1-208	ENST00000533719	APOE	P02649	317 aa		11.25	□□□□□ -0.61
AIFM1-208	ENST00000533719	CD48	P09326	243 aa		11.25	□□□□□ -0.61
AIFM1-208	ENST00000533719	KRT10	P13645	584 aa		11.25	□□□□□ -0.61
AIFM1-208	ENST00000533719	CCR1	P32246	355 aa		11.25	□□□□□ -0.61
AIFM1-208	ENST00000533719	ZNF135	P52742	658 aa	Predicted RBP	11.25	□□□□□ -0.61
AIFM1-208	ENST00000533719	ERVFC1	P60507	584 aa		11.25	□□□□□ -0.61
AIFM1-208	ENST00000533719	ERVK-21	P61565	698 aa		11.25	□□□□□ -0.61
AIFM1-208	ENST00000533719	EFEMP1	Q12805	493 aa		11.25	□□□□□ -0.61
AIFM1-208	ENST00000533719	NNT	Q13423	1086 aa		11.25	□□□□□ -0.61
AIFM1-208	ENST00000533719	GPM6B	Q13491	265 aa		11.25	□□□□□ -0.61
AIFM1-208	ENST00000533719	DHX34	Q14147	1143 aa	Known RBP	11.25	□□□□□ -0.61
AIFM1-208	ENST00000533719	SIX1	Q15475	284 aa	Predicted RBP	11.25	□□□□□ -0.61
AIFM1-208	ENST00000533719	TAZ	Q16635	292 aa		11.25	□□□□□ -0.61
AIFM1-208	ENST00000533719	CYP1B1	Q16678	543 aa		11.25	□□□□□ -0.61
AIFM1-208	ENST00000533719	CA9	Q16790	459 aa		11.25	□□□□□ -0.61
AIFM1-208	ENST00000533719	GLE1	Q53GS7	698 aa	Known RBP	11.25	□□□□□ -0.61
AIFM1-208	ENST00000533719	C10orf120	Q5SQS8	335 aa		11.25	□□□□□ -0.61
AIFM1-208	ENST00000533719	PDE12	Q6L8Q7	609 aa	Known RBP	11.25	□□□□□ -0.61
AIFM1-208	ENST00000533719	ELMSAN1	Q6PJG2	1045 aa		11.25	□□□□□ -0.61
AIFM1-208	ENST00000533719	BBS12	Q6ZW61	710 aa		11.25	□□□□□ -0.61
AIFM1-208	ENST00000533719	SPRED2	Q7Z698	418 aa		11.25	□□□□□ -0.61
AIFM1-208	ENST00000533719	PRELID2	Q8N945	189 aa		11.25	□□□□□ -0.61
AIFM1-208	ENST00000533719	TTC13	Q8NBP0	860 aa		11.25	□□□□□ -0.61
AIFM1-208	ENST00000533719	KREMEN2	Q8NCW0	462 aa		11.25	□□□□□ -0.61
AIFM1-208	ENST00000533719	CMAS	Q8NFW8	434 aa	Predicted RBP	11.25	□□□□□ -0.61
AIFM1-208	ENST00000533719	CCDC26	Q8TAB7	109 aa		11.25	□□□□□ -0.61
AIFM1-208	ENST00000533719	MICAL1	Q8TDZ2	1067 aa		11.25	□□□□□ -0.61
AIFM1-208	ENST00000533719	GRK7	Q8WTQ7	553 aa		11.25	□□□□□ -0.61
AIFM1-208	ENST00000533719	CASP10	Q92851	521 aa		11.25	□□□□□ -0.61
AIFM1-208	ENST00000533719	PSMG2	Q969U7	264 aa		11.25	□□□□□ -0.61
AIFM1-208	ENST00000533719	MAGOHB	Q96A72	148 aa	Known RBP	11.25	□□□□□ -0.61
AIFM1-208	ENST00000533719	HAUS1	Q96CS2	278 aa		11.25	□□□□□ -0.61
AIFM1-208	ENST00000533719	CCDC114	Q96M63	670 aa		11.25	□□□□□ -0.61
AIFM1-208	ENST00000533719	EPAS1	Q99814	870 aa		11.25	□□□□□ -0.61
AIFM1-208	ENST00000533719	GDF15	Q99988	308 aa		11.25	□□□□□ -0.61
AIFM1-208	ENST00000533719	HERPUD2	Q9BSE4	406 aa		11.25	□□□□□ -0.61
AIFM1-208	ENST00000533719	MAK16	Q9BXY0	300 aa	Known RBP	11.25	□□□□□ -0.61
AIFM1-208	ENST00000533719	TRPM5	Q9NZQ8	1165 aa		11.25	□□□□□ -0.61
AIFM1-208	ENST00000533719	ASB3	Q9Y575	518 aa		11.25	□□□□□ -0.61
AIFM1-208	ENST00000533719	TARSL2	A2RTX5	802 aa	Known RBP	11.24	□□□□□ -0.61
AIFM1-208	ENST00000533719	SPDYE4	A6NLX3	237 aa		11.24	□□□□□ -0.61
AIFM1-208	ENST00000533719	HIDE1	A8MVS5	230 aa		11.24	□□□□□ -0.61
AIFM1-208	ENST00000533719	APOC4-APOC2	K7ER74	178 aa		11.24	□□□□□ -0.61
AIFM1-208	ENST00000533719	EEF2K	O00418	725 aa	Known RBP	11.24	□□□□□ -0.61
AIFM1-208	ENST00000533719	MCF2L	O15068	1137 aa		11.24	□□□□□ -0.61
AIFM1-208	ENST00000533719	GRM6	O15303	877 aa		11.24	□□□□□ -0.61
AIFM1-208	ENST00000533719	RAD51C	O43502	376 aa		11.24	□□□□□ -0.61
AIFM1-208	ENST00000533719	CST8	O60676	142 aa		11.24	□□□□□ -0.61
AIFM1-208	ENST00000533719	HEXIM1	O94992	359 aa	Known RBP	11.24	□□□□□ -0.61

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