RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533170.1

AP003555.2-202, humanhuman

TSL 3

Gene AP003555.2, Length 369 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP003555.2-202ENST00000533170 CYP3A7P24462 503 aa5.99□□□□□ -1.45
AP003555.2-202ENST00000533170 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP5.99□□□□□ -1.45
AP003555.2-202ENST00000533170 CRABP2P29373 138 aa5.99□□□□□ -1.45
AP003555.2-202ENST00000533170 SERPINB6P35237 376 aa5.99□□□□□ -1.45
AP003555.2-202ENST00000533170 ARL3P36405 182 aa5.99□□□□□ -1.45
AP003555.2-202ENST00000533170 WNT5AP41221 380 aa5.99□□□□□ -1.45
AP003555.2-202ENST00000533170 KRT6CP48668 564 aa5.99□□□□□ -1.45
AP003555.2-202ENST00000533170 RGS19P49795 217 aa5.99□□□□□ -1.45
AP003555.2-202ENST00000533170 ZNF81P51508 661 aa5.99□□□□□ -1.45
AP003555.2-202ENST00000533170 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
AP003555.2-202ENST00000533170 RAD23AP54725 363 aa5.99□□□□□ -1.45
AP003555.2-202ENST00000533170 RNF4P78317 190 aa5.99□□□□□ -1.45
AP003555.2-202ENST00000533170 SLFN5Q08AF3 891 aa5.99□□□□□ -1.45
AP003555.2-202ENST00000533170 SEMA5AQ13591 1074 aa5.99□□□□□ -1.45
AP003555.2-202ENST00000533170 E2F2Q14209 437 aa5.99□□□□□ -1.45
AP003555.2-202ENST00000533170 NCAPHQ15003 741 aa5.99□□□□□ -1.45
AP003555.2-202ENST00000533170 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
AP003555.2-202ENST00000533170 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
AP003555.2-202ENST00000533170 UBE3CQ15386 1083 aa5.99□□□□□ -1.45
AP003555.2-202ENST00000533170 ALX1Q15699 326 aa5.99□□□□□ -1.45
AP003555.2-202ENST00000533170 CHRNA6Q15825 494 aa5.99□□□□□ -1.45
AP003555.2-202ENST00000533170 ARHGAP44Q17R89 818 aa5.99□□□□□ -1.45
AP003555.2-202ENST00000533170 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
AP003555.2-202ENST00000533170 SNAP47Q5SQN1 464 aa5.99□□□□□ -1.45
AP003555.2-202ENST00000533170 LIN9Q5TKA1 542 aa5.99□□□□□ -1.45
AP003555.2-202ENST00000533170 PIK3R6Q5UE93 754 aa5.99□□□□□ -1.45
AP003555.2-202ENST00000533170 CES4AQ5XG92 561 aa5.99□□□□□ -1.45
AP003555.2-202ENST00000533170 ETFRF1Q6IPR1 90 aa5.99□□□□□ -1.45
AP003555.2-202ENST00000533170 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
AP003555.2-202ENST00000533170 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
AP003555.2-202ENST00000533170 CYB5D1Q6P9G0 228 aa5.99□□□□□ -1.45
AP003555.2-202ENST00000533170 LRRC31Q6UY01 552 aa5.99□□□□□ -1.45
AP003555.2-202ENST00000533170 KDM7AQ6ZMT4 941 aa5.99□□□□□ -1.45
AP003555.2-202ENST00000533170 TRIM72Q6ZMU5 477 aa5.99□□□□□ -1.45
AP003555.2-202ENST00000533170 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
AP003555.2-202ENST00000533170 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
AP003555.2-202ENST00000533170 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
AP003555.2-202ENST00000533170 TXNRD3Q86VQ6 643 aa5.99□□□□□ -1.45
AP003555.2-202ENST00000533170 KSR1Q8IVT5 923 aa5.99□□□□□ -1.45
AP003555.2-202ENST00000533170 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
AP003555.2-202ENST00000533170 KRT78Q8N1N4 520 aa5.99□□□□□ -1.45
AP003555.2-202ENST00000533170 ANKFN1Q8N957 763 aa5.99□□□□□ -1.45
AP003555.2-202ENST00000533170 ZNF507Q8TCN5 953 aa5.99□□□□□ -1.45
AP003555.2-202ENST00000533170 GANCQ8TET4 914 aa5.99□□□□□ -1.45
AP003555.2-202ENST00000533170 ZNF384Q8TF68 577 aa5.99□□□□□ -1.45
AP003555.2-202ENST00000533170 HASPINQ8TF76 798 aa5.99□□□□□ -1.45
AP003555.2-202ENST00000533170 IRGQQ8WZA9 623 aa5.99□□□□□ -1.45
AP003555.2-202ENST00000533170 HTRA1Q92743 480 aa5.99□□□□□ -1.45
AP003555.2-202ENST00000533170 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
AP003555.2-202ENST00000533170 DPF1Q92782 380 aa5.99□□□□□ -1.45
AP003555.2-202ENST00000533170 KIAA1191Q96A73 305 aa5.99□□□□□ -1.45
AP003555.2-202ENST00000533170 CYTH2Q99418 400 aa5.99□□□□□ -1.45
AP003555.2-202ENST00000533170 CIB1Q99828 191 aa5.99□□□□□ -1.45
AP003555.2-202ENST00000533170 KCNS3Q9BQ31 491 aa5.99□□□□□ -1.45
AP003555.2-202ENST00000533170 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
AP003555.2-202ENST00000533170 CNPPD1Q9BV87 410 aa5.99□□□□□ -1.45
AP003555.2-202ENST00000533170 LACRTQ9GZZ8 138 aa5.99□□□□□ -1.45
AP003555.2-202ENST00000533170 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
AP003555.2-202ENST00000533170 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
AP003555.2-202ENST00000533170 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
AP003555.2-202ENST00000533170 LIN7BQ9HAP6 207 aa5.99□□□□□ -1.45
AP003555.2-202ENST00000533170 NTN4Q9HB63 628 aa5.99□□□□□ -1.45
AP003555.2-202ENST00000533170 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa5.99□□□□□ -1.45
AP003555.2-202ENST00000533170 VCX3AQ9NNX9 186 aa5.99□□□□□ -1.45
AP003555.2-202ENST00000533170 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa5.99□□□□□ -1.45
AP003555.2-202ENST00000533170 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
AP003555.2-202ENST00000533170 TMEM39AQ9NV64 488 aa5.99□□□□□ -1.45
AP003555.2-202ENST00000533170 LRFN1Q9P244 771 aa5.99□□□□□ -1.45
AP003555.2-202ENST00000533170 COPG2Q9UBF2 871 aa5.99□□□□□ -1.45
AP003555.2-202ENST00000533170 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
AP003555.2-202ENST00000533170 STK17AQ9UEE5 414 aa5.99□□□□□ -1.45
AP003555.2-202ENST00000533170 ASIC3Q9UHC3 531 aa5.99□□□□□ -1.45
AP003555.2-202ENST00000533170 ASB3Q9Y575 518 aa5.99□□□□□ -1.45
AP003555.2-202ENST00000533170 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
AP003555.2-202ENST00000533170 FADS3Q9Y5Q0 445 aa5.99□□□□□ -1.45
AP003555.2-202ENST00000533170 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
AP003555.2-202ENST00000533170 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa5.98□□□□□ -1.45
AP003555.2-202ENST00000533170 RHPN2P1A8MT19 583 aa5.98□□□□□ -1.45
AP003555.2-202ENST00000533170 GOLGA8KD6RF30 607 aa5.98□□□□□ -1.45
AP003555.2-202ENST00000533170 HIP1O00291 1037 aa5.98□□□□□ -1.45
AP003555.2-202ENST00000533170 NEMP1O14524 444 aa5.98□□□□□ -1.45
AP003555.2-202ENST00000533170 ZNF263O14978 683 aa5.98□□□□□ -1.45
AP003555.2-202ENST00000533170 ANGPT2O15123 496 aa5.98□□□□□ -1.45
AP003555.2-202ENST00000533170 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
AP003555.2-202ENST00000533170 CTIFO43310 598 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
AP003555.2-202ENST00000533170 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
AP003555.2-202ENST00000533170 BEST1O76090 585 aa5.98□□□□□ -1.45
AP003555.2-202ENST00000533170 RECQL4O94761 1208 aa5.98□□□□□ -1.45
AP003555.2-202ENST00000533170 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
AP003555.2-202ENST00000533170 FKBP9O95302 570 aa5.98□□□□□ -1.45
AP003555.2-202ENST00000533170 FGF4P08620 206 aa5.98□□□□□ -1.45
AP003555.2-202ENST00000533170 GSTA2P09210 222 aa5.98□□□□□ -1.45
AP003555.2-202ENST00000533170 STAG3L3P0CL85 134 aa5.98□□□□□ -1.45
AP003555.2-202ENST00000533170 CSH1P0DML2 217 aa5.98□□□□□ -1.45
AP003555.2-202ENST00000533170 CSH2P0DML3 217 aa5.98□□□□□ -1.45
AP003555.2-202ENST00000533170 GAAP10253 952 aa5.98□□□□□ -1.45
AP003555.2-202ENST00000533170 CHN1P15882 459 aa5.98□□□□□ -1.45
AP003555.2-202ENST00000533170 SLC9A1P19634 815 aa5.98□□□□□ -1.45
AP003555.2-202ENST00000533170 CCNA2P20248 432 aa5.98□□□□□ -1.45
AP003555.2-202ENST00000533170 COL8A1P27658 744 aa5.98□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.6 ms