RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517316.1

IGHVII-40-1-201, Transcript of immunoglobulin heavy variable (II)-40-1 (pseudogene), humanhuman

BASIC

Gene IGHVII-40-1, Length 58 nt, Biotype IG V pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 EPHA3P29320 983 aa1.23□□□□□ -2.21
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RFX2P48378 723 aa1.23□□□□□ -2.21
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP1.23□□□□□ -2.21
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP1.23□□□□□ -2.21
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ITGA8P53708 1063 aa1.23□□□□□ -2.21
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 WDR5P61964 334 aaKnown RBP1.23□□□□□ -2.21
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RAB1AP62820 205 aa1.23□□□□□ -2.21
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ABATP80404 500 aa1.23□□□□□ -2.21
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 Q0VFX4 171 aa1.23□□□□□ -2.21
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 KIF5AQ12840 1032 aa1.23□□□□□ -2.21
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP1.23□□□□□ -2.21
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IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SHBQ15464 509 aa1.23□□□□□ -2.21
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PTPN21Q16825 1174 aa1.23□□□□□ -2.21
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP1.23□□□□□ -2.21
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FAM110CQ1W6H9 321 aa1.23□□□□□ -2.21
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IGHVII-40-1-201ENST00000517316 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa1.23□□□□□ -2.21
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SWSAP1Q6NVH7 229 aa1.23□□□□□ -2.21
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP1.23□□□□□ -2.21
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MORC1Q86VD1 984 aa1.23□□□□□ -2.21
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MICU3Q86XE3 530 aa1.23□□□□□ -2.21
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CHPFQ8IZ52 775 aa1.23□□□□□ -2.21
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SPARTQ8N0X7 666 aa1.23□□□□□ -2.21
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MIER2Q8N344 545 aa1.23□□□□□ -2.21
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP1.23□□□□□ -2.21
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PNPLA1Q8N8W4 532 aa1.23□□□□□ -2.21
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 BCAS4Q8TDM0 211 aa1.23□□□□□ -2.21
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa1.23□□□□□ -2.21
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MVB12AQ96EY5 273 aa1.23□□□□□ -2.21
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PKP4Q99569 1192 aa1.23□□□□□ -2.21
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CGRRF1Q99675 332 aa1.23□□□□□ -2.21
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SLC13A1Q9BZW2 595 aa1.23□□□□□ -2.21
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP1.23□□□□□ -2.21
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MAP6D1Q9H9H5 199 aa1.23□□□□□ -2.21
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 USP29Q9HBJ7 922 aa1.23□□□□□ -2.21
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 VPS51Q9UID3 782 aa1.23□□□□□ -2.21
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ANAPC4Q9UJX5 808 aa1.23□□□□□ -2.21
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MYO6Q9UM54 1294 aa1.23□□□□□ -2.21
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 USP22Q9UPT9 525 aa1.23□□□□□ -2.21
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 DTX4Q9Y2E6 619 aa1.23□□□□□ -2.21
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NOTCH2Q04721 2471 aa1.23□□□□□ -2.21
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 EVPLQ92817 2033 aa1.22□□□□□ -2.21
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 A8MVJ9 347 aa1.22□□□□□ -2.21
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 BTN3A1O00481 513 aa1.22□□□□□ -2.21
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP1.22□□□□□ -2.21
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LCATP04180 440 aa1.22□□□□□ -2.21
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CD63P08962 238 aa1.22□□□□□ -2.21
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZNF12P17014 697 aa1.22□□□□□ -2.21
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ADRA1DP25100 572 aa1.22□□□□□ -2.21
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ITGB8P26012 769 aa1.22□□□□□ -2.21
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PCYT1AP49585 367 aa1.22□□□□□ -2.21
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 JAK3P52333 1124 aa1.22□□□□□ -2.21
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ART1P52961 327 aa1.22□□□□□ -2.21
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 COPAP53621 1224 aa1.22□□□□□ -2.21
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP1.22□□□□□ -2.21
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 POU5F1BQ06416 359 aa1.22□□□□□ -2.21
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CRYZQ08257 329 aaKnown RBP1.22□□□□□ -2.21
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MTAPQ13126 283 aa1.22□□□□□ -2.21
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CACHD1Q5VU97 1274 aa1.22□□□□□ -2.21
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP1.22□□□□□ -2.21
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa1.22□□□□□ -2.21
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MTMR8Q96EF0 704 aa1.22□□□□□ -2.21
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NODALQ96S42 347 aa1.22□□□□□ -2.21
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP1.22□□□□□ -2.21
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP1.22□□□□□ -2.21
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa1.22□□□□□ -2.21
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SPAG4Q9NPE6 437 aa1.22□□□□□ -2.21
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FZD3Q9NPG1 666 aa1.22□□□□□ -2.21
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TRIM36Q9NQ86 728 aa1.22□□□□□ -2.21
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa1.22□□□□□ -2.21
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP1.22□□□□□ -2.21
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ARL8BQ9NVJ2 186 aa1.22□□□□□ -2.21
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 STK32BQ9NY57 414 aa1.22□□□□□ -2.21
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP1.22□□□□□ -2.21
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 WNT16Q9UBV4 365 aa1.22□□□□□ -2.21
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 UTS2RQ9UKP6 389 aa1.22□□□□□ -2.21
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MAFFQ9ULX9 164 aa1.22□□□□□ -2.21
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa1.22□□□□□ -2.21
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MRFAP1Q9Y605 127 aa1.22□□□□□ -2.21
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP1.21□□□□□ -2.22
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa1.21□□□□□ -2.22
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RPS10-NUDT3A0A1W2PQS6 291 aa1.21□□□□□ -2.22
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FAM227AF5H4B4 570 aa1.21□□□□□ -2.22
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RGS14O43566 566 aa1.21□□□□□ -2.22
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RASAL1O95294 804 aa1.21□□□□□ -2.22
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LDLRP01130 860 aa1.21□□□□□ -2.22
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 IFNA2P01563 188 aa1.21□□□□□ -2.22
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 IGLV2-11P01706 119 aa1.21□□□□□ -2.22
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 THP07101 528 aa1.21□□□□□ -2.22
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP1.21□□□□□ -2.22
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 IL1R1P14778 569 aa1.21□□□□□ -2.22
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 HSD3B2P26439 372 aa1.21□□□□□ -2.22
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 HOXC13P31276 330 aa1.21□□□□□ -2.22
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GLIPR1P48060 266 aa1.21□□□□□ -2.22
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP1.21□□□□□ -2.22
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CXCR3P49682 368 aa1.21□□□□□ -2.22
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GATMP50440 423 aa1.21□□□□□ -2.22
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZNF84P51523 738 aa1.21□□□□□ -2.22
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