RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516876.1

RNU6-928P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 928, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-928P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-928P-201ENST00000516876 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 GPHA2Q96T91 129 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 VKORC1Q9BQB6 163 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 OR10A4Q9H209 315 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 SH2D4AQ9H788 454 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 KAT14Q9H8E8 782 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 GRPEL1Q9HAV7 217 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 BRF2Q9HAW0 419 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 PLEKHA2Q9HB19 425 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 ARHGEF3Q9NR81 526 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 ABCF3Q9NUQ8 709 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 MRGBPQ9NV56 204 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 ETAA1Q9NY74 926 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 MPP6Q9NZW5 540 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 NTMQ9P121 344 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 VPS51Q9UID3 782 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 ADAM29Q9UKF5 820 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 CDYLQ9Y232 598 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 PIAS3Q9Y6X2 628 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-928P-201ENST00000516876 GXYLT2A0PJZ3 443 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-928P-201ENST00000516876 SLC38A8A6NNN8 435 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-928P-201ENST00000516876 PSMD9O00233 223 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-928P-201ENST00000516876 DCLK1O15075 740 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-928P-201ENST00000516876 MFAP3LO75121 409 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-928P-201ENST00000516876 SEMA7AO75326 666 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-928P-201ENST00000516876 WDR47O94967 919 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-928P-201ENST00000516876 CFIP05156 583 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-928P-201ENST00000516876 ITGB1P05556 798 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-928P-201ENST00000516876 ADRB2P07550 413 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-928P-201ENST00000516876 COX7A2P14406 83 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-928P-201ENST00000516876 ATP6V1B1P15313 513 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-928P-201ENST00000516876 SPINK2P20155 84 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-928P-201ENST00000516876 GCSHP23434 173 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-928P-201ENST00000516876 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
RNU6-928P-201ENST00000516876 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
RNU6-928P-201ENST00000516876 UQCRC1P31930 480 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-928P-201ENST00000516876 CSF2RBP32927 897 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-928P-201ENST00000516876 GGT5P36269 586 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-928P-201ENST00000516876 HARS2P49590 506 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
RNU6-928P-201ENST00000516876 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
RNU6-928P-201ENST00000516876 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
RNU6-928P-201ENST00000516876 NEXNQ0ZGT2 675 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-928P-201ENST00000516876 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
RNU6-928P-201ENST00000516876 DOC2BQ14184 412 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-928P-201ENST00000516876 ACOX1Q15067 660 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-928P-201ENST00000516876 KCNMB1Q16558 191 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-928P-201ENST00000516876 NTRK2Q16620 822 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-928P-201ENST00000516876 TBR1Q16650 682 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-928P-201ENST00000516876 LRRC24Q50LG9 513 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-928P-201ENST00000516876 RUNDC3AQ59EK9 446 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-928P-201ENST00000516876 ZNF766Q5HY98 468 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-928P-201ENST00000516876 PRR31Q5SQ13 230 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-928P-201ENST00000516876 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
RNU6-928P-201ENST00000516876 FYB2Q5VWT5 728 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-928P-201ENST00000516876 MSANTD2Q6P1R3 559 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-928P-201ENST00000516876 TAF2Q6P1X5 1199 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-928P-201ENST00000516876 NCEH1Q6PIU2 408 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-928P-201ENST00000516876 FAM111BQ6SJ93 734 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-928P-201ENST00000516876 CLEC9AQ6UXN8 241 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-928P-201ENST00000516876 CLNKQ7Z7G1 428 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-928P-201ENST00000516876 ZNF605Q86T29 641 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-928P-201ENST00000516876 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
RNU6-928P-201ENST00000516876 FAM124AQ86V42 546 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-928P-201ENST00000516876 IQCA1Q86XH1 822 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-928P-201ENST00000516876 ZNF280BQ86YH2 543 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-928P-201ENST00000516876 ADGRF2Q8IZF7 708 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-928P-201ENST00000516876 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
RNU6-928P-201ENST00000516876 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
RNU6-928P-201ENST00000516876 NEK9Q8TD19 979 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-928P-201ENST00000516876 FAM149B1Q96BN6 582 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-928P-201ENST00000516876 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
RNU6-928P-201ENST00000516876 PWWP2AQ96N64 755 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-928P-201ENST00000516876 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
RNU6-928P-201ENST00000516876 NOX5Q96PH1 765 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-928P-201ENST00000516876 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
RNU6-928P-201ENST00000516876 NCAPGQ9BPX3 1015 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-928P-201ENST00000516876 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
RNU6-928P-201ENST00000516876 MXD3Q9BW11 206 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-928P-201ENST00000516876 SPON1Q9HCB6 807 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-928P-201ENST00000516876 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
RNU6-928P-201ENST00000516876 PFDN4Q9NQP4 134 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-928P-201ENST00000516876 FSCN3Q9NQT6 498 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-928P-201ENST00000516876 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
RNU6-928P-201ENST00000516876 PCDHGB4Q9UN71 923 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-928P-201ENST00000516876 ZDHHC9Q9Y397 364 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-928P-201ENST00000516876 SNX5Q9Y5X3 404 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-928P-201ENST00000516876 LIPT2A6NK58 231 aa3.32□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.6 ms