RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509368.6

PDE4D-218, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 2,809 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-218ENST00000509368 EYA3Q99504 573 aa2.46□□□□□ -2.02
PDE4D-218ENST00000509368 EPB41L4BQ9H329 900 aa2.46□□□□□ -2.02
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PDE4D-218ENST00000509368 LDAHQ9H6V9 325 aa2.46□□□□□ -2.02
PDE4D-218ENST00000509368 CHODLQ9H9P2 273 aa2.46□□□□□ -2.02
PDE4D-218ENST00000509368 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP2.46□□□□□ -2.02
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PDE4D-218ENST00000509368 EPS15L1Q9UBC2 864 aa2.46□□□□□ -2.02
PDE4D-218ENST00000509368 SLC23A1Q9UHI7 598 aa2.46□□□□□ -2.02
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PDE4D-218ENST00000509368 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP2.46□□□□□ -2.02
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PDE4D-218ENST00000509368 SASH1O94885 1247 aa2.46□□□□□ -2.02
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PDE4D-218ENST00000509368 CSH2P0DML3 217 aa2.46□□□□□ -2.02
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PDE4D-218ENST00000509368 CD19P15391 556 aa2.46□□□□□ -2.02
PDE4D-218ENST00000509368 FPR1P21462 350 aa2.46□□□□□ -2.02
PDE4D-218ENST00000509368 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP2.46□□□□□ -2.02
PDE4D-218ENST00000509368 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP2.46□□□□□ -2.02
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PDE4D-218ENST00000509368 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP2.46□□□□□ -2.02
PDE4D-218ENST00000509368 DUSP8Q13202 625 aa2.46□□□□□ -2.02
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PDE4D-218ENST00000509368 USP10Q14694 798 aaKnown RBP2.46□□□□□ -2.02
PDE4D-218ENST00000509368 ACAP1Q15027 740 aa2.46□□□□□ -2.02
PDE4D-218ENST00000509368 RPS6KA2Q15349 733 aa2.46□□□□□ -2.02
PDE4D-218ENST00000509368 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa2.46□□□□□ -2.02
PDE4D-218ENST00000509368 PLA1AQ53H76 456 aa2.46□□□□□ -2.02
PDE4D-218ENST00000509368 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP2.46□□□□□ -2.02
PDE4D-218ENST00000509368 MFSD14BQ5SR56 506 aa2.46□□□□□ -2.02
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PDE4D-218ENST00000509368 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP2.46□□□□□ -2.02
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PDE4D-218ENST00000509368 GDAQ9Y2T3 454 aa2.46□□□□□ -2.02
PDE4D-218ENST00000509368 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP2.45□□□□□ -2.02
PDE4D-218ENST00000509368 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP2.45□□□□□ -2.02
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PDE4D-218ENST00000509368 ABCD3P28288 659 aa2.45□□□□□ -2.02
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PDE4D-218ENST00000509368 OR1N1Q8NGS0 311 aa2.45□□□□□ -2.02
PDE4D-218ENST00000509368 POC1BQ8TC44 478 aa2.45□□□□□ -2.02
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