RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505490.2

ALYREF-202, Transcript of Aly/REF export factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ALYREF, Length 1,088 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREF-202ENST00000505490 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP31.77■■■□□ 2.68
ALYREF-202ENST00000505490 DEFB119Q8N690 84 aa31.77■■■□□ 2.68
ALYREF-202ENST00000505490 FAXDC2Q96IV6 333 aa31.77■■■□□ 2.68
ALYREF-202ENST00000505490 NIF3L1Q9GZT8 377 aa31.77■■■□□ 2.68
ALYREF-202ENST00000505490 NUDT5Q9UKK9 219 aa31.77■■■□□ 2.68
ALYREF-202ENST00000505490 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa31.76■■■□□ 2.68
ALYREF-202ENST00000505490 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa31.76■■■□□ 2.68
ALYREF-202ENST00000505490 A0A1B0GVL5 298 aa31.76■■■□□ 2.67
ALYREF-202ENST00000505490 FAM221BA6H8Z2 402 aa31.76■■■□□ 2.67
ALYREF-202ENST00000505490 ARHGAP33O14559 1287 aa31.76■■■□□ 2.67
ALYREF-202ENST00000505490 CD93Q9NPY3 652 aa31.76■■■□□ 2.67
ALYREF-202ENST00000505490 CYP8B1Q9UNU6 501 aa31.76■■■□□ 2.67
ALYREF-202ENST00000505490 ZNF510Q9Y2H8 683 aa31.76■■■□□ 2.67
ALYREF-202ENST00000505490 GJB3O75712 270 aa31.75■■■□□ 2.67
ALYREF-202ENST00000505490 GCLMP48507 274 aa31.75■■■□□ 2.67
ALYREF-202ENST00000505490 C10orf120Q5SQS8 335 aa31.75■■■□□ 2.67
ALYREF-202ENST00000505490 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP31.75■■■□□ 2.67
ALYREF-202ENST00000505490 FYB2Q5VWT5 728 aa31.75■■■□□ 2.67
ALYREF-202ENST00000505490 TADA2BQ86TJ2 420 aa31.75■■■□□ 2.67
ALYREF-202ENST00000505490 TRIML1Q8N9V2 468 aa31.75■■■□□ 2.67
ALYREF-202ENST00000505490 IMPG2Q9BZV3 1241 aa31.75■■■□□ 2.67
ALYREF-202ENST00000505490 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa31.75■■■□□ 2.67
ALYREF-202ENST00000505490 RAD54BQ9Y620 910 aa31.75■■■□□ 2.67
ALYREF-202ENST00000505490 CKAP5Q14008 2032 aa31.75■■■□□ 2.67
ALYREF-202ENST00000505490 NPC1O15118 1278 aa31.74■■■□□ 2.67
ALYREF-202ENST00000505490 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP31.74■■■□□ 2.67
ALYREF-202ENST00000505490 CD59P13987 128 aa31.74■■■□□ 2.67
ALYREF-202ENST00000505490 NR2F2P24468 414 aa31.74■■■□□ 2.67
ALYREF-202ENST00000505490 ZNF132P52740 706 aa31.74■■■□□ 2.67
ALYREF-202ENST00000505490 MINDY1Q8N5J2 469 aa31.74■■■□□ 2.67
ALYREF-202ENST00000505490 JAKMIP2Q96AA8 810 aa31.74■■■□□ 2.67
ALYREF-202ENST00000505490 HSPA12BQ96MM6 686 aa31.74■■■□□ 2.67
ALYREF-202ENST00000505490 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP31.74■■■□□ 2.67
ALYREF-202ENST00000505490 UBXN6Q9BZV1 441 aa31.74■■■□□ 2.67
ALYREF-202ENST00000505490 NAGPAQ9UK23 515 aa31.74■■■□□ 2.67
ALYREF-202ENST00000505490 MSRB2Q9Y3D2 182 aa31.74■■■□□ 2.67
ALYREF-202ENST00000505490 WASH3PC4AMC7 463 aa31.73■■■□□ 2.67
ALYREF-202ENST00000505490 OPHN1O60890 802 aa31.73■■■□□ 2.67
ALYREF-202ENST00000505490 KIF20AO95235 890 aa31.73■■■□□ 2.67
ALYREF-202ENST00000505490 TRIM49P0CI25 452 aa31.73■■■□□ 2.67
ALYREF-202ENST00000505490 TRIM49CP0CI26 452 aa31.73■■■□□ 2.67
ALYREF-202ENST00000505490 MFAP3P55082 362 aa31.73■■■□□ 2.67
ALYREF-202ENST00000505490 HDDC3Q8N4P3 179 aa31.73■■■□□ 2.67
ALYREF-202ENST00000505490 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP31.73■■■□□ 2.67
ALYREF-202ENST00000505490 SLC6A17Q9H1V8 727 aa31.73■■■□□ 2.67
ALYREF-202ENST00000505490 TMEM8AQ9HCN3 771 aa31.73■■■□□ 2.67
ALYREF-202ENST00000505490 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP31.73■■■□□ 2.67
ALYREF-202ENST00000505490 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa31.73■■■□□ 2.67
ALYREF-202ENST00000505490 STON1Q9Y6Q2 735 aa31.73■■■□□ 2.67
ALYREF-202ENST00000505490 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa31.72■■■□□ 2.67
ALYREF-202ENST00000505490 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP31.72■■■□□ 2.67
ALYREF-202ENST00000505490 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP31.72■■■□□ 2.67
ALYREF-202ENST00000505490 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP31.72■■■□□ 2.67
ALYREF-202ENST00000505490 COG7P83436 770 aa31.72■■■□□ 2.67
ALYREF-202ENST00000505490 SLC14A1Q13336 389 aa31.72■■■□□ 2.67
ALYREF-202ENST00000505490 ZCWPW2Q504Y3 356 aa31.72■■■□□ 2.67
ALYREF-202ENST00000505490 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP31.72■■■□□ 2.67
ALYREF-202ENST00000505490 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP31.72■■■□□ 2.67
ALYREF-202ENST00000505490 PLK2Q9NYY3 685 aa31.72■■■□□ 2.67
ALYREF-202ENST00000505490 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP31.72■■■□□ 2.67
ALYREF-202ENST00000505490 SYPP08247 313 aa31.71■■■□□ 2.67
ALYREF-202ENST00000505490 RALAP11233 206 aa31.71■■■□□ 2.67
ALYREF-202ENST00000505490 GTF2H1P32780 548 aa31.71■■■□□ 2.67
ALYREF-202ENST00000505490 CHKAP35790 457 aa31.71■■■□□ 2.67
ALYREF-202ENST00000505490 FAM193AP78312 1265 aa31.71■■■□□ 2.67
ALYREF-202ENST00000505490 DPYDQ12882 1025 aa31.71■■■□□ 2.67
ALYREF-202ENST00000505490 RAB41Q5JT25 222 aa31.71■■■□□ 2.67
ALYREF-202ENST00000505490 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP31.71■■■□□ 2.67
ALYREF-202ENST00000505490 DNASE2BQ8WZ79 361 aa31.71■■■□□ 2.67
ALYREF-202ENST00000505490 FOXJ1Q92949 421 aa31.71■■■□□ 2.67
ALYREF-202ENST00000505490 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP31.71■■■□□ 2.67
ALYREF-202ENST00000505490 CACNA1GO43497 2377 aa31.71■■■□□ 2.67
ALYREF-202ENST00000505490 H0Y626 953 aa31.7■■■□□ 2.67
ALYREF-202ENST00000505490 TRIM16O95361 564 aa31.7■■■□□ 2.67
ALYREF-202ENST00000505490 PRR29P0C7W0 189 aa31.7■■■□□ 2.67
ALYREF-202ENST00000505490 CD58P19256 250 aa31.7■■■□□ 2.67
ALYREF-202ENST00000505490 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP31.7■■■□□ 2.67
ALYREF-202ENST00000505490 GEN1Q17RS7 908 aa31.7■■■□□ 2.67
ALYREF-202ENST00000505490 FUT11Q495W5 492 aa31.7■■■□□ 2.67
ALYREF-202ENST00000505490 HSCBQ8IWL3 235 aa31.7■■■□□ 2.67
ALYREF-202ENST00000505490 FAM217AQ8IXS0 508 aa31.7■■■□□ 2.67
ALYREF-202ENST00000505490 FAM186BQ8IYM0 893 aa31.7■■■□□ 2.67
ALYREF-202ENST00000505490 DCLK3Q9C098 648 aa31.7■■■□□ 2.67
ALYREF-202ENST00000505490 ITM2CQ9NQX7 267 aa31.7■■■□□ 2.67
ALYREF-202ENST00000505490 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP31.7■■■□□ 2.67
ALYREF-202ENST00000505490 SUSD2Q9UGT4 822 aa31.7■■■□□ 2.67
ALYREF-202ENST00000505490 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP31.7■■■□□ 2.67
ALYREF-202ENST00000505490 C7P10643 843 aa31.69■■■□□ 2.66
ALYREF-202ENST00000505490 CD6P30203 668 aa31.69■■■□□ 2.66
ALYREF-202ENST00000505490 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP31.69■■■□□ 2.66
ALYREF-202ENST00000505490 CPXM2Q8N436 756 aa31.69■■■□□ 2.66
ALYREF-202ENST00000505490 OR2I1PQ8NGU4 316 aa31.69■■■□□ 2.66
ALYREF-202ENST00000505490 BHMTQ93088 406 aa31.69■■■□□ 2.66
ALYREF-202ENST00000505490 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP31.69■■■□□ 2.66
ALYREF-202ENST00000505490 KLK13Q9UKR3 277 aa31.69■■■□□ 2.66
ALYREF-202ENST00000505490 FREM2Q5SZK8 3169 aa31.68■■■□□ 2.66
ALYREF-202ENST00000505490 IGLV3-19P01714 112 aa31.68■■■□□ 2.66
ALYREF-202ENST00000505490 IL12RB1P42701 662 aa31.68■■■□□ 2.66
ALYREF-202ENST00000505490 ARHGAP17Q68EM7 881 aa31.68■■■□□ 2.66
ALYREF-202ENST00000505490 KRT39Q6A163 491 aa31.68■■■□□ 2.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26 ms