RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497037.5

ANKRD28-212, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 2

Gene ANKRD28, Length 3,509 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-212ENST00000497037 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP5.02□□□□□ -1.61
ANKRD28-212ENST00000497037 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP5.02□□□□□ -1.61
ANKRD28-212ENST00000497037 NME3Q13232 169 aa5.02□□□□□ -1.61
ANKRD28-212ENST00000497037 DPYSQ14117 519 aa5.02□□□□□ -1.61
ANKRD28-212ENST00000497037 CLUL1Q15846 466 aa5.02□□□□□ -1.61
ANKRD28-212ENST00000497037 KYNUQ16719 465 aa5.02□□□□□ -1.61
ANKRD28-212ENST00000497037 LONRF1Q17RB8 773 aa5.02□□□□□ -1.61
ANKRD28-212ENST00000497037 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa5.02□□□□□ -1.61
ANKRD28-212ENST00000497037 LRIG3Q6UXM1 1119 aa5.02□□□□□ -1.61
ANKRD28-212ENST00000497037 DEFB128Q7Z7B8 93 aa5.02□□□□□ -1.61
ANKRD28-212ENST00000497037 TAC4Q86UU9 113 aa5.02□□□□□ -1.61
ANKRD28-212ENST00000497037 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa5.02□□□□□ -1.61
ANKRD28-212ENST00000497037 CCDC13Q8IYE1 715 aa5.02□□□□□ -1.61
ANKRD28-212ENST00000497037 SPATA18Q8TC71 538 aa5.02□□□□□ -1.61
ANKRD28-212ENST00000497037 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP5.02□□□□□ -1.615e-8■■■■■ 65.3
ANKRD28-212ENST00000497037 DPF3Q92784 378 aa5.02□□□□□ -1.61
ANKRD28-212ENST00000497037 MYEOVQ96EZ4 313 aa5.02□□□□□ -1.61
ANKRD28-212ENST00000497037 CEP41Q9BYV8 373 aa5.02□□□□□ -1.61
ANKRD28-212ENST00000497037 DNAI2Q9GZS0 605 aa5.02□□□□□ -1.61
ANKRD28-212ENST00000497037 KLC2Q9H0B6 622 aa5.02□□□□□ -1.61
ANKRD28-212ENST00000497037 CWH43Q9H720 699 aa5.02□□□□□ -1.61
ANKRD28-212ENST00000497037 ARHGEF4Q9NR80 690 aa5.02□□□□□ -1.61
ANKRD28-212ENST00000497037 DTLQ9NZJ0 730 aa5.02□□□□□ -1.61
ANKRD28-212ENST00000497037 RASAL2Q9UJF2 1139 aa5.02□□□□□ -1.61
ANKRD28-212ENST00000497037 PCDHB8Q9UN66 801 aa5.02□□□□□ -1.61
ANKRD28-212ENST00000497037 ZNF148Q9UQR1 794 aa5.02□□□□□ -1.61
ANKRD28-212ENST00000497037 EFR3BQ9Y2G0 817 aa5.02□□□□□ -1.61
ANKRD28-212ENST00000497037 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa5.02□□□□□ -1.61
ANKRD28-212ENST00000497037 M0QYT0 321 aa5.02□□□□□ -1.61
ANKRD28-212ENST00000497037 SGK1O00141 431 aa5.02□□□□□ -1.61
ANKRD28-212ENST00000497037 DCLK1O15075 740 aa5.02□□□□□ -1.61
ANKRD28-212ENST00000497037 PRPSAP2O60256 369 aa5.02□□□□□ -1.61
ANKRD28-212ENST00000497037 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP5.02□□□□□ -1.61
ANKRD28-212ENST00000497037 DGKIO75912 1065 aa5.02□□□□□ -1.61
ANKRD28-212ENST00000497037 METTL18O95568 372 aa5.02□□□□□ -1.61
ANKRD28-212ENST00000497037 EOMESO95936 686 aa5.02□□□□□ -1.61
ANKRD28-212ENST00000497037 FAM163BP0C2L3 166 aa5.02□□□□□ -1.61
ANKRD28-212ENST00000497037 RARGP13631 454 aa5.02□□□□□ -1.61
ANKRD28-212ENST00000497037 ITIH2P19823 946 aa5.02□□□□□ -1.61
ANKRD28-212ENST00000497037 GRIA1P42261 906 aa5.02□□□□□ -1.61
ANKRD28-212ENST00000497037 SLC5A3P53794 718 aa5.02□□□□□ -1.61
ANKRD28-212ENST00000497037 MTMR3Q13615 1198 aa5.02□□□□□ -1.61
ANKRD28-212ENST00000497037 KCNJ11Q14654 390 aa5.02□□□□□ -1.61
ANKRD28-212ENST00000497037 DDR2Q16832 855 aa5.02□□□□□ -1.61
ANKRD28-212ENST00000497037 LRRC26Q2I0M4 334 aa5.02□□□□□ -1.61
ANKRD28-212ENST00000497037 CCDC38Q502W7 563 aa5.02□□□□□ -1.61
ANKRD28-212ENST00000497037 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP5.02□□□□□ -1.61
ANKRD28-212ENST00000497037 STRADAQ7RTN6 431 aa5.02□□□□□ -1.61
ANKRD28-212ENST00000497037 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa5.02□□□□□ -1.61
ANKRD28-212ENST00000497037 SLC7A14Q8TBB6 771 aa5.02□□□□□ -1.61
ANKRD28-212ENST00000497037 CASP10Q92851 521 aa5.02□□□□□ -1.61
ANKRD28-212ENST00000497037 FAM149B1Q96BN6 582 aa5.02□□□□□ -1.61
ANKRD28-212ENST00000497037 PGBD4Q96DM1 585 aa5.02□□□□□ -1.61
ANKRD28-212ENST00000497037 SMARCD1Q96GM5 515 aa5.02□□□□□ -1.61
ANKRD28-212ENST00000497037 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa5.02□□□□□ -1.61
ANKRD28-212ENST00000497037 RNF208Q9H0X6 261 aa5.02□□□□□ -1.61
ANKRD28-212ENST00000497037 RABEP2Q9H5N1 569 aa5.02□□□□□ -1.61
ANKRD28-212ENST00000497037 PCDH9Q9HC56 1237 aa5.02□□□□□ -1.61
ANKRD28-212ENST00000497037 NDFIP2Q9NV92 336 aa5.02□□□□□ -1.61
ANKRD28-212ENST00000497037 TMEM161AQ9NX61 479 aa5.02□□□□□ -1.61
ANKRD28-212ENST00000497037 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa5.02□□□□□ -1.61
ANKRD28-212ENST00000497037 ANAPC5Q9UJX4 755 aa5.02□□□□□ -1.61
ANKRD28-212ENST00000497037 HEY1Q9Y5J3 304 aa5.02□□□□□ -1.61
ANKRD28-212ENST00000497037 ANKRD36A6QL64 1941 aa5.02□□□□□ -1.61
ANKRD28-212ENST00000497037 TRIM43BA6NCK2 446 aa5.02□□□□□ -1.61
ANKRD28-212ENST00000497037 SMIM23A6NLE4 172 aa5.02□□□□□ -1.61
ANKRD28-212ENST00000497037 OAZ2O95190 189 aa5.02□□□□□ -1.61
ANKRD28-212ENST00000497037 ZBED1O96006 694 aa5.02□□□□□ -1.61
ANKRD28-212ENST00000497037 LTFP02788 710 aa5.02□□□□□ -1.61
ANKRD28-212ENST00000497037 RBP3P10745 1247 aa5.02□□□□□ -1.61
ANKRD28-212ENST00000497037 NOS2P35228 1153 aa5.02□□□□□ -1.61
ANKRD28-212ENST00000497037 ACADSBP45954 432 aa5.02□□□□□ -1.61
ANKRD28-212ENST00000497037 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP5.02□□□□□ -1.61
ANKRD28-212ENST00000497037 DEFB103AP81534 67 aa5.02□□□□□ -1.61
ANKRD28-212ENST00000497037 GUCY1A3Q02108 690 aa5.02□□□□□ -1.61
ANKRD28-212ENST00000497037 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP5.02□□□□□ -1.61
ANKRD28-212ENST00000497037 AUHQ13825 339 aaKnown RBP5.02□□□□□ -1.61
ANKRD28-212ENST00000497037 HADHQ16836 314 aaKnown RBP5.02□□□□□ -1.61
ANKRD28-212ENST00000497037 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP5.02□□□□□ -1.61
ANKRD28-212ENST00000497037 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa5.02□□□□□ -1.61
ANKRD28-212ENST00000497037 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa5.02□□□□□ -1.61
ANKRD28-212ENST00000497037 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP5.02□□□□□ -1.61
ANKRD28-212ENST00000497037 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP5.02□□□□□ -1.61
ANKRD28-212ENST00000497037 CCDC110Q8TBZ0 833 aa5.02□□□□□ -1.61
ANKRD28-212ENST00000497037 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa5.02□□□□□ -1.61
ANKRD28-212ENST00000497037 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP5.02□□□□□ -1.61
ANKRD28-212ENST00000497037 RTP4Q96DX8 246 aa5.02□□□□□ -1.61
ANKRD28-212ENST00000497037 LGMNQ99538 433 aa5.02□□□□□ -1.61
ANKRD28-212ENST00000497037 ZNF670Q9BS34 389 aa5.02□□□□□ -1.61
ANKRD28-212ENST00000497037 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP5.02□□□□□ -1.61
ANKRD28-212ENST00000497037 POPDC2Q9HBU9 364 aa5.02□□□□□ -1.61
ANKRD28-212ENST00000497037 WBP1LQ9NX94 342 aa5.02□□□□□ -1.61
ANKRD28-212ENST00000497037 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa5.02□□□□□ -1.61
ANKRD28-212ENST00000497037 TBX21Q9UL17 535 aa5.02□□□□□ -1.61
ANKRD28-212ENST00000497037 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP5.02□□□□□ -1.61
ANKRD28-212ENST00000497037 NOTCH4Q99466 2003 aa5.01□□□□□ -1.61
ANKRD28-212ENST00000497037 GOLGA6CA6NDK9 693 aa5.01□□□□□ -1.61
ANKRD28-212ENST00000497037 PITPNM1O00562 1244 aa5.01□□□□□ -1.61
ANKRD28-212ENST00000497037 IFNB1P01574 187 aa5.01□□□□□ -1.61
ANKRD28-212ENST00000497037 LINC00271P0C7V0 271 aa5.01□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.4 ms