RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492723.1

TOM1-216, Transcript of target of myb1 membrane trafficking protein, humanhuman

TSL 2

Gene TOM1, Length 2,568 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOM1-216ENST00000492723 PALM2Q8IXS6 379 aa17.36■□□□□ 0.37
TOM1-216ENST00000492723 SLC2A13Q96QE2 648 aa17.36■□□□□ 0.37
TOM1-216ENST00000492723 SRRDQ9UH36 339 aa17.36■□□□□ 0.37
TOM1-216ENST00000492723 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa17.36■□□□□ 0.37
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TOM1-216ENST00000492723 E7ENQ6 273 aa17.35■□□□□ 0.37
TOM1-216ENST00000492723 USP17L7P0C7H9 530 aa17.35■□□□□ 0.37
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TOM1-216ENST00000492723 ELK3P41970 407 aa17.34■□□□□ 0.37
TOM1-216ENST00000492723 RAB41Q5JT25 222 aa17.34■□□□□ 0.37
TOM1-216ENST00000492723 CD300LGQ6UXG3 332 aa17.34■□□□□ 0.37
TOM1-216ENST00000492723 IGDCC3Q8IVU1 814 aa17.34■□□□□ 0.37
TOM1-216ENST00000492723 RAET1EQ8TD07 263 aa17.34■□□□□ 0.37
TOM1-216ENST00000492723 FBF1Q8TES7 1133 aa17.34■□□□□ 0.37
TOM1-216ENST00000492723 RNF139Q8WU17 664 aa17.34■□□□□ 0.37
TOM1-216ENST00000492723 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP17.34■□□□□ 0.37
TOM1-216ENST00000492723 ACBD6Q9BR61 282 aa17.34■□□□□ 0.37
TOM1-216ENST00000492723 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP17.34■□□□□ 0.37
TOM1-216ENST00000492723 ACTL7BQ9Y614 415 aa17.34■□□□□ 0.37
TOM1-216ENST00000492723 TRPA1O75762 1119 aa17.33■□□□□ 0.36
TOM1-216ENST00000492723 PIAS1O75925 651 aa17.33■□□□□ 0.36
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TOM1-216ENST00000492723 CCDC134Q9H6E4 229 aa17.33■□□□□ 0.36
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TOM1-216ENST00000492723 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP17.33■□□□□ 0.36
TOM1-216ENST00000492723 C5orf60A6NFR6 353 aa17.33■□□□□ 0.36
TOM1-216ENST00000492723 HHLA1C9JL84 531 aa17.33■□□□□ 0.36
TOM1-216ENST00000492723 F8W810 466 aa17.33■□□□□ 0.36
TOM1-216ENST00000492723 H3BRJ5 948 aa17.33■□□□□ 0.36
TOM1-216ENST00000492723 ITGB1P05556 798 aa17.33■□□□□ 0.36
TOM1-216ENST00000492723 VIMP08670 466 aaKnown RBP17.33■□□□□ 0.36
TOM1-216ENST00000492723 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP17.33■□□□□ 0.36
TOM1-216ENST00000492723 BDNFP23560 247 aa17.33■□□□□ 0.36
TOM1-216ENST00000492723 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP17.33■□□□□ 0.36
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