RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489741.1

PRPF40A-210, Transcript of pre-mRNA processing factor 40 homolog A, humanhuman

TSL 3

Gene PRPF40A, Length 776 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40A-210ENST00000489741 ITFG1Q8TB96 612 aa6.97□□□□□ -1.29
PRPF40A-210ENST00000489741 HASPINQ8TF76 798 aa6.97□□□□□ -1.29
PRPF40A-210ENST00000489741 ALG3Q92685 438 aa6.97□□□□□ -1.29
PRPF40A-210ENST00000489741 KIFAP3Q92845 792 aa6.97□□□□□ -1.29
PRPF40A-210ENST00000489741 FGF13Q92913 245 aa6.97□□□□□ -1.29
PRPF40A-210ENST00000489741 PEX11GQ96HA9 241 aa6.97□□□□□ -1.29
PRPF40A-210ENST00000489741 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
PRPF40A-210ENST00000489741 POLD4Q9HCU8 107 aa6.97□□□□□ -1.29
PRPF40A-210ENST00000489741 ST7Q9NRC1 585 aa6.97□□□□□ -1.29
PRPF40A-210ENST00000489741 IGSF5Q9NSI5 407 aa6.97□□□□□ -1.29
PRPF40A-210ENST00000489741 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP6.97□□□□□ -1.29
PRPF40A-210ENST00000489741 MARCH2Q9P0N8 246 aa6.97□□□□□ -1.29
PRPF40A-210ENST00000489741 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
PRPF40A-210ENST00000489741 MTRRQ9UBK8 725 aa6.97□□□□□ -1.29
PRPF40A-210ENST00000489741 CA14Q9ULX7 337 aa6.97□□□□□ -1.29
PRPF40A-210ENST00000489741 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa6.97□□□□□ -1.29
PRPF40A-210ENST00000489741 TNFSF13BQ9Y275 285 aa6.97□□□□□ -1.29
PRPF40A-210ENST00000489741 SIT1Q9Y3P8 196 aa6.97□□□□□ -1.29
PRPF40A-210ENST00000489741 CEP250Q9BV73 2442 aa6.97□□□□□ -1.29
PRPF40A-210ENST00000489741 NCOR2Q9Y618 2525 aa6.96□□□□□ -1.29
PRPF40A-210ENST00000489741 DOCK8Q8NF50 2099 aa6.96□□□□□ -1.29
PRPF40A-210ENST00000489741 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa6.96□□□□□ -1.3
PRPF40A-210ENST00000489741 ARHGEF37A1IGU5 675 aa6.96□□□□□ -1.3
PRPF40A-210ENST00000489741 ARHGEF35A5YM69 484 aa6.96□□□□□ -1.3
PRPF40A-210ENST00000489741 SHISA7A6NL88 538 aa6.96□□□□□ -1.3
PRPF40A-210ENST00000489741 CCL16O15467 120 aa6.96□□□□□ -1.3
PRPF40A-210ENST00000489741 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
PRPF40A-210ENST00000489741 B3GAT3O94766 335 aa6.96□□□□□ -1.3
PRPF40A-210ENST00000489741 ABLIM3O94929 683 aa6.96□□□□□ -1.3
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PRPF40A-210ENST00000489741 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP6.96□□□□□ -1.34e-6■■■■□ 24.5
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PRPF40A-210ENST00000489741 PPP2R5AQ15172 486 aa6.96□□□□□ -1.3
PRPF40A-210ENST00000489741 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP6.96□□□□□ -1.3
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PRPF40A-210ENST00000489741 SLC44A4Q53GD3 710 aa6.96□□□□□ -1.3
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PRPF40A-210ENST00000489741 FAM129CQ86XR2 697 aa6.96□□□□□ -1.3
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PRPF40A-210ENST00000489741 C1orf210Q8IVY1 113 aa6.96□□□□□ -1.3
PRPF40A-210ENST00000489741 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
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PRPF40A-210ENST00000489741 C1orf186Q6ZWK4 172 aa6.95□□□□□ -1.3
PRPF40A-210ENST00000489741 MTSS1LQ765P7 747 aa6.95□□□□□ -1.3
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PRPF40A-210ENST00000489741 ZNF461Q8TAF7 563 aa6.95□□□□□ -1.3
PRPF40A-210ENST00000489741 SLC7A14Q8TBB6 771 aa6.95□□□□□ -1.3
PRPF40A-210ENST00000489741 NELL1Q92832 810 aa6.95□□□□□ -1.3
PRPF40A-210ENST00000489741 CLDN23Q96B33 292 aa6.95□□□□□ -1.3
PRPF40A-210ENST00000489741 C8orf76Q96K31 380 aa6.95□□□□□ -1.3
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PRPF40A-210ENST00000489741 PWWP2AQ96N64 755 aa6.95□□□□□ -1.3
PRPF40A-210ENST00000489741 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
PRPF40A-210ENST00000489741 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa6.95□□□□□ -1.3
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