RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489450.1

RABGGTB-211, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 586 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-211ENST00000489450 ABHD5Q8WTS1 349 aa3.82□□□□□ -1.8
RABGGTB-211ENST00000489450 CTHRC1Q96CG8 243 aa3.82□□□□□ -1.8
RABGGTB-211ENST00000489450 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP3.82□□□□□ -1.8
RABGGTB-211ENST00000489450 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa3.82□□□□□ -1.8
RABGGTB-211ENST00000489450 EPS8L2Q9H6S3 715 aa3.82□□□□□ -1.8
RABGGTB-211ENST00000489450 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP3.82□□□□□ -1.8
RABGGTB-211ENST00000489450 IL17RBQ9NRM6 502 aa3.82□□□□□ -1.8
RABGGTB-211ENST00000489450 STEAP1Q9UHE8 339 aa3.82□□□□□ -1.8
RABGGTB-211ENST00000489450 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP3.82□□□□□ -1.8
RABGGTB-211ENST00000489450 DTNAQ9Y4J8 743 aa3.82□□□□□ -1.8
RABGGTB-211ENST00000489450 DMRT1Q9Y5R6 373 aa3.82□□□□□ -1.8
RABGGTB-211ENST00000489450 QSOX1O00391 747 aa3.81□□□□□ -1.8
RABGGTB-211ENST00000489450 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP3.81□□□□□ -1.8
RABGGTB-211ENST00000489450 TRIM38O00635 465 aa3.81□□□□□ -1.8
RABGGTB-211ENST00000489450 CES2O00748 559 aa3.81□□□□□ -1.8
RABGGTB-211ENST00000489450 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP3.81□□□□□ -1.8
RABGGTB-211ENST00000489450 SUV39H1O43463 412 aa3.81□□□□□ -1.8
RABGGTB-211ENST00000489450 RHOBTB3O94955 611 aa3.81□□□□□ -1.8
RABGGTB-211ENST00000489450 TJP3O95049 919 aa3.81□□□□□ -1.8
RABGGTB-211ENST00000489450 VIPP01282 170 aa3.81□□□□□ -1.8
RABGGTB-211ENST00000489450 CSTBP04080 98 aaKnown RBP3.81□□□□□ -1.8
RABGGTB-211ENST00000489450 PRKCBP05771 671 aa3.81□□□□□ -1.8
RABGGTB-211ENST00000489450 DLDP09622 509 aaKnown RBP3.81□□□□□ -1.8
RABGGTB-211ENST00000489450 NPSP0C0P6 89 aa3.81□□□□□ -1.8
RABGGTB-211ENST00000489450 CD19P15391 556 aa3.81□□□□□ -1.8
RABGGTB-211ENST00000489450 NPPBP16860 134 aa3.81□□□□□ -1.8
RABGGTB-211ENST00000489450 DRD4P21917 467 aa3.81□□□□□ -1.8
RABGGTB-211ENST00000489450 FPR3P25089 353 aa3.81□□□□□ -1.8
RABGGTB-211ENST00000489450 MCM5P33992 734 aa3.81□□□□□ -1.8
RABGGTB-211ENST00000489450 PBX1P40424 430 aa3.81□□□□□ -1.8
RABGGTB-211ENST00000489450 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP3.81□□□□□ -1.8
RABGGTB-211ENST00000489450 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP3.81□□□□□ -1.8
RABGGTB-211ENST00000489450 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP3.81□□□□□ -1.8
RABGGTB-211ENST00000489450 PSG6Q00889 435 aa3.81□□□□□ -1.8
RABGGTB-211ENST00000489450 MTAPQ13126 283 aa3.81□□□□□ -1.8
RABGGTB-211ENST00000489450 CLCA4Q14CN2 919 aa3.81□□□□□ -1.8
RABGGTB-211ENST00000489450 PCID2Q5JVF3 399 aa3.81□□□□□ -1.8
RABGGTB-211ENST00000489450 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP3.81□□□□□ -1.8
RABGGTB-211ENST00000489450 ANKRD16Q6P6B7 361 aa3.81□□□□□ -1.8
RABGGTB-211ENST00000489450 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa3.81□□□□□ -1.8
RABGGTB-211ENST00000489450 RASGRP3Q8IV61 690 aa3.81□□□□□ -1.8
RABGGTB-211ENST00000489450 SIRT6Q8N6T7 355 aa3.81□□□□□ -1.8
RABGGTB-211ENST00000489450 FAM71BQ8TC56 605 aa3.81□□□□□ -1.8
RABGGTB-211ENST00000489450 WDR24Q96S15 920 aa3.81□□□□□ -1.8
RABGGTB-211ENST00000489450 RMDN3Q96TC7 470 aa3.81□□□□□ -1.8
RABGGTB-211ENST00000489450 AGAP2Q99490 1192 aa3.81□□□□□ -1.8
RABGGTB-211ENST00000489450 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP3.81□□□□□ -1.8
RABGGTB-211ENST00000489450 FSD1LQ9BXM9 530 aa3.81□□□□□ -1.8
RABGGTB-211ENST00000489450 IKZF4Q9H2S9 585 aa3.81□□□□□ -1.8
RABGGTB-211ENST00000489450 PPCSQ9HAB8 311 aa3.81□□□□□ -1.8
RABGGTB-211ENST00000489450 TMEM8AQ9HCN3 771 aa3.81□□□□□ -1.8
RABGGTB-211ENST00000489450 TRIM36Q9NQ86 728 aa3.81□□□□□ -1.8
RABGGTB-211ENST00000489450 LRFN1Q9P244 771 aa3.81□□□□□ -1.8
RABGGTB-211ENST00000489450 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP3.81□□□□□ -1.8
RABGGTB-211ENST00000489450 ASAP1Q9ULH1 1129 aa3.81□□□□□ -1.8
RABGGTB-211ENST00000489450 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa3.81□□□□□ -1.8
RABGGTB-211ENST00000489450 LRRC7Q96NW7 1537 aa3.8□□□□□ -1.8
RABGGTB-211ENST00000489450 SYCP2Q9BX26 1530 aa3.8□□□□□ -1.8
RABGGTB-211ENST00000489450 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa3.8□□□□□ -1.8
RABGGTB-211ENST00000489450 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa3.8□□□□□ -1.8
RABGGTB-211ENST00000489450 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa3.8□□□□□ -1.8
RABGGTB-211ENST00000489450 KAT6AQ92794 2004 aa3.8□□□□□ -1.8
RABGGTB-211ENST00000489450 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP3.8□□□□□ -1.8
RABGGTB-211ENST00000489450 J3KTA2 159 aa3.8□□□□□ -1.8
RABGGTB-211ENST00000489450 SYT5O00445 386 aa3.8□□□□□ -1.8
RABGGTB-211ENST00000489450 ACKR2O00590 384 aa3.8□□□□□ -1.8
RABGGTB-211ENST00000489450 CA12O43570 354 aa3.8□□□□□ -1.8
RABGGTB-211ENST00000489450 CBFA2T3O75081 653 aa3.8□□□□□ -1.8
RABGGTB-211ENST00000489450 FAM163BP0C2L3 166 aa3.8□□□□□ -1.8
RABGGTB-211ENST00000489450 TMEM225BP0DP42 221 aa3.8□□□□□ -1.8
RABGGTB-211ENST00000489450 CREB1P16220 341 aa3.8□□□□□ -1.8
RABGGTB-211ENST00000489450 DRD1P21728 446 aa3.8□□□□□ -1.8
RABGGTB-211ENST00000489450 KLRK1P26718 216 aa3.8□□□□□ -1.8
RABGGTB-211ENST00000489450 PTH2RP49190 550 aa3.8□□□□□ -1.8
RABGGTB-211ENST00000489450 CACNA2D1P54289 1103 aa3.8□□□□□ -1.8
RABGGTB-211ENST00000489450 COL10A1Q03692 680 aa3.8□□□□□ -1.8
RABGGTB-211ENST00000489450 DEUP1Q05D60 604 aa3.8□□□□□ -1.8
RABGGTB-211ENST00000489450 PTK2BQ14289 1009 aa3.8□□□□□ -1.8
RABGGTB-211ENST00000489450 ACOX1Q15067 660 aa3.8□□□□□ -1.8
RABGGTB-211ENST00000489450 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa3.8□□□□□ -1.8
RABGGTB-211ENST00000489450 FAM153CQ494X1 144 aa3.8□□□□□ -1.8
RABGGTB-211ENST00000489450 PRR16Q569H4 304 aa3.8□□□□□ -1.8
RABGGTB-211ENST00000489450 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
RABGGTB-211ENST00000489450 ANO1Q5XXA6 986 aa3.8□□□□□ -1.8
RABGGTB-211ENST00000489450 GRHL2Q6ISB3 625 aa3.8□□□□□ -1.8
RABGGTB-211ENST00000489450 NAPRTQ6XQN6 538 aa3.8□□□□□ -1.8
RABGGTB-211ENST00000489450 PTCHD4Q6ZW05 846 aa3.8□□□□□ -1.8
RABGGTB-211ENST00000489450 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP3.8□□□□□ -1.8
RABGGTB-211ENST00000489450 P3H2Q8IVL5 708 aa3.8□□□□□ -1.8
RABGGTB-211ENST00000489450 MYCT1Q8N699 235 aa3.8□□□□□ -1.8
RABGGTB-211ENST00000489450 SIMC1Q8NDZ2 872 aa3.8□□□□□ -1.8
RABGGTB-211ENST00000489450 ABHD11Q8NFV4 315 aa3.8□□□□□ -1.8
RABGGTB-211ENST00000489450 CAGE1Q8TC20 777 aa3.8□□□□□ -1.8
RABGGTB-211ENST00000489450 CHFRQ96EP1 664 aa3.8□□□□□ -1.8
RABGGTB-211ENST00000489450 MACROD1Q9BQ69 325 aa3.8□□□□□ -1.8
RABGGTB-211ENST00000489450 DUSP26Q9BV47 211 aa3.8□□□□□ -1.8
RABGGTB-211ENST00000489450 KLK15Q9H2R5 256 aa3.8□□□□□ -1.8
RABGGTB-211ENST00000489450 SYNPO2LQ9H987 977 aa3.8□□□□□ -1.8
RABGGTB-211ENST00000489450 FSCN3Q9NQT6 498 aa3.8□□□□□ -1.8
RABGGTB-211ENST00000489450 ASB6Q9NWX5 421 aa3.8□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.7 ms