RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489424.5

HDAC10-216, Transcript of histone deacetylase 10, human

TSL 5

Gene HDAC10, Length 759 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF132	P52740	706 aa		18.11	■□□□□ 0.49
HDAC10-216	ENST00000489424	YWHAG	P61981	247 aa	Known RBP eCLIP	18.11	■□□□□ 0.49
HDAC10-216	ENST00000489424	PDE4C	Q08493	712 aa		18.11	■□□□□ 0.49
HDAC10-216	ENST00000489424	SPDYC	Q5MJ68	293 aa		18.11	■□□□□ 0.49
HDAC10-216	ENST00000489424	CDKAL1	Q5VV42	579 aa		18.11	■□□□□ 0.49
HDAC10-216	ENST00000489424	CPXM2	Q8N436	756 aa		18.11	■□□□□ 0.49
HDAC10-216	ENST00000489424	TERB1	Q8NA31	727 aa		18.11	■□□□□ 0.49
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC35F5	Q8WV83	523 aa		18.11	■□□□□ 0.49
HDAC10-216	ENST00000489424	IRGQ	Q8WZA9	623 aa		18.11	■□□□□ 0.49
HDAC10-216	ENST00000489424	RMDN1	Q96DB5	314 aa		18.11	■□□□□ 0.49
HDAC10-216	ENST00000489424	RTKN	Q9BST9	563 aa		18.11	■□□□□ 0.49
HDAC10-216	ENST00000489424	INTS2	Q9H0H0	1204 aa	Known RBP	18.11	■□□□□ 0.49
HDAC10-216	ENST00000489424	LRRC4	Q9HBW1	653 aa		18.11	■□□□□ 0.49
HDAC10-216	ENST00000489424	ABCC13	Q9NSE7	274 aa		18.11	■□□□□ 0.49
HDAC10-216	ENST00000489424	SEMA4G	Q9NTN9	838 aa		18.11	■□□□□ 0.49
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC27A6	Q9Y2P4	619 aa		18.11	■□□□□ 0.49
HDAC10-216	ENST00000489424	HBS1L	Q9Y450	684 aa	Known RBP	18.11	■□□□□ 0.49
HDAC10-216	ENST00000489424	DMXL1	Q9Y485	3027 aa		18.1	■□□□□ 0.49
HDAC10-216	ENST00000489424	TBC1D3B	A6NDS4	549 aa		18.1	■□□□□ 0.49
HDAC10-216	ENST00000489424	GOLGA6L19	H0YKK7	550 aa		18.1	■□□□□ 0.49
HDAC10-216	ENST00000489424	GFRA2	O00451	464 aa		18.1	■□□□□ 0.49
HDAC10-216	ENST00000489424	LATS1	O95835	1130 aa		18.1	■□□□□ 0.49
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF806	P0C7X5	589 aa		18.1	■□□□□ 0.49
HDAC10-216	ENST00000489424	MFAP3	P55082	362 aa		18.1	■□□□□ 0.49
HDAC10-216	ENST00000489424	ELF2	Q15723	593 aa		18.1	■□□□□ 0.49
HDAC10-216	ENST00000489424	LPAL2	Q16609	132 aa		18.1	■□□□□ 0.49
HDAC10-216	ENST00000489424	ANO4	Q32M45	955 aa		18.1	■□□□□ 0.49
HDAC10-216	ENST00000489424	C2orf27A	Q580R0	203 aa		18.1	■□□□□ 0.49
HDAC10-216	ENST00000489424	TMEM270	Q6UE05	265 aa		18.1	■□□□□ 0.49
HDAC10-216	ENST00000489424	C12orf40	Q86WS4	652 aa		18.1	■□□□□ 0.49
HDAC10-216	ENST00000489424	OLIG1	Q8TAK6	271 aa		18.1	■□□□□ 0.49
HDAC10-216	ENST00000489424	NETO1	Q8TDF5	533 aa		18.1	■□□□□ 0.49
HDAC10-216	ENST00000489424	PLD4	Q96BZ4	506 aa		18.1	■□□□□ 0.49
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC2A11	Q9BYW1	496 aa		18.1	■□□□□ 0.49
HDAC10-216	ENST00000489424	MARCH2	Q9P0N8	246 aa		18.1	■□□□□ 0.49
HDAC10-216	ENST00000489424	DCHS1	Q96JQ0	3298 aa		18.1	■□□□□ 0.49
HDAC10-216	ENST00000489424	CACNA1A	O00555	2505 aa		18.1	■□□□□ 0.49
HDAC10-216	ENST00000489424	KIAA1549L	Q6ZVL6	1849 aa		18.09	■□□□□ 0.49
HDAC10-216	ENST00000489424	PENK	P01210	267 aa	Predicted RBP	18.09	■□□□□ 0.49
HDAC10-216	ENST00000489424	TYR	P14679	529 aa		18.09	■□□□□ 0.49
HDAC10-216	ENST00000489424	HNRNPL	P14866	589 aa	Known RBP eCLIP	18.09	■□□□□ 0.49
HDAC10-216	ENST00000489424	CD19	P15391	556 aa		18.09	■□□□□ 0.49
HDAC10-216	ENST00000489424	HOXC13	P31276	330 aa		18.09	■□□□□ 0.49
HDAC10-216	ENST00000489424	LIMK1	P53667	647 aa		18.09	■□□□□ 0.49
HDAC10-216	ENST00000489424	TRIP4	Q15650	581 aa	Predicted RBP	18.09	■□□□□ 0.49
HDAC10-216	ENST00000489424	GOLGA7B	Q2TAP0	167 aa		18.09	■□□□□ 0.49
HDAC10-216	ENST00000489424	PLK5	Q496M5	336 aa		18.09	■□□□□ 0.49
HDAC10-216	ENST00000489424	FILIP1L	Q4L180	1135 aa		18.09	■□□□□ 0.49
HDAC10-216	ENST00000489424	GRAMD4	Q6IC98	578 aa		18.09	■□□□□ 0.49
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM217A	Q8IXS0	508 aa		18.09	■□□□□ 0.49
HDAC10-216	ENST00000489424	STK32A	Q8WU08	396 aa		18.09	■□□□□ 0.49
HDAC10-216	ENST00000489424	WBP2	Q969T9	261 aa		18.09	■□□□□ 0.49
HDAC10-216	ENST00000489424	CRACR2A	Q9BSW2	395 aa		18.09	■□□□□ 0.49
HDAC10-216	ENST00000489424	BBS2	Q9BXC9	721 aa		18.09	■□□□□ 0.49
HDAC10-216	ENST00000489424	UBE2T	Q9NPD8	197 aa	Predicted RBP	18.09	■□□□□ 0.49
HDAC10-216	ENST00000489424	STOML2	Q9UJZ1	356 aa		18.09	■□□□□ 0.49
HDAC10-216	ENST00000489424	USP18	Q9UMW8	372 aa		18.09	■□□□□ 0.49
HDAC10-216	ENST00000489424	WDR3	Q9UNX4	943 aa	Known RBP eCLIP	18.09	■□□□□ 0.49
HDAC10-216	ENST00000489424	SART1	O43290	800 aa	Known RBP	18.08	■□□□□ 0.48
HDAC10-216	ENST00000489424	FBXO21	O94952	628 aa		18.08	■□□□□ 0.48
HDAC10-216	ENST00000489424	IRF1	P10914	325 aa		18.08	■□□□□ 0.48
HDAC10-216	ENST00000489424	DPP6	P42658	865 aa		18.08	■□□□□ 0.48
HDAC10-216	ENST00000489424	RPL34	P49207	117 aa	Known RBP	18.08	■□□□□ 0.48
HDAC10-216	ENST00000489424	SPEM2	Q0P670	501 aa		18.08	■□□□□ 0.48
HDAC10-216	ENST00000489424	KRT31	Q15323	416 aa		18.08	■□□□□ 0.48
HDAC10-216	ENST00000489424	RSPO4	Q2I0M5	234 aa	Predicted RBP	18.08	■□□□□ 0.48
HDAC10-216	ENST00000489424	PLA2G2C	Q5R387	149 aa		18.08	■□□□□ 0.48
HDAC10-216	ENST00000489424	RSRC2	Q7L4I2	434 aa	Known RBP	18.08	■□□□□ 0.48
HDAC10-216	ENST00000489424	BEND5	Q7L4P6	421 aa		18.08	■□□□□ 0.48
HDAC10-216	ENST00000489424	SIX6OS1	Q8N1H7	587 aa		18.08	■□□□□ 0.48
HDAC10-216	ENST00000489424	TXNDC5	Q8NBS9	432 aa	Known RBP	18.08	■□□□□ 0.48
HDAC10-216	ENST00000489424	HHIP	Q96QV1	700 aa		18.08	■□□□□ 0.48
HDAC10-216	ENST00000489424	FUCA2	Q9BTY2	467 aa		18.08	■□□□□ 0.48
HDAC10-216	ENST00000489424	ULBP1	Q9BZM6	244 aa		18.08	■□□□□ 0.48
HDAC10-216	ENST00000489424	DUSP15	Q9H1R2	295 aa	Predicted RBP	18.08	■□□□□ 0.48
HDAC10-216	ENST00000489424	VPS16	Q9H269	839 aa		18.08	■□□□□ 0.48
HDAC10-216	ENST00000489424	PARD6A	Q9NPB6	346 aa		18.08	■□□□□ 0.48
HDAC10-216	ENST00000489424	TAB2	Q9NYJ8	693 aa		18.08	■□□□□ 0.48
HDAC10-216	ENST00000489424	LIMA1	Q9UHB6	759 aa	Known RBP	18.08	■□□□□ 0.48
HDAC10-216	ENST00000489424	PCDHB4	Q9Y5E5	795 aa		18.08	■□□□□ 0.48
HDAC10-216	ENST00000489424	KLF8	O95600	359 aa	Predicted RBP	18.07	■□□□□ 0.48
HDAC10-216	ENST00000489424	KLKB1	P03952	638 aa		18.07	■□□□□ 0.48
HDAC10-216	ENST00000489424	CISD3	P0C7P0	127 aa		18.07	■□□□□ 0.48
HDAC10-216	ENST00000489424	NTSR1	P30989	418 aa		18.07	■□□□□ 0.48
HDAC10-216	ENST00000489424	PXN	P49023	591 aa	Predicted RBP	18.07	■□□□□ 0.48
HDAC10-216	ENST00000489424	SRSF5	Q13243	272 aa	Known RBP	18.07	■□□□□ 0.48
HDAC10-216	ENST00000489424	SDE2	Q6IQ49	451 aa		18.07	■□□□□ 0.48
HDAC10-216	ENST00000489424	MSANTD2	Q6P1R3	559 aa		18.07	■□□□□ 0.48
HDAC10-216	ENST00000489424	TRIM65	Q6PJ69	517 aa		18.07	■□□□□ 0.48
HDAC10-216	ENST00000489424	PRR23C	Q6ZRP0	262 aa		18.07	■□□□□ 0.48
HDAC10-216	ENST00000489424	RRAGA	Q7L523	313 aa		18.07	■□□□□ 0.48
HDAC10-216	ENST00000489424	BHLHA9	Q7RTU4	235 aa		18.07	■□□□□ 0.48
HDAC10-216	ENST00000489424	DGLUCY	Q7Z3D6	616 aa		18.07	■□□□□ 0.48
HDAC10-216	ENST00000489424	KBTBD6	Q86V97	674 aa		18.07	■□□□□ 0.48
HDAC10-216	ENST00000489424	ALLC	Q8N6M5	410 aa		18.07	■□□□□ 0.48
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF513	Q8N8E2	541 aa	Predicted RBP	18.07	■□□□□ 0.48
HDAC10-216	ENST00000489424	RNF139	Q8WU17	664 aa		18.07	■□□□□ 0.48
HDAC10-216	ENST00000489424	DDX1	Q92499	740 aa	Known RBP	18.07	■□□□□ 0.48
HDAC10-216	ENST00000489424	AZIN2	Q96A70	460 aa		18.07	■□□□□ 0.48
HDAC10-216	ENST00000489424	TRIM62	Q9BVG3	475 aa		18.07	■□□□□ 0.48

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