RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487558.1

CUL3-211, Transcript of cullin 3, humanhuman

TSL 2

Gene CUL3, Length 1,093 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3-211ENST00000487558 TREML2Q5T2D2 321 aa6.52□□□□□ -1.37
CUL3-211ENST00000487558 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa6.52□□□□□ -1.37
CUL3-211ENST00000487558 VWA1Q6PCB0 445 aa6.52□□□□□ -1.37
CUL3-211ENST00000487558 CLEC4GQ6UXB4 293 aa6.52□□□□□ -1.37
CUL3-211ENST00000487558 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa6.52□□□□□ -1.37
CUL3-211ENST00000487558 MAVSQ7Z434 540 aa6.52□□□□□ -1.37
CUL3-211ENST00000487558 GPR149Q86SP6 731 aa6.52□□□□□ -1.37
CUL3-211ENST00000487558 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa6.52□□□□□ -1.37
CUL3-211ENST00000487558 XAGE5Q8WWM1 108 aa6.52□□□□□ -1.37
CUL3-211ENST00000487558 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
CUL3-211ENST00000487558 KLC4Q9NSK0 619 aa6.52□□□□□ -1.37
CUL3-211ENST00000487558 FBXO28Q9NVF7 368 aa6.52□□□□□ -1.37
CUL3-211ENST00000487558 BAG5Q9UL15 447 aa6.52□□□□□ -1.37
CUL3-211ENST00000487558 FZD1Q9UP38 647 aa6.52□□□□□ -1.37
CUL3-211ENST00000487558 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
CUL3-211ENST00000487558 CTIFO43310 598 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
CUL3-211ENST00000487558 NXPH3O95157 252 aa6.51□□□□□ -1.37
CUL3-211ENST00000487558 PEX11BO96011 259 aa6.51□□□□□ -1.37
CUL3-211ENST00000487558 ERBB2P04626 1255 aa6.51□□□□□ -1.37
CUL3-211ENST00000487558 MMP8P22894 467 aa6.51□□□□□ -1.37
CUL3-211ENST00000487558 KRT9P35527 623 aa6.51□□□□□ -1.37
CUL3-211ENST00000487558 DGCR2P98153 550 aa6.51□□□□□ -1.37
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CUL3-211ENST00000487558 TP53BP2Q13625 1128 aa6.51□□□□□ -1.37
CUL3-211ENST00000487558 KCNJ12Q14500 433 aa6.51□□□□□ -1.37
CUL3-211ENST00000487558 DLGAP5Q15398 846 aa6.51□□□□□ -1.37
CUL3-211ENST00000487558 GALNTL6Q49A17 601 aa6.51□□□□□ -1.37
CUL3-211ENST00000487558 FAAH2Q6GMR7 532 aa6.51□□□□□ -1.37
CUL3-211ENST00000487558 SYT13Q7L8C5 426 aa6.51□□□□□ -1.37
CUL3-211ENST00000487558 PCGF5Q86SE9 256 aa6.51□□□□□ -1.37
CUL3-211ENST00000487558 ARHGEF19Q8IW93 802 aa6.51□□□□□ -1.37
CUL3-211ENST00000487558 LRRC71Q8N4P6 559 aa6.51□□□□□ -1.37
CUL3-211ENST00000487558 AMER2Q8N7J2 671 aa6.51□□□□□ -1.37
CUL3-211ENST00000487558 USP38Q8NB14 1042 aa6.51□□□□□ -1.37
CUL3-211ENST00000487558 IL17DQ8TAD2 202 aa6.51□□□□□ -1.37
CUL3-211ENST00000487558 SLC22A17Q8WUG5 538 aa6.51□□□□□ -1.37
CUL3-211ENST00000487558 R3HDM4Q96D70 268 aa6.51□□□□□ -1.37
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CUL3-211ENST00000487558 EHD3Q9NZN3 535 aa6.51□□□□□ -1.37
CUL3-211ENST00000487558 PI4KBQ9UBF8 816 aa6.51□□□□□ -1.37
CUL3-211ENST00000487558 A6NLC8 198 aa6.5□□□□□ -1.37
CUL3-211ENST00000487558 TISP43B9A030 160 aa6.5□□□□□ -1.37
CUL3-211ENST00000487558 SEPT4O43236 478 aa6.5□□□□□ -1.37
CUL3-211ENST00000487558 PMPCBO75439 489 aa6.5□□□□□ -1.37
CUL3-211ENST00000487558 RHOBTB3O94955 611 aa6.5□□□□□ -1.37
CUL3-211ENST00000487558 MBD4O95243 580 aa6.5□□□□□ -1.37
CUL3-211ENST00000487558 FESP07332 822 aa6.5□□□□□ -1.37
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CUL3-211ENST00000487558 NR4A1P22736 598 aa6.5□□□□□ -1.37
CUL3-211ENST00000487558 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CUL3-211ENST00000487558 GKP32189 559 aa6.5□□□□□ -1.37
CUL3-211ENST00000487558 MAN1A1P33908 653 aa6.5□□□□□ -1.37
CUL3-211ENST00000487558 SEC24CP53992 1094 aa6.5□□□□□ -1.37
CUL3-211ENST00000487558 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CUL3-211ENST00000487558 MPP1Q00013 466 aa6.5□□□□□ -1.37
CUL3-211ENST00000487558 SLC25A3Q00325 362 aa6.5□□□□□ -1.37
CUL3-211ENST00000487558 BFSP2Q13515 415 aa6.5□□□□□ -1.37
CUL3-211ENST00000487558 BMPR2Q13873 1038 aa6.5□□□□□ -1.37
CUL3-211ENST00000487558 PTPRRQ15256 657 aa6.5□□□□□ -1.37
CUL3-211ENST00000487558 CTXN3Q4LDR2 81 aa6.5□□□□□ -1.37
CUL3-211ENST00000487558 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa6.5□□□□□ -1.37
CUL3-211ENST00000487558 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa6.5□□□□□ -1.37
CUL3-211ENST00000487558 P3H2Q8IVL5 708 aa6.5□□□□□ -1.37
CUL3-211ENST00000487558 HVCN1Q96D96 273 aa6.5□□□□□ -1.37
CUL3-211ENST00000487558 CHFRQ96EP1 664 aa6.5□□□□□ -1.37
CUL3-211ENST00000487558 TWNKQ96RR1 684 aa6.5□□□□□ -1.37
CUL3-211ENST00000487558 JMJD4Q9H9V9 463 aa6.5□□□□□ -1.37
CUL3-211ENST00000487558 TMEM160Q9NX00 188 aa6.5□□□□□ -1.37
CUL3-211ENST00000487558 KCND3Q9UK17 655 aa6.5□□□□□ -1.37
CUL3-211ENST00000487558 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
CUL3-211ENST00000487558 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
CUL3-211ENST00000487558 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa6.5□□□□□ -1.37
CUL3-211ENST00000487558 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
CUL3-211ENST00000487558 ADGRA2Q96PE1 1338 aa6.5□□□□□ -1.37
CUL3-211ENST00000487558 GXYLT2A0PJZ3 443 aa6.49□□□□□ -1.37
CUL3-211ENST00000487558 YY2O15391 372 aa6.49□□□□□ -1.37
CUL3-211ENST00000487558 PEX1O43933 1283 aa6.49□□□□□ -1.37
CUL3-211ENST00000487558 RHOP08100 348 aa6.49□□□□□ -1.37
CUL3-211ENST00000487558 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
CUL3-211ENST00000487558 CNPP09543 421 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
CUL3-211ENST00000487558 ITGAMP11215 1152 aa6.49□□□□□ -1.37
CUL3-211ENST00000487558 CREB1P16220 341 aa6.49□□□□□ -1.37
CUL3-211ENST00000487558 PTGS2P35354 604 aa6.49□□□□□ -1.37
CUL3-211ENST00000487558 CLCN2P51788 898 aa6.49□□□□□ -1.37
CUL3-211ENST00000487558 PDE1AP54750 535 aa6.49□□□□□ -1.37
CUL3-211ENST00000487558 DPTQ07507 201 aa6.49□□□□□ -1.37
CUL3-211ENST00000487558 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
CUL3-211ENST00000487558 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
CUL3-211ENST00000487558 HYIQ5T013 277 aa6.49□□□□□ -1.37
CUL3-211ENST00000487558 FAM90A2PQ658T7 463 aa6.49□□□□□ -1.37
CUL3-211ENST00000487558 BBS12Q6ZW61 710 aa6.49□□□□□ -1.37
CUL3-211ENST00000487558 SIRT6Q8N6T7 355 aa6.49□□□□□ -1.37
CUL3-211ENST00000487558 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa6.49□□□□□ -1.37
CUL3-211ENST00000487558 HTRA1Q92743 480 aa6.49□□□□□ -1.37
CUL3-211ENST00000487558 HAS1Q92839 578 aa6.49□□□□□ -1.37
CUL3-211ENST00000487558 FBXL20Q96IG2 436 aa6.49□□□□□ -1.37
CUL3-211ENST00000487558 FAR2Q96K12 515 aa6.49□□□□□ -1.37
CUL3-211ENST00000487558 MECRQ9BV79 373 aa6.49□□□□□ -1.37
CUL3-211ENST00000487558 KCTD5Q9NXV2 234 aa6.49□□□□□ -1.37
CUL3-211ENST00000487558 C11orf21Q9P2W6 132 aa6.49□□□□□ -1.37
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