RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483670.5

PDCD4-208, Transcript of programmed cell death 4, humanhuman

TSL 5

Gene PDCD4, Length 774 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD4-208ENST00000483670 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP26.98■■□□□ 1.91
PDCD4-208ENST00000483670 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP26.97■■□□□ 1.91
PDCD4-208ENST00000483670 TEX33O43247 280 aa26.97■■□□□ 1.91
PDCD4-208ENST00000483670 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP26.97■■□□□ 1.91
PDCD4-208ENST00000483670 GALK1P51570 392 aa26.97■■□□□ 1.91
PDCD4-208ENST00000483670 CDR2Q01850 454 aa26.97■■□□□ 1.91
PDCD4-208ENST00000483670 NNTQ13423 1086 aa26.97■■□□□ 1.91
PDCD4-208ENST00000483670 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP26.97■■□□□ 1.91
PDCD4-208ENST00000483670 WBP2Q969T9 261 aa26.97■■□□□ 1.91
PDCD4-208ENST00000483670 SERPINB11Q96P15 392 aa26.97■■□□□ 1.91
PDCD4-208ENST00000483670 WDR35Q9P2L0 1181 aa26.97■■□□□ 1.91
PDCD4-208ENST00000483670 LATS1O95835 1130 aa26.96■■□□□ 1.91
PDCD4-208ENST00000483670 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP26.96■■□□□ 1.91
PDCD4-208ENST00000483670 RING1Q06587 406 aa26.96■■□□□ 1.91
PDCD4-208ENST00000483670 TCF15Q12870 199 aa26.96■■□□□ 1.91
PDCD4-208ENST00000483670 PPP2R5DQ14738 602 aa26.96■■□□□ 1.91
PDCD4-208ENST00000483670 NR1I3Q14994 352 aa26.96■■□□□ 1.91
PDCD4-208ENST00000483670 ANGPT1Q15389 498 aa26.96■■□□□ 1.91
PDCD4-208ENST00000483670 LRSAM1Q6UWE0 723 aa26.96■■□□□ 1.91
PDCD4-208ENST00000483670 TRIM72Q6ZMU5 477 aa26.96■■□□□ 1.91
PDCD4-208ENST00000483670 MARK1Q9P0L2 795 aa26.96■■□□□ 1.91
PDCD4-208ENST00000483670 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa26.96■■□□□ 1.91
PDCD4-208ENST00000483670 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP26.96■■□□□ 1.91
PDCD4-208ENST00000483670 MYOFQ9NZM1 2061 aa26.95■■□□□ 1.9
PDCD4-208ENST00000483670 LAMTOR5O43504 91 aa26.95■■□□□ 1.9
PDCD4-208ENST00000483670 HSF2BPO75031 334 aa26.95■■□□□ 1.9
PDCD4-208ENST00000483670 HMBSP08397 361 aa26.95■■□□□ 1.9
PDCD4-208ENST00000483670 ZNF445P59923 1031 aa26.95■■□□□ 1.9
PDCD4-208ENST00000483670 FANCCQ00597 558 aa26.95■■□□□ 1.9
PDCD4-208ENST00000483670 ANO4Q32M45 955 aa26.95■■□□□ 1.9
PDCD4-208ENST00000483670 TAF3Q5VWG9 929 aa26.95■■□□□ 1.9
PDCD4-208ENST00000483670 NUGGCQ68CJ6 796 aa26.95■■□□□ 1.9
PDCD4-208ENST00000483670 FSTL4Q6MZW2 842 aa26.95■■□□□ 1.9
PDCD4-208ENST00000483670 UNC45BQ8IWX7 931 aa26.95■■□□□ 1.9
PDCD4-208ENST00000483670 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP26.95■■□□□ 1.9
PDCD4-208ENST00000483670 TSPY26PQ9H489 355 aa26.95■■□□□ 1.9
PDCD4-208ENST00000483670 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa26.95■■□□□ 1.9
PDCD4-208ENST00000483670 FBXO4Q9UKT5 387 aa26.95■■□□□ 1.9
PDCD4-208ENST00000483670 WDFY4Q6ZS81 3184 aa26.94■■□□□ 1.9
PDCD4-208ENST00000483670 KLKB1P03952 638 aa26.94■■□□□ 1.9
PDCD4-208ENST00000483670 FERP16591 822 aa26.94■■□□□ 1.9
PDCD4-208ENST00000483670 SCNN1AP37088 669 aa26.94■■□□□ 1.9
PDCD4-208ENST00000483670 OPRD1P41143 372 aa26.94■■□□□ 1.9
PDCD4-208ENST00000483670 CCR3P51677 355 aa26.94■■□□□ 1.9
PDCD4-208ENST00000483670 GAB4Q2WGN9 574 aa26.94■■□□□ 1.9
PDCD4-208ENST00000483670 PTPN20Q4JDL3 420 aa26.94■■□□□ 1.9
PDCD4-208ENST00000483670 NUDT18Q6ZVK8 323 aa26.94■■□□□ 1.9
PDCD4-208ENST00000483670 ERICH1Q86X53 443 aa26.94■■□□□ 1.9
PDCD4-208ENST00000483670 SPEM1Q8N4L4 309 aa26.94■■□□□ 1.9
PDCD4-208ENST00000483670 C18orf8Q96DM3 657 aa26.94■■□□□ 1.9
PDCD4-208ENST00000483670 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP26.94■■□□□ 1.9
PDCD4-208ENST00000483670 PNKPQ96T60 521 aa26.94■■□□□ 1.9
PDCD4-208ENST00000483670 EDEM3Q9BZQ6 932 aa26.94■■□□□ 1.9
PDCD4-208ENST00000483670 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP26.94■■□□□ 1.9
PDCD4-208ENST00000483670 ATG13O75143 517 aa26.93■■□□□ 1.9
PDCD4-208ENST00000483670 FYNP06241 537 aa26.93■■□□□ 1.9
PDCD4-208ENST00000483670 TPM3P06753 285 aa26.93■■□□□ 1.9
PDCD4-208ENST00000483670 MMEP08473 750 aa26.93■■□□□ 1.9
PDCD4-208ENST00000483670 GABRB2P47870 512 aa26.93■■□□□ 1.9
PDCD4-208ENST00000483670 UBASH3AP57075 661 aa26.93■■□□□ 1.9
PDCD4-208ENST00000483670 SLC6A3Q01959 620 aa26.93■■□□□ 1.9
PDCD4-208ENST00000483670 MTAPQ13126 283 aa26.93■■□□□ 1.9
PDCD4-208ENST00000483670 OR6B2Q6IFH4 312 aa26.93■■□□□ 1.9
PDCD4-208ENST00000483670 OLFML1Q6UWY5 402 aa26.93■■□□□ 1.9
PDCD4-208ENST00000483670 TMEM25Q86YD3 366 aa26.93■■□□□ 1.9
PDCD4-208ENST00000483670 DENND1CQ8IV53 801 aa26.93■■□□□ 1.9
PDCD4-208ENST00000483670 CPXM2Q8N436 756 aa26.93■■□□□ 1.9
PDCD4-208ENST00000483670 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP26.93■■□□□ 1.9
PDCD4-208ENST00000483670 IQCDQ96DY2 449 aa26.93■■□□□ 1.9
PDCD4-208ENST00000483670 NUP58Q9BVL2 599 aa26.93■■□□□ 1.9
PDCD4-208ENST00000483670 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP26.93■■□□□ 1.9
PDCD4-208ENST00000483670 TMEM51Q9NW97 253 aa26.93■■□□□ 1.9
PDCD4-208ENST00000483670 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa26.93■■□□□ 1.9
PDCD4-208ENST00000483670 TLR6Q9Y2C9 796 aa26.93■■□□□ 1.9
PDCD4-208ENST00000483670 CACNA1HO95180 2353 aa26.93■■□□□ 1.9
PDCD4-208ENST00000483670 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa26.92■■□□□ 1.9
PDCD4-208ENST00000483670 IGLV3-27P01718 113 aa26.92■■□□□ 1.9
PDCD4-208ENST00000483670 ERBB2P04626 1255 aa26.92■■□□□ 1.9
PDCD4-208ENST00000483670 TBX4P57082 545 aa26.92■■□□□ 1.9
PDCD4-208ENST00000483670 ZNF528Q3MIS6 628 aa26.92■■□□□ 1.9
PDCD4-208ENST00000483670 FIGNQ5HY92 759 aa26.92■■□□□ 1.9
PDCD4-208ENST00000483670 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa26.92■■□□□ 1.9
PDCD4-208ENST00000483670 SLC26A9Q7LBE3 791 aa26.92■■□□□ 1.9
PDCD4-208ENST00000483670 FAM217AQ8IXS0 508 aa26.92■■□□□ 1.9
PDCD4-208ENST00000483670 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP26.92■■□□□ 1.9
PDCD4-208ENST00000483670 AZIN2Q96A70 460 aa26.92■■□□□ 1.9
PDCD4-208ENST00000483670 BBS2Q9BXC9 721 aa26.92■■□□□ 1.9
PDCD4-208ENST00000483670 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP26.92■■□□□ 1.9
PDCD4-208ENST00000483670 STOML2Q9UJZ1 356 aa26.92■■□□□ 1.9
PDCD4-208ENST00000483670 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa26.91■■□□□ 1.9
PDCD4-208ENST00000483670 EGFP01133 1207 aa26.91■■□□□ 1.9
PDCD4-208ENST00000483670 CYBBP04839 570 aa26.91■■□□□ 1.9
PDCD4-208ENST00000483670 APODP05090 189 aa26.91■■□□□ 1.9
PDCD4-208ENST00000483670 NOMO3P69849 1222 aa26.91■■□□□ 1.9
PDCD4-208ENST00000483670 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa26.91■■□□□ 1.9
PDCD4-208ENST00000483670 SLC2A13Q96QE2 648 aa26.91■■□□□ 1.9
PDCD4-208ENST00000483670 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP26.91■■□□□ 1.9
PDCD4-208ENST00000483670 RRN3Q9NYV6 651 aa26.91■■□□□ 1.9
PDCD4-208ENST00000483670 DEC1Q9P2X7 70 aa26.91■■□□□ 1.9
PDCD4-208ENST00000483670 TJP2Q9UDY2 1190 aa26.91■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.3 ms