RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476502.1

TRBV1-201, Transcript of T cell receptor beta variable 1 (pseudogene), humanhuman

BASIC

Gene TRBV1, Length 284 nt, Biotype TR V pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV1-201ENST00000476502 NRIP3Q9NQ35 241 aa3.61□□□□□ -1.83
TRBV1-201ENST00000476502 TRIM36Q9NQ86 728 aa3.61□□□□□ -1.83
TRBV1-201ENST00000476502 DUSP22Q9NRW4 184 aa3.61□□□□□ -1.83
TRBV1-201ENST00000476502 TM7SF3Q9NS93 570 aa3.61□□□□□ -1.83
TRBV1-201ENST00000476502 SERGEFQ9UGK8 458 aa3.61□□□□□ -1.83
TRBV1-201ENST00000476502 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa3.61□□□□□ -1.83
TRBV1-201ENST00000476502 PTPRKQ15262 1439 aa3.61□□□□□ -1.83
TRBV1-201ENST00000476502 PLA2R1Q13018 1463 aa3.6□□□□□ -1.83
TRBV1-201ENST00000476502 SHANK2Q9UPX8 1470 aa3.6□□□□□ -1.83
TRBV1-201ENST00000476502 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP3.6□□□□□ -1.83
TRBV1-201ENST00000476502 GXYLT2A0PJZ3 443 aa3.6□□□□□ -1.83
TRBV1-201ENST00000476502 AQP12BA6NM10 295 aa3.6□□□□□ -1.83
TRBV1-201ENST00000476502 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
TRBV1-201ENST00000476502 WT1P19544 449 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
TRBV1-201ENST00000476502 RBL1P28749 1068 aa3.6□□□□□ -1.83
TRBV1-201ENST00000476502 EPHA3P29320 983 aa3.6□□□□□ -1.83
TRBV1-201ENST00000476502 ALDH9A1P49189 494 aa3.6□□□□□ -1.83
TRBV1-201ENST00000476502 PNLIPRP1P54315 467 aa3.6□□□□□ -1.83
TRBV1-201ENST00000476502 PROK1P58294 105 aa3.6□□□□□ -1.83
TRBV1-201ENST00000476502 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
TRBV1-201ENST00000476502 ATP1A4Q13733 1029 aa3.6□□□□□ -1.83
TRBV1-201ENST00000476502 CLCA4Q14CN2 919 aa3.6□□□□□ -1.83
TRBV1-201ENST00000476502 ACOX1Q15067 660 aa3.6□□□□□ -1.83
TRBV1-201ENST00000476502 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
TRBV1-201ENST00000476502 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa3.6□□□□□ -1.83
TRBV1-201ENST00000476502 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
TRBV1-201ENST00000476502 GRHL2Q6ISB3 625 aa3.6□□□□□ -1.83
TRBV1-201ENST00000476502 MRNIPQ6NTE8 343 aa3.6□□□□□ -1.83
TRBV1-201ENST00000476502 ZNF551Q7Z340 670 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
TRBV1-201ENST00000476502 KRT73Q86Y46 540 aa3.6□□□□□ -1.83
TRBV1-201ENST00000476502 SPARTQ8N0X7 666 aa3.6□□□□□ -1.83
TRBV1-201ENST00000476502 TXLNBQ8N3L3 684 aa3.6□□□□□ -1.83
TRBV1-201ENST00000476502 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
TRBV1-201ENST00000476502 POF1BQ8WVV4 589 aa3.6□□□□□ -1.83
TRBV1-201ENST00000476502 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
TRBV1-201ENST00000476502 SNX27Q96L92 541 aa3.6□□□□□ -1.83
TRBV1-201ENST00000476502 MACROD1Q9BQ69 325 aa3.6□□□□□ -1.83
TRBV1-201ENST00000476502 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
TRBV1-201ENST00000476502 SLC25A32Q9H2D1 315 aa3.6□□□□□ -1.83
TRBV1-201ENST00000476502 ZBTB26Q9HCK0 441 aa3.6□□□□□ -1.83
TRBV1-201ENST00000476502 IL17RBQ9NRM6 502 aa3.6□□□□□ -1.83
TRBV1-201ENST00000476502 ZSCAN32Q9NX65 697 aa3.6□□□□□ -1.83
TRBV1-201ENST00000476502 ASIC5Q9NY37 505 aa3.6□□□□□ -1.83
TRBV1-201ENST00000476502 SLC39A10Q9ULF5 831 aa3.6□□□□□ -1.83
TRBV1-201ENST00000476502 ASAP1Q9ULH1 1129 aa3.6□□□□□ -1.83
TRBV1-201ENST00000476502 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
TRBV1-201ENST00000476502 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
TRBV1-201ENST00000476502 WNT6Q9Y6F9 365 aa3.6□□□□□ -1.83
TRBV1-201ENST00000476502 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
TRBV1-201ENST00000476502 CPS1P31327 1500 aa3.6□□□□□ -1.83
TRBV1-201ENST00000476502 WDR91A4D1P6 747 aa3.59□□□□□ -1.83
TRBV1-201ENST00000476502 WIPF3A6NGB9 483 aa3.59□□□□□ -1.83
TRBV1-201ENST00000476502 LRRC3CA6NJW4 275 aa3.59□□□□□ -1.83
TRBV1-201ENST00000476502 M0QZQ0 153 aa3.59□□□□□ -1.83
TRBV1-201ENST00000476502 M0R3H8 397 aa3.59□□□□□ -1.83
TRBV1-201ENST00000476502 PODXLO00592 558 aa3.59□□□□□ -1.83
TRBV1-201ENST00000476502 CREB3O43889 395 aa3.59□□□□□ -1.83
TRBV1-201ENST00000476502 PMPCBO75439 489 aa3.59□□□□□ -1.83
TRBV1-201ENST00000476502 NXPH3O95157 252 aa3.59□□□□□ -1.83
TRBV1-201ENST00000476502 ITGA5P08648 1049 aa3.59□□□□□ -1.83
TRBV1-201ENST00000476502 FPR3P25089 353 aa3.59□□□□□ -1.83
TRBV1-201ENST00000476502 GKP32189 559 aa3.59□□□□□ -1.83
TRBV1-201ENST00000476502 PTGER1P34995 402 aa3.59□□□□□ -1.83
TRBV1-201ENST00000476502 GATMP50440 423 aa3.59□□□□□ -1.83
TRBV1-201ENST00000476502 PLCD1P51178 756 aa3.59□□□□□ -1.83
TRBV1-201ENST00000476502 E2F1Q01094 437 aa3.59□□□□□ -1.83
TRBV1-201ENST00000476502 TNFAIP2Q03169 654 aa3.59□□□□□ -1.83
TRBV1-201ENST00000476502 DEUP1Q05D60 604 aa3.59□□□□□ -1.83
TRBV1-201ENST00000476502 FOXF2Q12947 444 aa3.59□□□□□ -1.83
TRBV1-201ENST00000476502 MAPK7Q13164 816 aa3.59□□□□□ -1.83
TRBV1-201ENST00000476502 STK3Q13188 491 aa3.59□□□□□ -1.83
TRBV1-201ENST00000476502 GRM1Q13255 1194 aa3.59□□□□□ -1.83
TRBV1-201ENST00000476502 GPR162Q16538 588 aa3.59□□□□□ -1.83
TRBV1-201ENST00000476502 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
TRBV1-201ENST00000476502 TSTD2Q5T7W7 516 aa3.59□□□□□ -1.83
TRBV1-201ENST00000476502 FAXCQ5TGI0 409 aa3.59□□□□□ -1.83
TRBV1-201ENST00000476502 FAM90A2PQ658T7 463 aa3.59□□□□□ -1.83
TRBV1-201ENST00000476502 MZT2AQ6P582 158 aa3.59□□□□□ -1.83
TRBV1-201ENST00000476502 ANKRD16Q6P6B7 361 aa3.59□□□□□ -1.83
TRBV1-201ENST00000476502 ZNF788Q6ZQV5 615 aa3.59□□□□□ -1.83
TRBV1-201ENST00000476502 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa3.59□□□□□ -1.83
TRBV1-201ENST00000476502 STT3BQ8TCJ2 826 aa3.59□□□□□ -1.83
TRBV1-201ENST00000476502 ZNF566Q969W8 418 aa3.59□□□□□ -1.83
TRBV1-201ENST00000476502 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa3.59□□□□□ -1.83
TRBV1-201ENST00000476502 ARHGEF3Q9NR81 526 aa3.59□□□□□ -1.83
TRBV1-201ENST00000476502 PLCH2O75038 1416 aa3.59□□□□□ -1.84
TRBV1-201ENST00000476502 NPATQ14207 1427 aa3.59□□□□□ -1.84
TRBV1-201ENST00000476502 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa3.58□□□□□ -1.84
TRBV1-201ENST00000476502 LGALS16A8MUM7 142 aa3.58□□□□□ -1.84
TRBV1-201ENST00000476502 A8MVJ9 347 aa3.58□□□□□ -1.84
TRBV1-201ENST00000476502 SYT5O00445 386 aa3.58□□□□□ -1.84
TRBV1-201ENST00000476502 EXOC5O00471 708 aa3.58□□□□□ -1.84
TRBV1-201ENST00000476502 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
TRBV1-201ENST00000476502 NTSR2O95665 410 aa3.58□□□□□ -1.84
TRBV1-201ENST00000476502 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
TRBV1-201ENST00000476502 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
TRBV1-201ENST00000476502 TRAPPC10P48553 1259 aa3.58□□□□□ -1.84
TRBV1-201ENST00000476502 DIO1P49895 249 aa3.58□□□□□ -1.84
TRBV1-201ENST00000476502 SOX10P56693 466 aa3.58□□□□□ -1.84
TRBV1-201ENST00000476502 CYP4F2P78329 520 aa3.58□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.8 ms