RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469307.4

PGAP2-215, Transcript of post-GPI attachment to proteins 2, human

TSL 3

Gene PGAP2, Length 798 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PGAP2-215	ENST00000469307	NELFB	Q8WX92	580 aa		12.95	□□□□□ -0.34
PGAP2-215	ENST00000469307	IRGQ	Q8WZA9	623 aa		12.95	□□□□□ -0.34
PGAP2-215	ENST00000469307	DDX1	Q92499	740 aa	Known RBP	12.95	□□□□□ -0.34
PGAP2-215	ENST00000469307	PLD4	Q96BZ4	506 aa		12.95	□□□□□ -0.34
PGAP2-215	ENST00000469307	NT5C1B	Q96P26	610 aa		12.95	□□□□□ -0.34
PGAP2-215	ENST00000469307	BBS2	Q9BXC9	721 aa		12.95	□□□□□ -0.34
PGAP2-215	ENST00000469307	SLC2A11	Q9BYW1	496 aa		12.95	□□□□□ -0.34
PGAP2-215	ENST00000469307	ARRDC1-AS1	Q9H2J1	176 aa		12.95	□□□□□ -0.34
PGAP2-215	ENST00000469307	POLM	Q9NP87	494 aa	Predicted RBP	12.95	□□□□□ -0.34
PGAP2-215	ENST00000469307	HESX1	Q9UBX0	185 aa		12.95	□□□□□ -0.34
PGAP2-215	ENST00000469307	HBS1L	Q9Y450	684 aa	Known RBP	12.95	□□□□□ -0.34
PGAP2-215	ENST00000469307	CEP295	Q9C0D2	2601 aa		12.94	□□□□□ -0.34
PGAP2-215	ENST00000469307		A0A1W2PQF6	199 aa		12.94	□□□□□ -0.34
PGAP2-215	ENST00000469307	MED19	A0JLT2	244 aa	Predicted RBP	12.94	□□□□□ -0.34
PGAP2-215	ENST00000469307	TULP2	O00295	520 aa		12.94	□□□□□ -0.34
PGAP2-215	ENST00000469307	MDM4	O15151	490 aa		12.94	□□□□□ -0.34
PGAP2-215	ENST00000469307	IRF1	P10914	325 aa		12.94	□□□□□ -0.34
PGAP2-215	ENST00000469307	HOXD12	P35452	270 aa		12.94	□□□□□ -0.34
PGAP2-215	ENST00000469307	TIE1	P35590	1138 aa		12.94	□□□□□ -0.34
PGAP2-215	ENST00000469307	ZNF445	P59923	1031 aa		12.94	□□□□□ -0.34
PGAP2-215	ENST00000469307	KDSR	Q06136	332 aa		12.94	□□□□□ -0.34
PGAP2-215	ENST00000469307	CETN1	Q12798	172 aa		12.94	□□□□□ -0.34
PGAP2-215	ENST00000469307	PAK1	Q13153	545 aa		12.94	□□□□□ -0.34
PGAP2-215	ENST00000469307	BYSL	Q13895	437 aa	Known RBP	12.94	□□□□□ -0.34
PGAP2-215	ENST00000469307	GOLGA7B	Q2TAP0	167 aa		12.94	□□□□□ -0.34
PGAP2-215	ENST00000469307	ANO4	Q32M45	955 aa		12.94	□□□□□ -0.34
PGAP2-215	ENST00000469307	BEND5	Q7L4P6	421 aa		12.94	□□□□□ -0.34
PGAP2-215	ENST00000469307	METTL3	Q86U44	580 aa	Known RBP	12.94	□□□□□ -0.34
PGAP2-215	ENST00000469307	MIB1	Q86YT6	1006 aa		12.94	□□□□□ -0.34
PGAP2-215	ENST00000469307	CCDC33	Q8N5R6	958 aa		12.94	□□□□□ -0.34
PGAP2-215	ENST00000469307	ZNF513	Q8N8E2	541 aa	Predicted RBP	12.94	□□□□□ -0.34
PGAP2-215	ENST00000469307	EHBP1	Q8NDI1	1231 aa		12.94	□□□□□ -0.34
PGAP2-215	ENST00000469307	TFAP2B	Q92481	460 aa		12.94	□□□□□ -0.34
PGAP2-215	ENST00000469307	PIWIL1	Q96J94	861 aa	Known RBP	12.94	□□□□□ -0.34
PGAP2-215	ENST00000469307	HSFY1	Q96LI6	401 aa		12.94	□□□□□ -0.34
PGAP2-215	ENST00000469307	ZSWIM1	Q9BR11	485 aa		12.94	□□□□□ -0.34
PGAP2-215	ENST00000469307	ULBP1	Q9BZM6	244 aa		12.94	□□□□□ -0.34
PGAP2-215	ENST00000469307	DNAJC17	Q9NVM6	304 aa	Known RBP	12.94	□□□□□ -0.34
PGAP2-215	ENST00000469307	MARCH2	Q9P0N8	246 aa		12.94	□□□□□ -0.34
PGAP2-215	ENST00000469307	EVL	Q9UI08	416 aa	Predicted RBP	12.94	□□□□□ -0.34
PGAP2-215	ENST00000469307	WDR3	Q9UNX4	943 aa	Known RBP eCLIP	12.94	□□□□□ -0.34
PGAP2-215	ENST00000469307	CACNA1E	Q15878	2313 aa		12.93	□□□□□ -0.34
PGAP2-215	ENST00000469307	PRRT4	C9JH25	899 aa		12.93	□□□□□ -0.34
PGAP2-215	ENST00000469307	NEDD8-MDP1	E9PL57	170 aa		12.93	□□□□□ -0.34
PGAP2-215	ENST00000469307	RNF225	M0QZC1	329 aa	Predicted RBP	12.93	□□□□□ -0.34
PGAP2-215	ENST00000469307	DCLK1	O15075	740 aa		12.93	□□□□□ -0.34
PGAP2-215	ENST00000469307	TRIM24	O15164	1050 aa		12.93	□□□□□ -0.34
PGAP2-215	ENST00000469307	GABBR2	O75899	941 aa		12.93	□□□□□ -0.34
PGAP2-215	ENST00000469307	IGLV3-27	P01718	113 aa		12.93	□□□□□ -0.34
PGAP2-215	ENST00000469307	DPP6	P42658	865 aa		12.93	□□□□□ -0.34
PGAP2-215	ENST00000469307	DAOA	P59103	153 aa		12.93	□□□□□ -0.34
PGAP2-215	ENST00000469307	UBE2H	P62256	183 aa		12.93	□□□□□ -0.34
PGAP2-215	ENST00000469307	KCNH2	Q12809	1159 aa		12.93	□□□□□ -0.34
PGAP2-215	ENST00000469307	E2F5	Q15329	346 aa		12.93	□□□□□ -0.34
PGAP2-215	ENST00000469307	C10orf76	Q5T2E6	689 aa		12.93	□□□□□ -0.34
PGAP2-215	ENST00000469307	ANO7	Q6IWH7	933 aa		12.93	□□□□□ -0.34
PGAP2-215	ENST00000469307	NAT16	Q8N8M0	369 aa		12.93	□□□□□ -0.34
PGAP2-215	ENST00000469307	STK32A	Q8WU08	396 aa		12.93	□□□□□ -0.34
PGAP2-215	ENST00000469307	AZIN2	Q96A70	460 aa		12.93	□□□□□ -0.34
PGAP2-215	ENST00000469307	ABCC13	Q9NSE7	274 aa		12.93	□□□□□ -0.34
PGAP2-215	ENST00000469307	KIAA1468	Q9P260	1216 aa		12.93	□□□□□ -0.34
PGAP2-215	ENST00000469307	NUDT5	Q9UKK9	219 aa		12.93	□□□□□ -0.34
PGAP2-215	ENST00000469307	AGO1	Q9UL18	857 aa	Known RBP	12.93	□□□□□ -0.34
PGAP2-215	ENST00000469307	STRIP2	Q9ULQ0	834 aa		12.93	□□□□□ -0.34
PGAP2-215	ENST00000469307	NUP205	Q92621	2012 aa		12.93	□□□□□ -0.34
PGAP2-215	ENST00000469307	LOC105378220	A0A1B0GUY1	285 aa	Predicted RBP	12.92	□□□□□ -0.34
PGAP2-215	ENST00000469307	GTPBP10	A4D1E9	387 aa	Known RBP	12.92	□□□□□ -0.34
PGAP2-215	ENST00000469307	YJEFN3	A6XGL0	299 aa		12.92	□□□□□ -0.34
PGAP2-215	ENST00000469307		E7ENQ6	273 aa		12.92	□□□□□ -0.34
PGAP2-215	ENST00000469307	GDF9	O60383	454 aa		12.92	□□□□□ -0.34
PGAP2-215	ENST00000469307	FGFR1OP	O95684	399 aa	Known RBP	12.92	□□□□□ -0.34
PGAP2-215	ENST00000469307	AFP	P02771	609 aa	Known RBP	12.92	□□□□□ -0.34
PGAP2-215	ENST00000469307	PRKCSH	P14314	528 aa	Predicted RBP	12.92	□□□□□ -0.34
PGAP2-215	ENST00000469307	BCKDHB	P21953	392 aa		12.92	□□□□□ -0.34
PGAP2-215	ENST00000469307	CORO1A	P31146	461 aa	Known RBP	12.92	□□□□□ -0.34
PGAP2-215	ENST00000469307	DGKG	P49619	791 aa		12.92	□□□□□ -0.34
PGAP2-215	ENST00000469307	MFAP3	P55082	362 aa		12.92	□□□□□ -0.34
PGAP2-215	ENST00000469307	RING1	Q06587	406 aa		12.92	□□□□□ -0.34
PGAP2-215	ENST00000469307	ADIG	Q0VDE8	80 aa		12.92	□□□□□ -0.34
PGAP2-215	ENST00000469307	EFEMP1	Q12805	493 aa		12.92	□□□□□ -0.34
PGAP2-215	ENST00000469307	NNT	Q13423	1086 aa		12.92	□□□□□ -0.34
PGAP2-215	ENST00000469307	EIF4H	Q15056	248 aa	Known RBP	12.92	□□□□□ -0.34
PGAP2-215	ENST00000469307	SF3A2	Q15428	464 aa	Known RBP	12.92	□□□□□ -0.34
PGAP2-215	ENST00000469307	CCDC40	Q4G0X9	1142 aa		12.92	□□□□□ -0.34
PGAP2-215	ENST00000469307	BSPRY	Q5W0U4	402 aa		12.92	□□□□□ -0.34
PGAP2-215	ENST00000469307	EGFLAM	Q63HQ2	1017 aa		12.92	□□□□□ -0.34
PGAP2-215	ENST00000469307	PMF1	Q6P1K2	205 aa		12.92	□□□□□ -0.34
PGAP2-215	ENST00000469307	TMEM270	Q6UE05	265 aa		12.92	□□□□□ -0.34
PGAP2-215	ENST00000469307	CLEC17A	Q6ZS10	378 aa		12.92	□□□□□ -0.34
PGAP2-215	ENST00000469307	TOGARAM2	Q6ZUX3	1019 aa		12.92	□□□□□ -0.34
PGAP2-215	ENST00000469307	ENOSF1	Q7L5Y1	443 aa		12.92	□□□□□ -0.34
PGAP2-215	ENST00000469307	KIAA0907	Q7Z7F0	614 aa	Predicted RBP	12.92	□□□□□ -0.34
PGAP2-215	ENST00000469307	KAT5	Q92993	513 aa		12.92	□□□□□ -0.34
PGAP2-215	ENST00000469307	SPACA7	Q96KW9	195 aa		12.92	□□□□□ -0.34
PGAP2-215	ENST00000469307	FAM81B	Q96LP2	452 aa		12.92	□□□□□ -0.34
PGAP2-215	ENST00000469307	KREMEN1	Q96MU8	473 aa		12.92	□□□□□ -0.34
PGAP2-215	ENST00000469307	MED15	Q96RN5	788 aa		12.92	□□□□□ -0.34
PGAP2-215	ENST00000469307	TPSD1	Q9BZJ3	242 aa		12.92	□□□□□ -0.34
PGAP2-215	ENST00000469307	LRRC4	Q9HBW1	653 aa		12.92	□□□□□ -0.34
PGAP2-215	ENST00000469307	MBD1	Q9UIS9	605 aa	Predicted RBP	12.92	□□□□□ -0.34

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